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2023年重庆市城市污水新冠病毒监测结果

中华实验和临床病毒学杂志 2024年第3期38卷 294-298页

作者：刘高敏郑吉琴陈瑶唐文革李志峰聂术君重庆市疾病预防控制中心重庆400707 重庆市疾病预防与公共卫生研究中心高致病性病原微生物重庆市重点实验室重庆400707

目的为了弥补传统大规模人群监测的不足,在新冠疫情爆发初期提供预警信号,重庆市自2023年起开展城市污水新冠病毒监测工作。方法新冠病毒"乙类乙管"后,选择了重庆主城4个区5个有自动样本采集设施的污水处理厂作为监测点,每周每个污水处... 详细信息

目的为了弥补传统大规模人群监测的不足,在新冠疫情爆发初期提供预警信号,重庆市自2023年起开展城市污水新冠病毒监测工作。方法新冠病毒"乙类乙管"后,选择了重庆主城4个区5个有自动样本采集设施的污水处理厂作为监测点,每周每个污水处理厂各采集2份污水,用铝盐沉淀法进行富集浓缩,应用多重实时荧光RT-PCR方法对新冠病毒进行检测和分析。结果2023年1月16日至12月31日累计监测城市污水496份,其中新冠病毒核酸检测阳性285份,总检出率57.46%。第3~5周、18~21周、40~47周新冠病毒检出率均为100.00%。城市污水中新冠病毒核酸浓度在第18周达到高峰,随后开始下降,进入低水平、波动流行期,污水监测新冠病毒核酸日均浓度与传染病监测系统显示的每日新增新冠感染者数、发热门诊新冠阳性检出率的变化趋势基本吻合。结论重庆市城市污水中新冠病毒的检出率较高,尤其是4~5月份,污水监测可以间接反映新冠病毒感染状况。

关键词：铝盐沉淀法污水监测新冠病毒多重实时荧光RT-PCR

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玉米穗轴扁平突变体的鉴定及基因定位

玉米穗轴扁平突变体的鉴定及基因定位

作者：聂术君四川农业大学

学位级别：硕士

玉米是重要的粮食、饲料和工业原料,在我国国民经济中占有重要的地位。玉米果穗作为库器官,其大小直接决定产量高低。玉米穗轴发育突变会改变果穗大小、穗行数和行粒数等,从而影响玉米产量。因而鉴定和克隆穗轴发育突变基因,发掘玉米雌... 详细信息

玉米是重要的粮食、饲料和工业原料,在我国国民经济中占有重要的地位。玉米果穗作为库器官,其大小直接决定产量高低。玉米穗轴发育突变会改变果穗大小、穗行数和行粒数等,从而影响玉米产量。因而鉴定和克隆穗轴发育突变基因,发掘玉米雌穗发育过程中决定穗行数性状的关键基因位点,对培育高产玉米新品种有重要意义。本研究以Maizegdb突变体库订购的Mu转座子插入突变体为材料(遗传背景为W22),通过多代自交筛选获得遗传稳定、表型明显的穗轴扁平突变体ccf-1(corn cob fasciation 1),UniformMu 编号为 UFMu-07360,通过对突变体的表型鉴定,遗传分析,Mu插入位点检测,突变基因的定位,转录组测序,候选基因的克隆比对等,以期克隆导致突变体表型的基因,为穗轴发育分子机理的解析奠定基础。取得的主要研究结果如下:1.形态学鉴定和组织扫描电镜分析发现:突变体ccf-1雌穗与对照W22相比差异明显,表现为雌穗穗尖分生组织增生,存在多个生长点,且呈不规则封闭环状排列。穗上部膨大显著,穗行数紊乱,在幼穗生长至1-2 cm时即可观察到表型。经过表型鉴定和拷种分析发现:突变体ccf-1果穗与对照相比在穗长、扁化部位穗粗、扁化部位轴粗,扁化部位穗行数等均呈显著或极显著差异,表明突变基因对果穗的生长发育有明显的影响,总趋势是果穗增大,穗上部扁化增粗,穗行数增加,百粒重减小。***插入位点检测结果表明,Maizegdb数据库公布的插入位点均不是导致表型变异的主因:Maizegdb数据库公布的突变体ccf-1中共存在7个插入位点,实际检测到5个插入位点,分别为mu1056077::Mu(exon1)、mu1033815::Mu(5’UTR)、mu1037462::Mu(5’UTR)、mu1057087::Mu(exon)、mu1055340::Mu(5’UTR+intron),其中仅有mu1055340::Mu为纯合插入位点,对纯合插入位点所在的基因进行扩增测序,证明其确为纯合插入,但与分离群体隐性单株进行表型共分离检测发现其与表型并不关联,且插入位点所在基因的其他Mu突变体种子并无ccf-1表型,确定该突变体并非由这个位点的Mu插入导致,另外4个插入位点分别位于UTR及外显子区,但并非是纯合插入,表型变异跟这4个位点也不关联。3.以B73及ccf-1为亲本,构建F2分离群体,结合田间表型鉴定和遗传分析,结果表明:ccf-1是受单基因控制的隐性变异。利用图位克隆策略将突变基因定位在玉米第4号染色体4.01bin的insert101-insert121区段内,两个分子标记之间的遗传距离为0.4 cM,物理距离约为1.5 Mb。同时,该区段内不存在Maizegdb公布的Mu插入位点,进一步证明突变体并非由公布的Mu插入位点的突变引起。4.突变体及对照穗尖RNAseq结果表明:突变体ccf-1的2 mm穗尖样品与对照组W22间共检测到5,654个差异表达基因。GO分析表明:GO:0008150(biological process),GO:1903293(phosphatase complex),G0:0008287(protein serine/threonine phosphatase complex),GO:0001071(nucleic acid binding transcriptio n factor activity),GO:0003700(transcription factor activity,sequence-specific DNA binding),GO:0043565(sequence-specific DNA binding)等显著富集。KEGG分析表明,9个Pathway的P value值小于0.05,分别与植物病原菌的相互作用、半乳糖代谢、植物激素信号转导、光合作用-天线蛋白质类、次生代谢产物生物合成、萜类化合物骨架生物合成、氮代谢等信号途径相关。5.候选基因克隆及序列分析:利用生物信息学方法对定位区段内的RNAseq数据进行了分析,共找到4个SNP及3个差异表达基因,涉及4个基因。对这些基因的克隆和序列比对发现,突变体ccf-1及野生型W22比未发生序列变异,表明突变体是由区段内其他基因突变所致。定位区段中存在较多重复序列和未测通的序列gap,为候选基因的筛选、标记开发及基因克隆增加了难度。

关键词：玉米穗轴发育突变体遗传分析基因定位

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我国糯玉米种质资源的研究现状

安徽农业科学 2014年第3期42卷 694-695,764页

作者：聂术君陈发波长江师范学院生命科学与技术学院重庆408100

糯玉米(Zea mays *** kulesh)又称蜡质玉米,是一种大众食品,其鲜果穗可用作鲜食或加工,子粒和茎秆可作粮食、饲料。我国是糯玉米的起源地,也是糯玉米种质资源最丰富的国家。从表型水平、生理生化水平、分子水平及遗传育种等方面综述了... 详细信息

糯玉米(Zea mays *** kulesh)又称蜡质玉米,是一种大众食品,其鲜果穗可用作鲜食或加工,子粒和茎秆可作粮食、饲料。我国是糯玉米的起源地,也是糯玉米种质资源最丰富的国家。从表型水平、生理生化水平、分子水平及遗传育种等方面综述了我国糯玉米研究现状,提出了当前糯玉米种质资源研究存在的问题,并对其研究前景进行了展望。

关键词：糯玉米种质资源研究现状

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重庆市152栋高层建筑二次供水病原谱分析

中国公共卫生 2023年第7期39卷 908-912页

作者：段刚廖春艳王文斟赵婷李志峰聂术君赵波王玲重庆市疾病预防控制中心微生物检测所流细科重庆400042

目的了解重庆市高层建筑二次供水微生物污染状况、优势菌株及致病菌耐药状况、毒力基因及亲缘关系分析。方法2020—2021年采集重庆市152栋楼层超过18层、楼龄在5年以上的二次供水样本152份,进行细菌分离鉴定、药敏实验及全基因组测序以... 详细信息

目的了解重庆市高层建筑二次供水微生物污染状况、优势菌株及致病菌耐药状况、毒力基因及亲缘关系分析。方法2020—2021年采集重庆市152栋楼层超过18层、楼龄在5年以上的二次供水样本152份,进行细菌分离鉴定、药敏实验及全基因组测序以及病毒核酸检测。结果152份水样中56份无细菌生长,67份1种细菌生长,23份2种细菌生长,5份3种细菌生长,共分离获得菌株128株。检出率居于前3位的微生物是芽孢杆菌属(25.0%,32/128)、假单胞菌属(18.0%,23/128)、不动杆菌属(7.8%,10/128)。分离率较高的致病菌/条件致病菌有:蜡样芽孢杆菌10株,苏云金芽孢杆菌6株,琼氏不动杆菌6株,产碱假单胞菌6株,溶血葡萄球菌4株,藤黄微球菌、偶发分枝杆菌、铜绿假单胞菌各3株,少动鞘氨醇单胞菌、嗜麦芽窄食单胞菌等均有检出。铜绿假单胞菌对8种抗生素耐药、蜡样/苏云金芽孢杆菌对β–内酰胺类抗生素均耐药;诺如病毒、轮状病毒、新型冠状病毒3种病毒核酸检测均为阴性;全基因测序构建系统进化树显示,2株分离自二次供水的苏云金芽胞杆菌进化亲缘关系与致病株97-27等更接近。结论重庆市高层建筑二次供水存在芽孢杆菌属、假单胞菌属、不动杆菌属等致病菌污染,影响高层建筑居民健康。

关键词：高层建筑二次供水耐药微生物污染全基因测序

利用Waxy基因检测不同玉米地方品种的遗传差异

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江苏农业科学 2014年第4期42卷 18-21页

作者：陈发波姚启伦聂术君董二飞程远芳向顺军长江师范学院生命科学与技术学院重庆涪陵408100

为了解我国西南地区不同玉米品种间的遗传多样性，对5份玉米地方品种的Waxy基因部分编码区核苷酸序列进行克隆、测序及序列比对。结果表明，所选材料的Waxy基因序列长度约为1370 bp，一致性为96．60％，大于3 bp 的插入/缺失有8个。不... 详细信息

为了解我国西南地区不同玉米品种间的遗传多样性，对5份玉米地方品种的Waxy基因部分编码区核苷酸序列进行克隆、测序及序列比对。结果表明，所选材料的Waxy基因序列长度约为1370 bp，一致性为96．60％，大于3 bp 的插入/缺失有8个。不同地方品种材料间的遗传相似系数在98．7％～99．6％之间，平均遗传相似系数为99.2％，根据聚类图将供试材料分为4类。说明Waxy基因具有较高的保守性，所选材料间存在一定的遗传多样性，利用Wayx基因序列可以将不同的玉米地方品种区分开来。 Waxy基因序列可作为一种理想的分子标记，用于今后玉米地方品种的研究。

关键词： Waxy基因玉米地方品种遗传差异保护利用

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涪陵红心萝卜起源进化的分子系统学

贵州农业科学 2014年第12期42卷 7-11页

作者：陈发波方平姚启伦聂术君程远芳董二飞长江师范学院生命科学院重庆涪陵408100

为探讨不同皮色和肉质颜色萝卜间的亲缘关系,以6份不同皮色和肉质颜色的萝卜及6份外类群为材料,进行Chs基因克隆、测序,研究不同皮色和肉质颜色的萝卜间系统发育关系。结果表明：6份不同皮色及肉质颜色萝卜Chs基因序列长度变异为1 427-1... 详细信息

为探讨不同皮色和肉质颜色萝卜间的亲缘关系,以6份不同皮色和肉质颜色的萝卜及6份外类群为材料,进行Chs基因克隆、测序,研究不同皮色和肉质颜色的萝卜间系统发育关系。结果表明：6份不同皮色及肉质颜色萝卜Chs基因序列长度变异为1 427-1 430bp,其中变异位点占0.6491%。可将12个Chs基因序列分成3个分支。第一分支全部为不同肉色萝卜,说明不同肉色萝卜间亲缘关系较近;不同皮色及肉质颜色萝卜品种及其近缘植物间不仅存在树状的进化关系,还存在非树状的进化史,未存在明显的星状结构。单拷贝的Chs基因可作为一个较好的候选基因用于研究不同皮色和肉质颜色的萝卜系统发育关系。

关键词：红心萝卜 Chs基因分子系统学

玉米地方品种Glb1基因克隆及其遗传多样性分析

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南方农业学报 2014年第8期45卷 1347-1352页

作者：陈发波方平姚启伦程远芳聂术君秦林林长江师范学院生命科学与技术学院重庆408100

【目的】了解我国西南地区不同玉米地方品种的遗传多样性,为合理利用这些玉米种质资源提供参考。【方法】以西南地区12份玉米地方品种为材料,对Glb1基因片段进行克隆、测序及序列比对,分析其遗传多样性。【结果】12份玉米材料Glb1基因... 详细信息

【目的】了解我国西南地区不同玉米地方品种的遗传多样性,为合理利用这些玉米种质资源提供参考。【方法】以西南地区12份玉米地方品种为材料,对Glb1基因片段进行克隆、测序及序列比对,分析其遗传多样性。【结果】12份玉米材料Glb1基因序列长度为1138-1149 bp,其序列一致性为96.21%。12份材料Glb1基因序列间存在较多的变异位点,大于等于3 bp的插入/缺失有8个,主要位于第81-84、122-128、161-164、368-371、428-442、668-680、966-976和1003-1011 bp。不同玉米地方品种材料间的遗传相似系数为96.50%-100.00%,平均为98.58%。根据聚类分析结果可将12份材料分为五大类,且来源于同一地区的玉米材料趋向于聚为一类。【结论】Glb1基因具有较高的保守性,所选材料间Glb1基因序列存在一定的遗传多样性,利用Glb1基因序列可作为鉴定不同玉米地方品种的一种理想分子标记。

关键词：玉米地方品种 Glb1基因克隆遗传差异分子标记

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玉米穗粒腐病抗病基因的挖掘及功能鉴定

玉米穗粒腐病抗病基因的挖掘及功能鉴定

基于自注意力机制的深度强化学习交通信号控制

第一届全国玉米生物学学术研讨会

作者：何秀静黄洪黄丽李辉潘超聂术君张志明四川农业大学

玉米穗粒腐病作为玉米穗部病害中的一种真菌病害,在全国各大玉米产区均有发生。玉米穗粒腐病病害发生时会造成玉米产量降低、种子发芽率下降,并易招致其他一系列单端孢霉烯真菌毒素混合污染,进而对人、畜的生命健康构成严重威胁。本研...

玉米穗粒腐病作为玉米穗部病害中的一种真菌病害,在全国各大玉米产区均有发生。玉米穗粒腐病病害发生时会造成玉米产量降低、种子发芽率下降,并易招致其他一系列单端孢霉烯真菌毒素混合污染,进而对人、畜的生命健康构成严重威胁。本研究利用IBM DH群体构建高密度bin map遗传连锁图,结合抗穗粒腐病表型数据进行玉米穗粒腐病QTL定位,共检测到10个抗病QTL。其中,位于玉米7.03 hin上存在一个贡献率为33.26%的主效OTL,进一步在该区域内开发

关键词：

来源： cnki会议评论

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cnki会议

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交通运输系统工程与信息 2024年第2期24卷 96-104页

作者：张玺君聂生元李喆张红兰州理工大学计算机与通信学院兰州730050

交通信号控制(Traffic Signal Control, TSC)仍然是交通领域中最重要的研究课题之一。针对现有基于深度强化学习(Deep Reinforcement Learning, DRL)的交通信号控制方法的状态需要人为设计,导致提取交通状态信息难度大以及交通状态信息... 详细信息

交通信号控制(Traffic Signal Control, TSC)仍然是交通领域中最重要的研究课题之一。针对现有基于深度强化学习(Deep Reinforcement Learning, DRL)的交通信号控制方法的状态需要人为设计,导致提取交通状态信息难度大以及交通状态信息无法全面表达的问题,为了从有限特征中挖掘潜在交通状态信息,从而降低交通状态设计难度,提出一种引入自注意力网络的DRL算法。首先,仅获取交叉口各进入口车道车辆位置,使用非均匀量化和独热编码方法预处理得到车辆位置分布矩阵;其次,使用自注意力网络挖掘车辆位置分布矩阵的空间相关性和潜在信息,作为DRL算法的输入;最后,在单交叉口学习交通信号自适应控制策略,在多交叉口路网中验证所提算法的适应性和鲁棒性。仿真结果表明,在单交叉口环境下,与3种基准算法相比,所提算法在车辆平均等待时间等指标上具有更好的性能;在多交叉口路网中,所提算法仍然具有良好的适应性。

关键词：智能交通自适应控制深度强化学习自注意力网络近端策略优化