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基因组和DNA甲基化组联合分析筛选猪肉质性状关键基因

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中国农业科学 2024年第7期57卷 1394-1406页

作者：赵真坚王凯陈栋申琦余杨崔晟頔王俊戈陈子旸禹世欣陈佳苗王翔枫唐国庆四川农业大学动物科技学院/农业农村部畜禽生物组学重点实验室/畜禽遗传资源发掘与创新利用四川省重点实验室/猪禽种业全国重点实验室

【背景】猪的肉质性状是重要的经济性状。研究影响各类肉质性状的分子机制，发掘关键基因，从而指导猪的遗传改良，对改善猪肉品质具有重要意义。当前肉质相关的机制研究主要是基于DNA的基因组研究，而对肉质性状的DNA甲基化研究以及结... 详细信息

【背景】猪的肉质性状是重要的经济性状。研究影响各类肉质性状的分子机制，发掘关键基因，从而指导猪的遗传改良，对改善猪肉品质具有重要意义。当前肉质相关的机制研究主要是基于DNA的基因组研究，而对肉质性状的DNA甲基化研究以及结合基因组和甲基化组的综合分析却鲜有报道。【目的】通过基因组和DNA甲基化组联合分析，筛选、鉴定了影响猪肉质的潜在关键基因。为猪肉品质的遗传改良研究提供借鉴。【方法】检测了140头大白猪背最长肌的28个肉质性状，通过表观基因组关联分析(EWAS)与全基因组关联分析(GWAS)筛选了各性状显著关联的CpG和SNP位点。随后以SNP为协变量对GWAS和EWAS重叠的显著关联位点进行条件关联分析，进一步筛选具有独立效应的CpG位点。然后以CpG位点的甲基化水平为因变量，以SNP为自变量进行关联分析从而鉴定甲基化数量性状位点(meQTL)。最后使用顺式甲基化数量性状位点(cis-meQTL)作为工具变量进行孟德尔随机化分析，从而推断cis-meQTL与表型之间的因果关系，同时对位点进行注释，鉴定潜在的关键基因。【结果】(1)在屠宰45 min黄度值(b45min)、滴水损失(DL)、二十二碳六烯酸(C22:6n-3)3个肉质性状上，EWAS和GWAS在相同基因组区域鉴定到显著关联位点。(2)b45min的7个CpG位点在条件关联分析后仍保持显著，DL有1个CpG位点在条件关联分析后仍保持显著，而C22:6n-3的3个位点在使用SNP作为协变量分析后不再显著，表明EWAS鉴定的b45min的7个CpG位点和DL的1个CpG位点的显著关联不受附近的显著SNP影响。(3)b45min的7个CpG位点和DL的1个CpG位点共鉴定了10个meQTL，但绝大多数是trans-meQTL，只有一个CpG位点(SSC12:44 254 675 bp)鉴定到一个cis-meQTL，表明该位点可能受到近距离SNP调控。(4)孟德尔随机化分析显示该CpG位点(SSC12:44 254 675 bp)与b45min表型存在一定的因果关联。(5)对该位点注释发现，距离CpG位点(SSC12:44 254 675 bp)和其cis-meQTL最近的基因是NOS2，且CpG位点位于NOS2基因内。【结论】综合DNA甲基化组合基因组数据联合分析结果，可以推测NOS2基因是肉色性状关键候选基因，其DNA甲基化、SNP共同作用调控基因表达，进而影响肉色性状相关基因表达。

关键词：表观基因组关联分析全基因组关联分析肉质性状 DNA甲基化甲基化数量性状位点

杜洛克猪剩余采食量的社会遗传效应与其他经济性状的关联分析

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中国畜牧杂志 2024年第8期60卷 141-145页

作者：禹世欣王书杰赵真坚陈栋申琦余杨崔晟頔王俊戈陈子旸陈佳苗王翔枫唐国庆四川农业大学动物科技学院猪禽种业全国重点实验室四川成都611130 四川农业大学动物科技学院农业农村部畜禽生物组学重点实验室四川成都611130 四川农业大学畜禽遗传资源发掘与创新利用四川省重点实验室四川成都611130

本试验旨在探究杜洛克猪剩余采食量(RFI)的社会遗传效应(SGE)对其生长性能、胴体性能和肉品质产生的影响。选用209头杜洛克猪作为试验对象,从平均83日龄(平均体重33.6 kg)开始饲养到平均177日龄(平均体重111.0kg)。选择SGE最小的10头和... 详细信息

本试验旨在探究杜洛克猪剩余采食量(RFI)的社会遗传效应(SGE)对其生长性能、胴体性能和肉品质产生的影响。选用209头杜洛克猪作为试验对象,从平均83日龄(平均体重33.6 kg)开始饲养到平均177日龄(平均体重111.0kg)。选择SGE最小的10头和最大的10头作为LRS组和HRS组,对比2组的生长性能、胴体性能和肉品质。结果表明:在生长性能方面,HRS组的饲料转化率(FCR)和平均日采食量(ADFI)极显著低于LRS组;在胴体性能方面,HRS组的胴体全重和胴体直长显著高于LRS组,而背膘厚显著低于LRS组;在肉品质方面,HRS组腰肌组织屠宰后45min肉色a值显著高于LRS组。此外,HRS组背最长肌的韧性极显著高于LRS组,肌内脂肪含量和大理石纹显著低于LRS组。综上所述,杜洛克猪RFI的SGE对其生长性能、胴体性能和肉品质均产生一定的影响。因此,在对RFI进行选育时需考虑SGE的影响。

关键词：社会遗传效应杜洛克猪生长性能胴体性能肉质

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利用GWAS和DNA甲基化共定位鉴定猪肉质性状的候选基因

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畜牧兽医学报 2024年第5期55卷 1945-1957页

作者：崔晟頔王凯赵真坚陈栋申琦余杨王俊戈陈子旸禹世欣陈佳苗王翔枫唐国庆四川农业大学动物科技学院猪禽种业全国重点实验室成都611130 四川农业大学动物科技学院农业农村部畜禽生物组学重点实验室成都611130 四川农业大学“畜禽遗传资源发掘与创新利用四川省重点实验室” 成都611130 新希望六和股份有限公司成都625014

为了更深入地了解肉质性状的遗传基础,本研究使用基于基因型填充的测序数据进行了GWAS分析并与之前的发表的EWAS结果进行共定位分析。该研究发现了515个全基因组水平显著的SNPs位点和4 134个达建议显著阈值的SNPs位点,这些位点共涉及40... 详细信息

为了更深入地了解肉质性状的遗传基础,本研究使用基于基因型填充的测序数据进行了GWAS分析并与之前的发表的EWAS结果进行共定位分析。该研究发现了515个全基因组水平显著的SNPs位点和4 134个达建议显著阈值的SNPs位点,这些位点共涉及406个基因,其中包括262个蛋白质编码基因,最终确定了6个可能与肉质性状相关的重要候选基因。同时,与EWAS的结果进行比较,发现有12个显著的CpG位点与显著SNP位点存在重叠。通过这些研究可以为改善猪肉品质的育种工作提供更坚实的理论基础和数据支持。

关键词：全基因组关联分析 SNPs 肉质性状

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基于计算机视觉技术的猪肌内脂肪含量和眼肌面积测定系统的研发

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畜牧兽医学报 2024年第9期55卷 3843-3852页

作者：陈栋周文譞赵真坚申琦余杨崔晟頔王俊戈陈子旸禹世欣陈佳苗王翔枫吴平先郭宗义王金勇唐国庆四川农业大学动物科技学院猪禽种业全国重点实验室成都611130 四川农业大学动物科技学院农业农村部畜禽生物组学重点实验室成都611130 四川农业大学“畜禽遗传资源发掘与创新利用四川省重点实验室” 成都611130 国家生猪技术创新中心重庆402460

旨在开发基于计算机视觉技术的猪肉质图像快速鉴别方法,为解决猪肉质传统测定方法缺陷和构建猪肉质快速测定系统奠定技术基础。本研究采用canny边缘检测算法、归一化、伽马校正、自适应直方图均衡化和阈值化等方法进行图像处理,利用二... 详细信息

旨在开发基于计算机视觉技术的猪肉质图像快速鉴别方法,为解决猪肉质传统测定方法缺陷和构建猪肉质快速测定系统奠定技术基础。本研究采用canny边缘检测算法、归一化、伽马校正、自适应直方图均衡化和阈值化等方法进行图像处理,利用二维信息模拟了猪背最长肌的三维模型,开发了基于图像的猪肌内脂肪含量计算机视觉测定方法。利用人工描绘和计算机视觉轮廓搜寻技术开发了基于图像处理的眼肌面积识别方法。利用Open CV和C++实现各方法的底层算法程序,研发了一套猪肌内脂肪含量和眼肌面积的测定系统,并利用250头不同品种的试验猪进行了应用测试。测试结果显示,肌内脂肪含量检测模块能够快速实现肌内脂肪图形信息的提取与预测,单个样品检测时间平均不超过2 min,准确性可达0.54,且测定离散系数为0.062,具有较强的稳定性。眼肌面积与背膘厚检测模块能够通过人工与计算机结合的方式快速测定眼肌面积和背膘厚。本研究建立的检测方法和软件系统能够实现猪肌内脂肪含量、背膘厚和眼肌面积的快速检测。

关键词：计算机视觉图像处理肌内脂肪含量猪

自我救赎 ——关于《呼吸》系列水彩作品的创作报告

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自我救赎 ——关于《呼吸》系列水彩作...

作者：陈佳苗湖南师范大学

学位级别：硕士

豪泽尔说:艺术是社会的产物,在当今社会大环境下,社会对艺术的影响越来越大,怎样的社会环境就会衍生怎样的艺术作品,艺术作品的内容往往反映当下的现实,艺术家在作品中对情感的表达也越来越直白。肖像绘画的情感表达也是社会环境影响的... 详细信息

豪泽尔说:艺术是社会的产物,在当今社会大环境下,社会对艺术的影响越来越大,怎样的社会环境就会衍生怎样的艺术作品,艺术作品的内容往往反映当下的现实,艺术家在作品中对情感的表达也越来越直白。肖像绘画的情感表达也是社会环境影响的结果。对于当下的我们来说,即将踏入社会,由求职、学业导致的敏感、失眠、焦虑等等复杂的因素压迫着我们的情感,充满希望又充满焦虑,如何从这种消极情绪中脱离是当下我们需要思考的问题。本文从我的创作角度出发,结合个人的创作路径,通过对《呼吸》系列作品创作过程的剖析,来探讨:如何走出“窒息”的困境,自我解放、自我救赎,寻求新的可能。文章大致分为两个部分:第一部分是支撑绘画思想理念的符号学、艺术社会学的理论基础,第二部分是创作的实践过程,从这两个部分来探讨画面人物的情绪传达。将个人的情绪符号化,把个体意识中内在的精神世界转化为集体意识中的客观世界,成为象征社会大众所能共同理解的精神符号世界,引起观者的共鸣与反思,也给予了以后的创作更多可能。

关键词：肖像绘画焦虑敏感自我解放符号

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基于门诊头痛患者相关共病横断面调查研究

基于门诊头痛患者相关共病横断面调查研究

作者：陈佳苗厦门大学

学位级别：硕士

目的:探讨偏头痛与睡眠障碍、焦虑抑郁等相关的相关性,旨在进一步探索偏头痛及共病的可能发病机制,对偏头痛临床相多维度的识别,同时也指导偏头痛的精准治疗,减少偏头痛所带来的远期危害。方法:采用横断面调查,对2018年8月至2019年12月... 详细信息

目的:探讨偏头痛与睡眠障碍、焦虑抑郁等相关的相关性,旨在进一步探索偏头痛及共病的可能发病机制,对偏头痛临床相多维度的识别,同时也指导偏头痛的精准治疗,减少偏头痛所带来的远期危害。方法:采用横断面调查,对2018年8月至2019年12月期间就诊于厦门大学附属第一医院神经内科头痛门诊的182名偏头痛、126名紧张型头痛患者采取调查问卷表及自评问卷的方式,获取一般情况信息、头痛发作情况信息(频率、持续时间)、匹兹堡睡眠质量指数量表(PSQI)、医院焦虑抑郁量表(HADS),SPSS23统计学软件进行数据统计分析,利用卡方检验、非参数检验等对比偏头痛与正常对照组是否在睡眠障碍及焦虑抑郁等方面有差异性。结果:本次研究中偏头痛组一共收集录入182人,其中女性患者155人,男性患者27人。偏头痛组匹兹堡睡眠指数平均值为 6.72±3.30,对比正常对照组存在显著差异性。在偏头痛患者组中,HADS焦虑评分阳性者的有61人,占37%,抑郁评分阳性者有56人,占33.9%,焦虑抑郁共病者共有34人,占20.6%,对比正常对照组,偏头痛组共病焦虑的比例明显增多,具有统计学差异。偏头痛组中合并了焦虑抑郁者睡眠质量更差,匹兹堡睡眠指数平均值为9.47±3.83。结论:与正常对照人群相比,偏头痛及紧张型头痛睡眠障碍的发生率高;偏头痛患者容易共病焦虑及睡眠障碍;共病焦虑抑郁的偏头痛患者睡眠质量更差。

关键词：偏头痛紧张型头痛共病睡眠障碍横断面调查

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英国2012年《卫生和社会护理法案》研究

法学杂志 2018年第6期39卷 56-67页

作者：陈云良陈佳苗中南大学湖南长沙410083

英国通过1946年《国家卫生服务法案》(National Health Service Act 1946)将向全体公民提供近乎免费、平等的基本医疗服务变成一项国家义务,使得医疗服务从一项"私人产品"演变为法律上的"拟制公共产品"。2012年《卫生和社会护理法案》... 详细信息

英国通过1946年《国家卫生服务法案》(National Health Service Act 1946)将向全体公民提供近乎免费、平等的基本医疗服务变成一项国家义务,使得医疗服务从一项"私人产品"演变为法律上的"拟制公共产品"。2012年《卫生和社会护理法案》为迄今为止最广泛的国家卫生服务体系重组提供了法律依据。经济可持续性的考量推动了2012年《卫生和社会护理法案》的改革进程。我国相关立法应借鉴2012年《卫生和社会护理法案》界定相关主体职能(职权和职责),强化政府出资、监管职责,而非原则性规定政府直接提供服务。简政放权,培育市场,加强监管应是政府履行主导责任的最佳方式。鉴于目前的老龄化压力,我国应借鉴英国经验,尽快建立社会护理制度。

关键词：国家卫生服务体系 2012年卫生和社会护理法案基本医疗卫生法

预防性应用抗生素在剖宫产手术中的临床疗效分析

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中国现代药物应用 2019年第22期13卷 195-196页

作者：陈佳苗大连市妇幼保健院暨大连市妇产医院

目的探讨剖宫产手术预防性应用抗生素的临床效果。方法210例实行剖宫产的产妇,随机分为观察组和对照组,每组105例。对照组产妇手术后应用抗生素,观察组产妇预防性应用抗生素。观察比较两组产妇切口愈合及感染发生情况、住院费用及住院... 详细信息

目的探讨剖宫产手术预防性应用抗生素的临床效果。方法210例实行剖宫产的产妇,随机分为观察组和对照组,每组105例。对照组产妇手术后应用抗生素,观察组产妇预防性应用抗生素。观察比较两组产妇切口愈合及感染发生情况、住院费用及住院天数、体温恢复时间及白细胞水平。结果观察组产妇切口甲级愈合发生率99.0%高于对照组的95.2%,但差异无统计学意义(P>0.05)。观察组产妇住院费用(3470±230)元明显低于对照组的(4782±320)元,差异具有统计学意义(P0.05)。观察组产妇体温恢复时间为(42.7±2.3)h,少于对照组的(52.7±3.1)h,差异具有统计学意义(P0.05)。结论剖宫产手术中预防性应用抗生素治疗,可减少抗生素用量,能促进伤口愈合,减少住院费用,适宜在临床广泛应用。

关键词：预防性应用抗生素剖宫产手术临床疗效

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P2P网贷平台监管路径的选择

湖南科技学院学报 2018年第3期39卷 80-83页

作者：陈佳苗中南大学法学院湖南长沙410083

论文从经济法基础理论、数据分析和当前实践三个角度入手,实地走访调研平台运营模式,梳理制度监管构架,分析P2P网贷平台风险,提出权益人投资保护的建议。调研发现,P2P行业常见风险为行政监管风险、企业运营一般风险和刑事犯罪风险,对刑... 详细信息

论文从经济法基础理论、数据分析和当前实践三个角度入手,实地走访调研平台运营模式,梳理制度监管构架,分析P2P网贷平台风险,提出权益人投资保护的建议。调研发现,P2P行业常见风险为行政监管风险、企业运营一般风险和刑事犯罪风险,对刑事犯罪进行打击的难点在于调查取证困难和缺乏法律依据。当前既要充分考虑国情,培育市场,支持创新,也要认识到网贷平台缺乏监管,监管体制不顺畅的危害性,从立法、执法、司法、守法和自我教育五个方面加强投资人权益保护,建立健全事前预防,过程监管,事后救济的一整套权益保障机制,争取多方共赢,协同发展。

关键词：网贷平台投资人权益保护 P2P企业风险