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辣椒小G蛋白CaROP的生物信息学分析

新疆农业科学 2024年第1期61卷 165-175页

作者：马思洁朱天生何璐杨叔青塔里木大学农学院新疆阿拉尔843300 南疆农业有害生物综合治理兵团重点实验室新疆阿拉尔843300

【目的】研究辣椒内小G蛋白CaROP的生物学功能、蛋白理化性质、蛋白结构及系统发育关系。【方法】运用ProtParam、ProtScale、SignalP5.0、TMHMM、NetPhos3.1和NetCGlyc1.0等生物信息学软件分析9个CaROP蛋白的蛋白理化特性;运用SOPMA和S... 详细信息

【目的】研究辣椒内小G蛋白CaROP的生物学功能、蛋白理化性质、蛋白结构及系统发育关系。【方法】运用ProtParam、ProtScale、SignalP5.0、TMHMM、NetPhos3.1和NetCGlyc1.0等生物信息学软件分析9个CaROP蛋白的蛋白理化特性;运用SOPMA和SWISS-MODEL等生物信息学软件预测分析9个CaROP蛋白的结构;运用生物信息学软件MEGA11分析9个CaROP蛋白的系统发育关系。【结果】9个CaROP蛋白的亲水性总平均值均小于0,均为亲水蛋白,其中6个为稳定的亲水蛋白;9个CaROP蛋白均无信号肽,即均为非分泌性蛋白;9个CaROP蛋白无跨膜结构域,即均非膜蛋白;9个CaROP蛋白均存在磷酸化位点,均无糖基化位点。9个CaROP蛋白的主要二级结构原件为无规则卷曲和α-螺旋,其次是β-折叠,最后是β-转角。9个CaROP蛋白聚为4个分支,其中分支Ⅰ和分支Ⅲ各包括1个CaROP蛋白。分支Ⅱ包括2个CaROP蛋白,其余5个CaROP蛋白均聚于分支Ⅳ中。【结论】9个CaROP蛋白具有完整的Rho功能域,均为非分泌性亲水蛋白。9个CaROP蛋白在系统进化树中共聚为了4个分支,其三级结构建模的预测结果也均较为理想,9个CaROP蛋白结构较稳定。

关键词：辣椒小G蛋白ROP 蛋白理化特性蛋白结构系统发育关系

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STARD5对胃癌的预后影响及机制研究

中华肿瘤防治杂志 2024年第1期31卷 19-26页

作者：谢蕊西吴歆姝包博文李文诗俞思琦车晓芳中国医科大学附属第一医院肿瘤内科辽宁省肿瘤药物与生物治疗重点实验室沈阳市恶性肿瘤综合治疗临床医学研究中心辽宁沈阳110001

目的采用人类肿瘤基因表达汇编(GEO)及癌症基因组图谱(TCGA)数据分析类固醇敏感性调节蛋白相关脂类转运结构域蛋白5(STARD5)对胃癌预后的影响,通过细胞实验和分子实验验证并探索其相关机制。方法采用GEO胃癌数据集GSE62254及TCGA胃癌数... 详细信息

目的采用人类肿瘤基因表达汇编(GEO)及癌症基因组图谱(TCGA)数据分析类固醇敏感性调节蛋白相关脂类转运结构域蛋白5(STARD5)对胃癌预后的影响,通过细胞实验和分子实验验证并探索其相关机制。方法采用GEO胃癌数据集GSE62254及TCGA胃癌数据集进行单因素和多因素Cox回归分析,筛选STARD家族中的胃癌独立预后因素,并建立基于STARD家族的列线图模型;分析STARD5表达与临床病理特征的关系;使用基因集富集分析(GSEA)预测STARD5影响胃癌预后的相关通路;瞬时沉默STARD5后检测胃癌细胞的迁移、侵袭及黏附能力和胃癌细胞中相关蛋白表达的变化;采用加州大学圣克鲁兹分校(UCSC)gnome browser预测转录因子与靶基因结合位点。生存分析使用Kaplan-Meier和log-rank检验,STARD5与临床病理特征的关系使用χ^(2)检验,组间比较使用Dunnett’s t检验。结果GSE62254及TCGA胃癌数据集均显示STARD5为胃癌的独立保护因素,均P<0.05;纳入STARD5表达与TNM分期所绘制的列线图预测胃癌患者1、3、5年生存率的性能良好,一致性指数及其95%CI为0.701(0.659~0.744);STARD5表达与胃癌肝转移呈负相关,P=0.020。GSEA提示STARD5低表达与Focal adhesion、PI3K/AKT等通路密切相关,均P<0.05。敲减STARD5后,胃癌细胞迁移、侵袭及黏附能力增加,且AKT磷酸化水平升高,Integrinβ1、XBP-1s、ATF4和ATF6α表达上调;经预测XBP-1与ITGB1(Integrinβ1)启动子区域存在6个结合位点。结论STARD5是胃癌的预后保护因素。STARD5在发生肝转移的胃癌患者中表达降低。STARD5下调可通过上调XBP-1来促进Integrinβ1的转录表达并激活PI3K/AKT信号通路,促进胃癌细胞转移。

关键词：胃癌类固醇敏感性调节蛋白相关脂类转运结构域蛋白5 预后转移内质网应激整合素β1

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涂茨镇:农旅融合助力乡村振兴

宁波通讯 2024年第16期 38-40页

作者：毛思洁楼子恒不详

盛夏时节,走进象山县涂茨镇前山姚村龙石果园,一串串葡萄散发着晶莹光泽,前来采摘的游客络绎不绝。据了解,龙石果园盘活近百亩闲置农田,年产值有上百万元,不仅给村集体带来每年7万元的租金收入,还解决村里部分低收入农户的就业问题。这... 详细信息

盛夏时节,走进象山县涂茨镇前山姚村龙石果园,一串串葡萄散发着晶莹光泽,前来采摘的游客络绎不绝。据了解,龙石果园盘活近百亩闲置农田,年产值有上百万元,不仅给村集体带来每年7万元的租金收入,还解决村里部分低收入农户的就业问题。这是涂茨镇在农旅融合方面做出的尝试。

关键词：低收入农户租金收入乡村振兴农旅融合象山县村集体盘活

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中拐凸起南斜坡八道湾组油层低阻成因及识别

新疆石油地质 2024年第5期45卷 541-551页

作者：李枫凌方鑫鑫张镇马思洁刘荣军中国石油新疆油田分公司油田技术服务分公司新疆克拉玛依834000 中国石油新疆油田分公司红山油田有限责任公司新疆克拉玛依834000 中国石油新疆油田分公司重油开发公司新疆克拉玛依834000 中国石油新疆油田分公司勘探开发研究院新疆克拉玛依834000 衢州学院建筑工程学院浙江衢州324000

准噶尔盆地中拐凸起南斜坡下侏罗统八道湾组低阻油层与一般低阻油层对比,储集层具有形成时期早、埋藏深度大、岩石粒度较大、泥质含量低等特点,低阻成因具有较强特殊性。在对国内外典型低阻油层成因机理综合研究的基础上,利用该区钻井... 详细信息

准噶尔盆地中拐凸起南斜坡下侏罗统八道湾组低阻油层与一般低阻油层对比,储集层具有形成时期早、埋藏深度大、岩石粒度较大、泥质含量低等特点,低阻成因具有较强特殊性。在对国内外典型低阻油层成因机理综合研究的基础上,利用该区钻井、录井、测井、试井、岩心化验分析等资料,从构造、沉积、成岩作用、储集层特征、成藏条件等多角度,开展八道湾组油藏低阻主控因素研究。该区油藏低阻的形成受宏观因素和微观因素共同控制,低构造幅度、弱水动力沉积等宏观背景下,低油水分异程度、高地层水矿化度及低凝灰岩岩屑含量,是油藏低阻的主控因素;束缚水饱和度偏低,是油藏低阻的次要控制因素。在此基础上,建立地层电阻率与油气指示系数关系图版,与该区试油和试采资料对比,符合率92.9%,为中拐凸起南斜坡八道湾组低阻油层的识别提供了依据。

关键词：准噶尔盆地中拐凸起八道湾组低阻油层成因机理主控因素油层识别

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人才与城市双向成就一起来看他们的故事

宁波通讯 2024年第9期 25-27页

作者：毛思洁崔宁谢斌

市委“新春第一会”,吹响“创新实干奋进年”的号角,号召全市上下一体建强高素质干部队伍、高水平创新型人才和企业家队伍、高素养劳动者队伍,在中国式现代化新征程上勇扛使命、勇挑大梁、勇立潮头。时代呼唤创新者,成功青睐实干者,荣... 详细信息

市委“新春第一会”,吹响“创新实干奋进年”的号角,号召全市上下一体建强高素质干部队伍、高水平创新型人才和企业家队伍、高素养劳动者队伍,在中国式现代化新征程上勇扛使命、勇挑大梁、勇立潮头。时代呼唤创新者,成功青睐实干者,荣光归于奋进者。全市各类人才在勇当先行者、谱写新篇章中各尽其才、大显身手、奋发进取、竞相奔腾,为宁波奋力争创共同富裕和中国式现代化示范引领的市域样板持续积蓄澎湃动力。本刊刊发“三支队伍”中的代表人物,讲述他们与宁波相遇、在宁波成长的故事。

关键词：企业家队伍中国式现代化上下一体创新者创新型人才示范引领三支队伍奋发进取

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哈密顿量宇称-时间对称性的刻画

物理学报 2024年第4期73卷 27-36页

作者：张慧洁贺衎太原理工大学数学学院太原030024

宇称-时间(PT)对称性理论描述了具有实能级的非厄密特哈密顿量,在量子物理学和量子信息科学中起着重要作用,是量子力学中活跃且重要的主题.研究者们对如何描述哈密顿量的PT对称性的问题给予了高度关注.本文基于PT对称理论和哈密顿量归... 详细信息

宇称-时间(PT)对称性理论描述了具有实能级的非厄密特哈密顿量,在量子物理学和量子信息科学中起着重要作用,是量子力学中活跃且重要的主题.研究者们对如何描述哈密顿量的PT对称性的问题给予了高度关注.本文基于PT对称理论和哈密顿量归一化特征函数,提出了算子F的定义.然后,在找到算子CPT和算子F的对易子和反对易子的特性后,给出了刻画了无量纲情况下哈密顿量的PT对称性的第一种方法.进一步研究发现,该方法还可以量化哈密顿量在无量纲情况下的PT对称性.此外,提出了另一种基于哈密顿量特征值实部和虚部来描述哈密顿量PT对称性的方法,该方法仅用于判断哈密顿量是否具有PT对称性.

关键词：哈密顿量 PT对称性对易子归一化特征函数

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我心中的海

快乐语文 2024年第1期 82-83页

作者：雷思婷林宇洁(指导) 福建省龙岩市实验学校不详

小时候,我跟着爸爸妈妈来到厦门,第一次见到了波澜壮阔的大海。当时,我就被大海的美给深深震撼了早晨的海,清幽静谧。在海边散步,海风吹过脸颊,轻轻的、柔柔的,像一双温柔的手抚摸着你。红日从海平线慢慢上升,天边的红霞越来越多、越来... 详细信息

小时候,我跟着爸爸妈妈来到厦门,第一次见到了波澜壮阔的大海。当时,我就被大海的美给深深震撼了早晨的海,清幽静谧。在海边散步,海风吹过脸颊,轻轻的、柔柔的,像一双温柔的手抚摸着你。红日从海平线慢慢上升,天边的红霞越来越多、越来越美,出海航行的帆船从大到小,从近到远,它们和我一样,开启了新的一天。

关键词：红霞清幽大海

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俺帮芦花鸡当妈妈

艺术界 2024年第5期 29-34页

作者：邢思洁孔雀绿(绘) 不详

一“哎哟,他大婢子,你说我是造了啥孽,几只鸡不是蛋,就是闹窝。”“他二大娘,不就是少得几个鸡蛋嘛,对你来说算啥?你呀,就是不知足,咱庄谁家有你家过得好?”我放学回到家,还没有进院,就听到娘与二大娘在说话。

关键词：芦花鸡鸡蛋妈妈

基于表面等离子体共振的外泌体PD-L1蛋白检测技术

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中国生物化学与分子生物学报 2024年第9期40卷 1300-1307页

作者：屈丽思彭宇彦俞泽涛叶子弘夏文强中国计量大学生命科学学院浙江省生物计量及检验检疫技术重点实验室杭州310018 浙江大学农业与生物技术学院现代种业研究所杭州310058

血清中可溶性程序性死亡-配体1(programmed cell death 1 ligand 1,PD-L1)蛋白的存在形式包括外泌体表面、微囊泡表面以及分泌的游离形式等。前期研究表明,血清中外泌体表面PD-L1含量与多种癌症的预后评估显著相关,然而目前的常规检测... 详细信息

血清中可溶性程序性死亡-配体1(programmed cell death 1 ligand 1,PD-L1)蛋白的存在形式包括外泌体表面、微囊泡表面以及分泌的游离形式等。前期研究表明,血清中外泌体表面PD-L1含量与多种癌症的预后评估显著相关,然而目前的常规检测方法通常将血清中所有可溶性PD-L1蛋白作为一个整体进行检测,无法有效分辨外泌体PD-L1与其他形式的PD-L1。本研究基于表面等离子体共振技术,建立了一种外泌体PD-L1的特异性检测方法。该方法首先通过抗体识别PD-L1蛋白,并将其捕获至检测芯片表面;再利用α-溶血素在外泌体膜上形成多个寡聚体,从而特异性检测外泌体PD-L1。该方法通过α-溶血素结合过程的信号变化对外泌体PD-L1含量进行检测,可以有效降低检测背景噪音并放大信号。使用α-溶血素放大信号前的线性范围为0.035~2.208 pg/mL,信号放大后的线性范围为0.004-0.552 pg/mL。方法学验证实验表明,该方法特异性、灵敏度和精密度良好,具有一定的临床应用前景。

关键词：外泌体程序性死亡-配体1 α-溶血素生物标志物

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