检索结果-南通市图书馆

生物医学领域基于知识图谱的知识发现方法综述

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医学信息学杂志 2024年第1期45卷 45-51页

作者：梅佳月孙佳侯跃芳中国医科大学健康管理学院沈阳110122

目的/意义综述生物医学领域基于知识图谱的知识发现方法,为科研人员提供参考。方法/过程通过系统检索及阅读分析相关文献,总结基于知识图谱的知识发现方法,对比各类知识发现方法的优势和不足;指出现阶段生物医学领域基于知识图谱的知识... 详细信息

目的/意义综述生物医学领域基于知识图谱的知识发现方法,为科研人员提供参考。方法/过程通过系统检索及阅读分析相关文献,总结基于知识图谱的知识发现方法,对比各类知识发现方法的优势和不足;指出现阶段生物医学领域基于知识图谱的知识发现方法的局限性和挑战,并提出建议和展望。结果/结论未来研究应提升知识发现结果的可解释性,构建有效的结果评估框架,建立规范化、多领域专家协同的知识发现流程,提高知识发现研究的质量和效率。

关键词：生物医学知识图谱知识发现

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辽宁省糖尿病防治热点及趋势分析

中国卫生统计 2023年第6期40卷 914-916,920页

作者：谢志恒侯跃芳吕阳于连政刘红波中国医科大学公共卫生学院卫生学院卫生统计教研室 110122 中国医科大学健康管理学院北部战区空军医院老年病科辽宁省疾病预防控制中心慢病所

目的探索辽宁省糖尿病防治的研究热点和趋势,为辽宁省糖尿病防治策略的构建提供有效、合理的决策支持。方法检索中国知网数据库近20年(2002.1.1-2021.12.31)辽宁省糖尿病防治的相关文献,运用CiteSpace软件绘制辽宁省糖尿病防治知识图谱... 详细信息

目的探索辽宁省糖尿病防治的研究热点和趋势,为辽宁省糖尿病防治策略的构建提供有效、合理的决策支持。方法检索中国知网数据库近20年(2002.1.1-2021.12.31)辽宁省糖尿病防治的相关文献,运用CiteSpace软件绘制辽宁省糖尿病防治知识图谱,结合关键词分析、聚类及突现词等分析深度挖掘辽宁糖尿病防治的研究热点和趋势。结果将筛选后文献进行关键词共线图谱分析可得192个关键节点和323条连线,聚类分析形成8个有效聚类,健康教育和综合干预指导社区管理为辽宁省糖尿病防治的热点主题和研究前沿。结论综合指导干预社区管理糖尿病及其并发症的健康教育依旧是辽宁省糖尿病防治领域重点关注的方向,糖尿病社区管理和健康教育受到学者重视并有望在加强患者自我管理控制血糖、提升生活质量方面发挥更大的作用。

关键词：糖尿病防治辽宁省知识图谱热点

中国实用眼科杂志2010年第28卷主题词索引

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中国实用眼科杂志 2010年第12期28卷 1385-1410页

作者：侯跃芳中国医科大学医学信息学系

中国实用眼科杂志2010年第28卷第一作者索引

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中国实用眼科杂志 2010年第12期28卷 1411-1418页

作者：侯跃芳中国医科大学医学信息学系

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美国《生物学文摘》光盘检索系统

情报理论与实践 1999年第6期22卷 451-452页

作者：侯跃芳魏良中国医科大学医学信息系辽宁110001

The search fields and strategies of Biological Abstracts on Compact Disc that are different from MEDLINE are *** search fields such as Biosystematic Codes,Concept Codes and Super Taxa are emphasized.

关键词：生物学文摘光盘检索系统美国情报检索

基于医学主题词标引规则的词共现聚类分析结果自动判读和表达的研究

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数据分析与知识发现 2020年第9期4卷 133-144页

作者：邬金鸣侯跃芳崔雷中国医学科学院/北京协和医学院医学信息研究所/图书馆北京100020 中国医科大学医学信息学院沈阳110122

【目的】探索一种易于用户理解的规范化、自动化聚类结果判读和表达方式,促进主题词共现聚类的发展。【方法】以肿瘤诊断主题为例,参考标引教材梳理相关的主题词/副主题词标引规则,选取10组肿瘤为训练集进行高频主题词共现聚类分析,人... 详细信息

【目的】探索一种易于用户理解的规范化、自动化聚类结果判读和表达方式,促进主题词共现聚类的发展。【方法】以肿瘤诊断主题为例,参考标引教材梳理相关的主题词/副主题词标引规则,选取10组肿瘤为训练集进行高频主题词共现聚类分析,人工审读聚类结果,结合标引规则,梳理高频主题词语义类型/副主题词组合规则。基于规则编写Python程序,自动解读验证集中4组肿瘤的聚类结果,并请专家对其揭示类团内容的准确性、全面性、实用性、易理解性和简洁性进行评价。【结果】整理标引规则30条,梳理面向主题词共现聚类结果解读的语义类型/副主题词组合规则98条。验证集的5个评价指标(准确性、全面性、实用性、易理解性和简洁性)分值分别为4.282、4.435、4.209、4.457、4.206(满分5分)。【局限】探索语义类型/副主题词组合规则时,研究结果与每次聚类过程中高频阈值的选择、聚类结果数的确定均有关联。利用组合规则解读类团内容难以揭示类团"隐藏信息"。【结论】基于规则自动解读主题词共现聚类分析结果具有较强适用性,在一定程度上促进了主题词共现聚类分析结果表达的客观化与规范化。

关键词：共词分析聚类分析类团描述知识表达自动解读

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国家自然科学基金项目的文献计量学研究

国家自然科学基金项目的文献计量学研究

作者：侯跃芳中国医科大学

学位级别：硕士

目的为了对国家自然科学基金项目的实施效果及其评估体系进行评价，选取生命科学基金中胃癌专题研究项目，运用文献计量学方法，考察项目组发表论文在国内相关研究中的比重，比较项目组在科研项目立项前后论文数及其学科影响的差别，... 详细信息

目的为了对国家自然科学基金项目的实施效果及其评估体系进行评价，选取生命科学基金中胃癌专题研究项目，运用文献计量学方法，考察项目组发表论文在国内相关研究中的比重，比较项目组在科研项目立项前后论文数及其学科影响的差别，以此评判国家自然科学基金项目同行评议体系的实施效果，为其评估体系的进一步改进和完善提供依据和参考。方法 (1)选择研究对象：考察“胃癌”专题项目。从1990年-2001年国家自然科学基金生命科学项目中，选择项目名称含有“胃癌”的51项自由申请项目，1项重点项目作为考察对象，合计52项。(2)数据收集：应用中国生物医学文献数据库(CBM)、美国医学文献分析与检索系统数据库(MEDLINE)、科学引文索引数据库(SCI)检索1985年-2003年我国发表的胃癌方面文献、各项目相关文献及项目组成员发表的项目相关论文。应用SCI数据库、中国科学引文索引数据库(CSCD)检索项目组论文被引用情况，检索论文被MEDLINE、SCI、CSCD、中国科技论文统计与引文分析数据库(CSTPC)的收录情况。(3)数据的统计分析：在检出的胃癌相关文献中，统计分析项目组作者出现频次在总体作者频次中的比重，项目组所属机构发文数占论文总数的比例，项目组论文数占相关文献的比例，项目组立项前后各个阶段(立项前、立项后1-3年、立项后4-6年、立项后7年以上)的论文数。应用“科研人员科研业绩评估系统”，从论文发表得分、论文被引用得分、论文被检索工具收录得分三方面综合计算项目组立项前后各个阶段的论文得分，比较项目组不同阶段论文得分的差异，进行统计学检验。结果在前42名高频作者中，项目组作者群出现频次占78.61％。项目组作者群出现总频次占全国作者的18.79%。高产权:与发表的论文中，项目组所属机构论文数占70.58%，论文数排名前7位的机构均为项目组所属机构。项目组所属机构总论文数占全国的20.99%。项目组论文数随年度变化有普遍增长趋势，各项目组论文数在相关文献中的比重高低不平衡，平均比例为25.65%。项目获得后1一3年、后4一6年及获得后7年以上的论文数普遍多于项目获得前。项目获得后所有年、后1一6年、后1一3年、后4-6年论文得分均明显高于获得项目前，即论文的产出和影响力有明显增加。结论经文献计量学研究发现，项目组作者群出现频次及项目组所属机构论文数在全国的比重较高，项目获得后的资助期、资助结束后近期的论文产出和影响力均比项目获得前有明显提高，国家自然科学基金项目的同行评议有力促进了项目研究成果的数量和水平，其评估体系的实施效果较好。本课题的创新点在于:国内首次从专题角度对国家自然科学基金项目的同行评议效果进行评价;分年度阶段对项目进行文献计量学评价;率先将以期刊影响因子为依托的论文得分评价体系应用于国家基金项目的文献计量学评价;时间跨度大，保证了研究结果的充分性、可靠性。

关键词：文献计量学国家自然科学基金项目评价同行评议

MTH1小分子抑制剂诱发癌细胞DNA损伤反应并抑制癌细胞存活的研究

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MTH1小分子抑制剂诱发癌细胞DNA损伤反应并抑制癌细胞存活的研究

作者：侯跃芳吉林大学

学位级别：硕士

活性氧(Reactive Oxygen Species,ROS)是保证生命活动得以正常进行的一类极其重要的分子。然而,过量的ROS会导致细胞内生物大分子例如核酸分子被氧化,从而对细胞产生极为不利的影响。在细胞中,核苷酸池中的游离核苷酸尤其是三磷酸鸟苷酸... 详细信息

活性氧(Reactive Oxygen Species,ROS)是保证生命活动得以正常进行的一类极其重要的分子。然而,过量的ROS会导致细胞内生物大分子例如核酸分子被氧化,从而对细胞产生极为不利的影响。在细胞中,核苷酸池中的游离核苷酸尤其是三磷酸鸟苷酸(dGTP)比DNA更容易受到ROS的影响而发生氧化损伤。被氧化的三磷酸鸟嘌呤核苷酸(8-oxo-dGTP)等掺入到DNA中会导致错配、突变甚至细胞死亡。MTH1(MutT homology 1)作为一种焦磷酸酶,能够高效降解核苷酸池中被氧化的游离核苷酸如8-oxo-dGTP等,从而减轻高水平ROS对增殖细胞带来的致命损伤。有研究显示,肿瘤细胞由于生长和代谢异于正常细胞,导致其ROS水平显著高于正常细胞,从而使其更加依赖于MTH1的保护作用。既然MTH1对癌细胞的生存具有举足轻重的地位,那么抑制MTH1的活性对癌细胞而言将是一个沉重的打击。因此,研发新型、高效的MTH1抑制剂为癌症的治疗提供了新的策略。在前期研究中,我们实验室合成并筛选到一批潜在的新型MTH1抑制剂。在酶学水平上,我们已经证明这些小分子化合物均具有极强的MTH1抑制活性。但是,它们是否能在细胞内与MTH1蛋白结合并抑制其活性,进而对癌细胞造成致命打击尚有待研究。在此前提下,本次研究深入探究了这些潜在的新型MTH1抑制剂对癌细胞内MTH1活性以及细胞增殖的影响。首先,我们利用细胞热位移测定试验(Cellular Thermal Shift Assay,CETSA)检测了小分子化合物与靶标蛋白MTH1的结合效率。CETSA结果显示,前期实验筛选到的潜在新型MTH1抑制剂均在一定程度上与细胞内的MTH1蛋白紧密结合。其次,我们进一步探究了与细胞内MTH1结合较强的两个化合物C72-125和501513对细胞中MTH1活性的影响。我们提出假设:如果C72-125和501513能够抑制MCF-7乳腺癌细胞中MTH1的活性,那么MCF-7细胞的核苷酸池中的游离8-oxo-dGTP就无法得到有效地清除,因此就会有更多的8-oxo-dGTP掺入到DNA中,从而导致细胞中氧化鸟嘌呤核苷(8-oxo-G)的含量升高。8-oxo-G免疫荧光染色显示,14μM的C72-125和1.6μM的501513处理6小时后,MCF-7乳腺癌细胞中8-oxo-G的含量显著升高。8-oxo-G流式细胞术显示出同样的结果。再次,掺入到DNA中的8-oxo-G通常会被碱基切除修复(Base Excision Repair,BER)通路识别并修复,而该过程会导致DNA单链断裂,甚至会造成DNA双链断裂。于是,我们猜想,既然C72-125和501513处理后细胞中8-oxo-G的含量显著升高,那么C72-125和501513处理后细胞中DNA断裂的水平应该也会升高。碱性彗星实验结果表明,7μM或14μM的C72-125和0.8μM或1.6μM的501513处理24小时后MCF-7乳腺癌细胞的尾矩显著增加,说明C72-125和501513处理后MCF-7乳腺癌细胞中DNA断裂显著增加。此外,C72-125和501513处理6小时后的53BP1免疫荧光染色显示,药物处理后53BP1染色灶(foci)阳性的MCF-7乳腺癌细胞的比例显著增加,这同样揭示了C72-125和501513引起MCF-7乳腺癌细胞中产生大量DNA损伤。最后,我们检测了C72-125和501513对癌细胞生存的影响。MTT和集落形成实验结果表明,C72-125和501513会抑制MCF-7细胞的增殖,并且药物浓度越高对细胞增殖的抑制越明显,药物的浓度与其对细胞增殖的抑制作用呈现剂量依赖的关系。MTT数据分析表明,当C72-125处理MCF-7细胞24小时时,IC为47.22μM;当C72-125处理MCF-7细胞48小时时,IC为14.33μM;当C72-125处理MCF-7细胞72小时时,IC为8.314μM。MTT数据还显示,当501513处理MCF-7细胞24小时时,IC为13.06μM;当501513处理MCF-7细胞48小时时,IC为1.58μM;当501513处理MCF-7细胞72小时时,IC为1.239μM。此外,MTT实验结果还表明,C72-125和501513对正常细胞的毒性显著低于其对MCF-7乳腺癌细胞的毒性。细胞周期检测结果显示,用7μM的C72-125处理MCF-7细胞24小时后,细胞周期被阻滞在G/M期;用1.6μM的501513处理MCF-7细胞24小时后,细胞周期被阻滞在G期。细胞凋亡检测结果显示,C72-125和501513处理后凋亡细胞所占比例明显增加,说明C72-125和501513诱导MCF-7细胞发生凋亡。综上所述,前期实验筛选到的潜在新型MTH1抑

关键词：活性氧 MTH1 小分子抑制剂肿瘤

应用引文共引聚类-内容词分析法对学科发展的研究

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情报学报 2007年第2期26卷 309-314页

作者：侯跃芳崔雷吴迪中国医科大学信息管理与信息系统（医学）系沈阳110001

将引文共引聚类与内容词分析法相结合揭示专题发展，通过引文共引聚类描述妊娠糖尿病专题研究的发展历史，通过高频引文的重要来源文献的内容词分析描述该专题研究现状，同时计算来源文献类内相似度、关联度及类间差异度，验证引文共引... 详细信息

将引文共引聚类与内容词分析法相结合揭示专题发展，通过引文共引聚类描述妊娠糖尿病专题研究的发展历史，通过高频引文的重要来源文献的内容词分析描述该专题研究现状，同时计算来源文献类内相似度、关联度及类间差异度，验证引文共引聚类的效果。

关键词：引文共引聚类分析内容词分析学科发展妊娠糖尿病