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整合分析RNA-seq数据鉴定猪骨骼肌生长发育相关lncRNAs

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整合分析RNA-seq数据鉴定猪骨骼肌生长发育相关lncRNAs

作者：余小飞中国农业科学院

学位级别：硕士

长链非编码RNA(lncRNA,long non-coding RNA)是一类转录本长度大于200 bp,且被认为具有较小蛋白编码潜能的RNA,它可以通过参与染色质的修饰、X染色体沉默以及基因组印记、转录干扰、转录激活和核内运输等多个重要过程发挥生物学功能。随... 详细信息

长链非编码RNA(lncRNA,long non-coding RNA)是一类转录本长度大于200 bp,且被认为具有较小蛋白编码潜能的RNA,它可以通过参与染色质的修饰、X染色体沉默以及基因组印记、转录干扰、转录激活和核内运输等多个重要过程发挥生物学功能。随着ENCODE计划的启动,以及受到人、小鼠等模式生物lncRNAs相关研究的启发,猪的非编码RNA研究已逐渐起步。在另一方面,骨骼肌生长发育为一个复杂的过程,中国地方脂肪型猪和外国瘦肉型猪在产量性状上存在巨大差异,为猪骨骼肌生长发育的分子机制研究提供了良好的素材。本研究整合了NCBI的SRA数据库下载的数据和实验室已测序的转录组的高通量数据,包涵骨骼肌、脂肪等12种组织,651个生物学样本,19个生物学项目,共1.3 TB数据量。因数据库中测序方法的影响,在这里只关注lincRNA(long intergenic non-coding RNA),对所有的样品进行linc RNA系统鉴定、lincRNA特征分析、组织特异性分析、并挖掘与骨骼肌生长发育相关的linc RNA。研究结果如下:(1)基于搭建的lincRNA鉴定流程,共得到12,564条候选lincRNA。(2)基因组特征分析显示,lincRNA在1、6和13号染色体上分布数量相对较多,分别为1196、822和908条,而其它染色体的数目分布较为均匀,这些结果表明lincRNA具有一定的染色体倾向性。linc RNA的平均长度为1380 bp,其中长度为201000 bp的lincRNA占比57%,长度为1000000bp的占比19%。蛋白编码基因的转录本长度为2800 bp。lincRNA的平均外显子分布为3.2个,而蛋白编码基因的平均外显子数为8.7个。将鉴定的lincRNA与之前相关研究比较,发现与NONCODE数据库中211条序列同源,与ALDB数据库中1538条同源。(3)在卵巢中具有最多特异表达的lincRNA(537条,占所有特异表达lincRNA的32.14%),在肾脏、肺、子宫、脾脏、血液、肝脏、耳组织、心脏、肌肉、脑和脂肪组织中特异表达的lincRNA分别为179、136、128、124、123、114、90、74、58、56和52条。在这些组织特异表达的lincRNA中,我们还找到了与其功能相关的候选lincRNA。且lincRNA表达模式相对于蛋白编码基因具有更强的组织特异性。(4)将骨骼肌样品27个发育时间点,分为胚胎早期(E33-E65)、胎儿期(E70-E105)、新生期(D0-D60)和成熟期(D80-D180)等四个发育阶段。不同发育阶段lincRNA的差异表达结果显示:胎儿期与新生期显著差异表达的lincRNA数量最多,共计409条。功能富集分析表明,在骨骼肌多个生长发育阶段都差异表达的lincRNA主要与胚胎的发育、肌细胞代谢和生长因子受体的结合有关,包括LincCONS0326005、LincCONS0326798和LincCONS0323540等179条。综上所述,本研究首次在猪上整合当前已有数据库的RNA-seq,鉴定并分析lincRNA的特征、组织功能相关的lincRNA,并挖掘在骨骼肌生长发育中发挥重要调控的lincRNA,为猪的分子育种提供候选标记。

关键词：猪 lincRNA 整合分析骨骼肌生长发育

Android手机恶意彩信拦截系统的设计和实现

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Android手机恶意彩信拦截系统的设计和实现

作者：余小飞天津大学

学位级别：硕士

随着移动通信技术的快速发展，智能手机已逐渐普及，Android已成为第一大智能手机操作系统。彩信业务迅速发展，在智能手机用户中得到了全面推广，而很多不法分子利用彩信传播手机恶意软件，严重威胁用户的隐私、财产安全。本文发... 详细信息

随着移动通信技术的快速发展，智能手机已逐渐普及，Android已成为第一大智能手机操作系统。彩信业务迅速发展，在智能手机用户中得到了全面推广，而很多不法分子利用彩信传播手机恶意软件，严重威胁用户的隐私、财产安全。本文发现了一种利用彩信的攻击方式，并针对这种攻击方式设计和实现了Android手机恶意彩信拦截系统。在彩信攻击方式中，恶意软件通过彩信附件传播。受害者的手机接收到恶意彩信后，附件中的恶意软件保存到手机彩信数据库中，继而可以利用静默安装的方式在后台安装，从而威胁用户手机安全。针对这种攻击方式，设计和实现了Android手机恶意彩信拦截系统。该拦截系统采用了两种恶意彩信拦截机制，分别是基于彩信附件格式拦截和基于彩信附件内容拦截。恶意彩信拦截系统拥有获取彩信有序广播的最高优先级的，能够最先获取彩信信息，并自动分析彩信附件的格式和附件内容，判定彩信是否具有恶意性，继而进行相应的拦截操作。 Android手机恶意彩信拦截系统在拦截恶意彩信方面起到了很好的效果，能够及时拦截掉通过彩信传播的手机恶意软件，中断了攻击者利用彩信方式的攻击途径，很好的保障了用户手机安全。

关键词： Android系统恶意软件彩信传播恶意彩信拦截

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一体化结核检测微流控系统研究与实现

一体化结核检测微流控系统研究与实现

作者：余小飞北京化工大学

学位级别：硕士

结核病是由结核分枝杆菌感染引起的一种慢性传染病,活动性肺结核患者具有较强的传染性,潜伏性结核患者也有一定概率发展为活动性结核患者,所以结核病的检测与防治具有重要的实际意义。传统结核检测方法,无论是检测适用范围,还是在操作... 详细信息

结核病是由结核分枝杆菌感染引起的一种慢性传染病,活动性肺结核患者具有较强的传染性,潜伏性结核患者也有一定概率发展为活动性结核患者,所以结核病的检测与防治具有重要的实际意义。传统结核检测方法,无论是检测适用范围,还是在操作复杂度,都还有显著的提升改进空间。近些年来,新兴的IGRA结核检测方法通过其独特的技术优势,借助体外诊断方式,能够实现结核的高灵敏度检测,且显著减小了检测时间,有利于提升结核检测防控水平。为了实现高灵敏度检测,IGRA结核检测方法中,需要对原始样品进行长时间培养,然后通过对样品进行预处理、稀释、反应、检测等一系列操作来实现完整的检测过程,因此,整个检测过程步骤繁琐,手工操作复杂,检测过程效率偏低。作为一种生物反应过程的整合平台,微流控芯片具有集成化及微型化的特点,尤其是,借助其内部的流体网络结构,可以将多步生化反应过程相互集成,通过流水线式反应模式,实现检测过程的自动化乃至智能化。因此,结合微流控技术与IGRA结核检测技术,通过微流控系统实现IGRA结核检测的集成化与自动化,对提高结核病的检测水平具有重要的实际作用。本文研究了基于微流控芯片的一体化结核检测系统。首先,基于IGRA检测方法,研究设计了多通道侧向流纸条荧光检测模块,对反应后的侧向流纸条进行荧光检测;然后研究设计实现了一种结核检测微流控芯片,将结核检测中多个反应步骤,包括:全血培养、红细胞滤除、样品稀释及层析反应等都集成到微流控芯片中,实现了结核检测的自动化。针对结核检测微流控芯片,研究设计了配套检测仪器,构建了完整的一体化、集成化结核检测装置。研究实现了结核检测系统的结构、软硬件及光电检测设计,构建了便携式检测装置。该便携式结核检测装置能够在加入原始检测样品后,无需手工操作,按照既定流程,自动完成结核检测流程,显著提升了 IGRA结核检测的整体水平。通过实际样本测试验证了一体化结核检测微流控系统的整体性能与技术可行性,为进一步提升结核检测水平打下了坚实基础。

关键词：结核检测 IGRA 微流控芯片侧向流纸条荧光检测

基于Ni Vision的汽车油管表面缺陷在线检测研究

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基于Ni Vision的汽车油管表面缺陷在线检测研究

作者：余小飞江汉大学

学位级别：硕士

当前,在汽车生产制造业中,汽车油管生产的主要类型有表面镀锌涂PVF系列和表面镀锌涂PA12系列的双层管,它们广泛应用在汽车的传动系统之中。尽管该类型油管的生产加工技术已经相对成熟,但是在实际加工过程中,由于加工设备和生产环境的影... 详细信息

当前,在汽车生产制造业中,汽车油管生产的主要类型有表面镀锌涂PVF系列和表面镀锌涂PA12系列的双层管,它们广泛应用在汽车的传动系统之中。尽管该类型油管的生产加工技术已经相对成熟,但是在实际加工过程中,由于加工设备和生产环境的影响,还是会导致部分油管存在表面缺陷的问题,并且其缺陷问题往往会对人身财产安全造成严重的威胁。考虑到上述问题,本文在分析汽车油管在实际生产加工过程中缺陷的特点及其规律性后,结合工厂实际流水线的生产特点,提出了系统的设计方案,并做了以下研究:1.针对汽车油管表面缺陷的特征和缺陷的规律进行系统的分析和总结,对机器视觉技术于检测汽车油管表面缺陷的应用进行研究。2.针对油管在流水线中快速运动的特点以及需要对油管进行实时检测这一技术要求,采用四个面阵工业相机同一轴面安装的方式,有效解决了检测系统图像采集的问题。同时针对不同管径的油管表面缺陷的在线检测,进行图像处理前的技术研究,利用边缘提取、中心点提取等算法识别图像中的油管部分,根据提取的中心点进行ROI划分、仿射变换,图像分割等算法提取油管样本图像,有效提高图像处理、分析效率。通过动态试验对比对油管表面缺陷图像的增强、滤波、小波变换等图像处理算法进行筛选,从而有效改善图像质量,提升检测可靠性。最后通过分析得出的油管表面缺陷的特点,结合油管产生缺陷的实际情况以及运动特点,选择采用结合SVM和模板匹配算法进行实际流水线上的缺陷识别,该混合检测识别方式能有效提升检测效率,提高系统抗干扰的性能。3.在PC端中,采用LabVIEW平台对油管表面缺陷检测系统进行软件开发。实现了检测系统所需的图像数据采集模块、图像处理模块、图像识别模块、串口通信模块等功能,能有效的输出识别结果并进行缺陷报告及标记。该系统相关方法和技术有效可行,编译好的程序可以达到25fps的检测速率和90%的准确度。该系统能够很好的帮助检测人员快速检测出油管表面是否存在缺陷,提升工厂流水线工作效率。

关键词：机器视觉汽车油管缺陷检测图像处理 LabVIEW

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HDI刚挠结合板一阶及二阶盲孔工艺研究

HDI刚挠结合板一阶及二阶盲孔工艺研究

作者：余小飞电子科技大学

学位级别：硕士

高密度互连(High Density Interconnection，HDI)刚挠结合印制电路板属于高端印制电路板产品，其目的是为了满足电子产品向着微型化、高频高速化、多功能化方向发展的需求。HDI刚挠结合板兼备了普通HDI板和刚挠结合板的优点，推进了电... 详细信息

高密度互连(High Density Interconnection，HDI)刚挠结合印制电路板属于高端印制电路板产品，其目的是为了满足电子产品向着微型化、高频高速化、多功能化方向发展的需求。HDI刚挠结合板兼备了普通HDI板和刚挠结合板的优点，推进了电子系统设计与制造的高集成度和高智能化发展，已被广泛应用于航天技术、医疗设备以及消费类等高端电子产品中。盲孔制作技术是HDI刚挠结合板制作工艺中最为关键的技术之一，是实现层间互连的主要途径。本课题结合生产实际对HDI刚挠结合板的盲孔制作技术进行研究。与传统机械孔加工技术相比，激光技术制作微盲孔表现出高效率与高精度的优势。本文探讨了紫外(Ultraviolet，UV)激光加工盲孔的影响因素，通过正交优化实验优化了影响钻孔深度的UV激光加工参数，结果表明激光参数对钻孔深度影响的主次关系为：激光功率>加工速度>激光频率>Z轴高度，且获得了UV激光制作孔径为200μm一阶及二阶盲孔的最佳工艺参数和方法。等离子体兼具盲孔制作及清洗的功能。通过正交优化实验优化了影响聚酰亚胺(PI)凹蚀深度的工艺参数。结果表明：处理时间对PI凹蚀深度的影响最大，且凹蚀深度随着时间的增加而加深;在厚度为25μm的PI双面板上等离子体凹蚀孔径为100μm盲孔的工艺参数为：射频功率2500W，O与CF4气体体积比例为12:5，气体总量1000ml/min，时间25min。同时，本文研究了等离子体对盲孔的清洗效果，结果显示等离子体对基材的蚀刻速率为：丙烯酸树脂>聚酰亚胺>环氧树脂。黑孔技术的目的是通过物理吸附作用在孔壁形成薄导电层。分别选用环氧树脂和聚酰亚胺(PI)为基材，研究了黑孔液处理时间、温度、黑孔液浓度、黑孔处理方式等对微孔黑孔效果的影响，讨论了黑孔碳黑在基材上的吸附速率。结果表明：黑孔碳黑在环氧树脂基材上的吸附速率比在聚酰亚胺基材上快，采取两次黑孔技术，可有效地防止刚挠结合板内层PI电镀破孔。本文发明了一种层压法制作二阶盲孔的新工艺方法。研究了环氧树脂胶膜在层压前后孔径变形性，归纳了环氧树脂胶膜孔径变形趋势。通过对制作工艺的分析和优化，研发出一种由PI双面板、环氧树脂胶膜和铜箔层压组成且孔径为100μm二阶盲孔的新方法，该方法可大大降低传统制作盲孔方法对材料的限制，具有快速、简单、经济适用等特点。结合上述研究成果，优化了整个制作工艺流程，实现了含二阶盲孔的八层HDI刚挠结合板工艺试板，为该类产品的产业化奠定了基础。

关键词： HDI 刚挠结合板盲孔激光钻孔等离子体

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船舶航向保持中的混沌控制研究

舰船科学技术 2017年第16期39卷 19-21页

作者：余小飞李平河南工业职业技术学院河南南阳473000

大型船舶的航向控制是一个多变量、时滞性较大和非线性的动态过程,在海浪、海风等因素干扰下会呈现一种典型的混沌运动。本文系统介绍混沌控制理论和算法,结合船舶航向控制数学模型和Diffing方程,设计一种船舶航向的控制器,并利用Maltla... 详细信息

大型船舶的航向控制是一个多变量、时滞性较大和非线性的动态过程,在海浪、海风等因素干扰下会呈现一种典型的混沌运动。本文系统介绍混沌控制理论和算法,结合船舶航向控制数学模型和Diffing方程,设计一种船舶航向的控制器,并利用Maltlab对该非线性控制器进行仿真。仿真结果表明,该船舶航向控制器具有良好的航向保持能力和鲁棒性。

关键词：航向控制混沌运动 Diffing方程 Maltlab

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矩阵SR分解R因子新的扰动界

数学的实践与认识 2019年第23期49卷 183-190页

作者：李平余小飞河南工业职业技术学院基础部

矩阵的SR分解是求解一些优化控制问题的有效工具,如用来求解代数Riccati方程.利用分块的矩阵-向量方程方法与Lyapunov控制函数和Banach不动点定理相结合的方法获得了SR分解R因子在范数型扰动下的范数型的严格扰动界和一阶扰动界,改进了... 详细信息

矩阵的SR分解是求解一些优化控制问题的有效工具,如用来求解代数Riccati方程.利用分块的矩阵-向量方程方法与Lyapunov控制函数和Banach不动点定理相结合的方法获得了SR分解R因子在范数型扰动下的范数型的严格扰动界和一阶扰动界,改进了已有结果.

关键词： SR分解 Banach不动点定理严格扰动界一阶扰动界

非线性动力学在波浪中的非线性横摇运动及运动稳定性研究

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舰船科学技术 2016年第1X期38卷 4-6页

作者：余小飞汤志浩河南工业职业技术学院河南南阳473000

保证船舶在航行过程中的稳定、安全行驶,是研究船舶运动稳定性的一个重要课题。本文通过研究影响船舶在波浪中非线性横摇运动的影响因素,并通过Floquet理论分析船舶在波浪中运动的稳定性解得分叉、跳跃、混沌。最后通过实例来说明,船舶... 详细信息

保证船舶在航行过程中的稳定、安全行驶,是研究船舶运动稳定性的一个重要课题。本文通过研究影响船舶在波浪中非线性横摇运动的影响因素,并通过Floquet理论分析船舶在波浪中运动的稳定性解得分叉、跳跃、混沌。最后通过实例来说明,船舶在非线性横摇过程中,突然的扰动有可能导致船舶倾覆。

关键词：非线性动力学非线性横摇运动稳定性

对当前公安消防部队表彰奖励工作的调查与思考

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基层政治工作研究 2017年第6期 47-48页

作者：余小飞新余市公安消防支队

表彰奖励工作是思想政治工作的重要内容．事关官兵个人利益．各级官兵广为关注。这项工作做得公不公．搞得好不好．直接影响部队士气和队伍建设长远发展。近期我们采取查阅资料、调查问卷、实地检查、座谈了解等方式，对近年来消防部队... 详细信息

表彰奖励工作是思想政治工作的重要内容．事关官兵个人利益．各级官兵广为关注。这项工作做得公不公．搞得好不好．直接影响部队士气和队伍建设长远发展。近期我们采取查阅资料、调查问卷、实地检查、座谈了解等方式，对近年来消防部队表彰奖励工作进行了深入调研。总体感到．公安消防部队表彰奖励工作把关较严．导向鲜明．成效凸显．但也存在这样或那样的问题．需要各级引起重视．认真加以解决。

关键词：公安消防部队奖励工作调查问卷表彰思想政治工作个人利益队伍建设查阅资料