检索结果-南通市图书馆

Chinese Physics B 2024年第6期33卷 605-612页

作者：毛党新吴园燕涂育松 College of Physics Science and Technology Yangzhou UniversityYangzhou 225009China

The hydroxyl-terminated self-assembled monolayer(OH-SAM),as a surface resistant to protein adsorption,exhibits substantial potential in applications such as ship navigation and medical implants,and the appropriate strategies for designing anti-fouling surfaces are ***,we employ molecular dynamics simulations and alchemical free energy calculations to systematically analyze the factors influencing resistance to protein adsorption on the SAMs terminated with single or double OH groups at three packing densities(∑=2.0 nm^(-2),4.5 nm^(-2),and 6.5 nm^(-2)),*** the first time,we observed that the compactness and order of interfacial water enhance its physical barrier effect,subsequently enhancing the resistance of SAM to protein ***,the spatial hindrance effect of SAM leads to the embedding of protein into SAM,resulting in a lack of resistance of SAM towards ***,the number of hydroxyl groups per unit area of double OH-terminated SAM at ∑=6.5 nm^(-2) is approximately 2 to 3 times that of single OH-terminated SAM at ∑=6.5 nm^(-2) and 4.5 nm^(-2),consequently yielding a weaker resistance of double OH-terminated SAM towards ***,due to the structure of SAM itself,i.e.,the formation of a nearly perfect ice-like hydrogen bond structure,the SAM exhibits the weakest resistance towards *** study will complement and improve the mechanism of OH-SAM resistance to protein adsorption,especially the traditional barrier effect of interfacial water.

关键词： molecular dynamics simulation self-assembled monolayer resistance to protein adsorption hydrogen bond interfacial water

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石墨烯和氧化石墨烯对细胞脂膜破坏作用研究

中国科学：物理学、力学、天文学 2016年第6期46卷 1-11页

作者：涂育松方海平扬州大学物理科学与技术学院扬州225009 中国科学院上海应用物理研究所水科学和技术研究室上海201800

石墨烯作为一种新型材料不断受到关注,如何与生物分子(如蛋白质、细胞脂膜等)发生作用是其生物相容性方面的重要问题之一.石墨烯以sp2杂化的碳为主的成键方式,形成独特的二维结构,具有显著的疏水特征.细胞脂膜主要是由双亲的磷脂分子在... 详细信息

石墨烯作为一种新型材料不断受到关注,如何与生物分子(如蛋白质、细胞脂膜等)发生作用是其生物相容性方面的重要问题之一.石墨烯以sp2杂化的碳为主的成键方式,形成独特的二维结构,具有显著的疏水特征.细胞脂膜主要是由双亲的磷脂分子在水环境中自组装而成.早期实验组观察到石墨烯的抗菌现象,认为锋利的侧边可能会以类似于刀片的方式插入、切割细胞膜.在理论上,我们阐述了一种可能的石墨烯的细胞毒性的分子机理:石墨烯不仅会通过主动插入、切割细胞脂膜,而且会将大量的磷脂分子抽离细胞脂膜,从而破坏细胞膜的完整性导致细胞死亡;尽管氧化石墨烯表面分布着大量的亲水氧化基团,但氧化基团高关联分布特点致使氧化石墨烯有着类似的破坏细胞脂膜的能力.本文综述了石墨烯、氧化石墨烯纳米片与细胞脂膜相互作用的理论研究进展,着重阐述石墨烯和氧化石墨烯从细胞脂膜中大量地抽取磷脂分子的过程以及在此过程中环境水分子所起的关键作用.在石墨烯、氧化石墨烯和细胞脂膜的相互作用中所表现出的特点有可能是一种共性,也会出现在其他疏水特性的纳米材料(如纳米碳管、碳纳米线和大面积的富勒烯等)与细胞脂膜的相互作用过程中.

关键词：石墨烯的毒性细胞脂膜自组装结构水分子亲水与疏水性分子动力学模拟

纳米限阈下的水分子作为载体的信号转换、传导和放大

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中国科学：物理学、力学、天文学 2016年第5期46卷 59-68页

作者：涂育松修鹏方海平扬州大学物理科学与技术学院扬州225009 浙江大学工程力学系浙江大学软物质科学研究中心杭州310027 中国科学院上海应用物理研究所水科学与技术研究室上海201800

通常各种信号处理器,如放大器、分流器等,都是利用电子或者光子进行信号的处理,当处理器小到纳米或分子尺度时,由于分子体系固有的复杂性,和来自热涨落和纳米尺度上区间信号的相互干扰等原因,分子层次上信号的准确传递、转换和放大常常... 详细信息

通常各种信号处理器,如放大器、分流器等,都是利用电子或者光子进行信号的处理,当处理器小到纳米或分子尺度时,由于分子体系固有的复杂性,和来自热涨落和纳米尺度上区间信号的相互干扰等原因,分子层次上信号的准确传递、转换和放大常常是十分困难的.从分子层次的相互作用的角度来看,与静电相互作用的慢衰减方式和范德华作用的快速衰减方式相比,极性分子的偶极相互作用是屏蔽热噪声的影响且有效地避免分支信号间的干扰而实现分子层次上的长程信号传递的有效方法.本文回顾了如何利用限阈于特定管径的碳纳米管内的水分子单链有效地进行将单电子电量大小的电信号转换成偶极信号,并在常温热噪声的环境中实现有效地分子层次的长程信号传导,并进一步利用Y型水分子单链实现分子层次信号的放大.本文还讨论了Y型水分子单链实现分子层次信号放大的鲁棒性,并利用在水分子之外的极性小分子链——尿素分子链,再次展现这种通过偶极相互作用来实现分子层次的信息处理方式.对于人们设计新型的纳米信号传输器件、理解生物信号传递机制,这些研究具有重要的理论意义.

关键词：分子尺度信号信号传递与放大水分子偶极信号分子极性纳米受限空间

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生物分子表面水的生物功能研究

中国科学：物理学、力学、天文学 2016年第5期46卷 79-91页

作者：郭盼涂育松方海平中国科学院上海应用物理研究所中国科学院微观界面物理与探测重点实验室水科学与技术研究室上海201800 中国科学院大学北京100049 扬州大学物理科学与技术学院扬州225009

生物分子表面的水在蛋白、核酸、生物膜结构的形成、稳定以及功能的实现中发挥着重要作用.半个多世纪以来,生物分子表面水如何参与生物过程的问题,持续引发关注.然而,目前为止对水分子如何具体发挥生物功能却仍然知之甚少.本文介绍了当... 详细信息

生物分子表面的水在蛋白、核酸、生物膜结构的形成、稳定以及功能的实现中发挥着重要作用.半个多世纪以来,生物分子表面水如何参与生物过程的问题,持续引发关注.然而,目前为止对水分子如何具体发挥生物功能却仍然知之甚少.本文介绍了当前对生物分子表面水的微观结构和性质的一些研究及其进展,讨论了生物分子表面水的行为与实现生物功能的关系.最后,采用一个仿生表面的水行为,展现一个理解生物分子表面水以及生物分子表面水可能承载生物功能方面的新视角.

关键词：生物分子表面水水的潜在生物功能水的动力学行为水合层

Determination of the vapor–liquid transition of square-well particles using a novel generalized-canonical-ensemble-based method

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Chinese Physics B 2017年第6期26卷 8-13页

作者：赵亮徐顺涂育松周昕 College of Physical Science and Technology Yangzhou University Supercomputer Center Computer Network Information CenterChinese Academy of Sciences School of Physical Sciences University of Chinese Academy of Sciences

The square-well（SW） potential is one of the simplest pair potential models and its phase behavior has been clearly revealed, therefore it has become a benchmark for checking new theories or numerical methods. We introduce the generalized canonical ensemble（GCE） into the isobaric replica exchange Monte Carlo（REMC） algorithm to form a novel isobaric GCE-REMC method, and apply it to the study of vapor–liquid transition of SW particles. It is validated that this method can reproduce the vapor–liquid diagram of SW particles by comparing the estimated vapor–liquid binodals and the critical point with those from the literature. The notable advantage of this method is that the unstable vapor–liquid coexisting states,which cannot be detected using conventional sampling techniques, are accessed with a high sampling efficiency. Besides,the isobaric GCE-REMC method can visit all the possible states, including stable, metastable or unstable states during the phase transition over a wide pressure range, providing an effective pathway to understand complex phase transitions during the nucleation or crystallization process in physical or biological systems.

关键词： square-well particles phase-coexisting states generalized canonical ensemble replica exchange Monte Carlo

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液态水微观结构研究的新进展

物理 2010年第2期39卷 79-84页

作者：涂育松方海平中国科学院上海应用物理研究所上海201800

液态水有很多奇异特性.近年来,对液态水以何种微观结构形式存在的问题争议激烈.文章介绍了当前对水的微观结构的一些研究及其进展,讨论了液态水中的氢键模式与水的结构关系,进而用一个简化模型探讨了氢键的取向性与强弱性对水的异常行... 详细信息

液态水有很多奇异特性.近年来,对液态水以何种微观结构形式存在的问题争议激烈.文章介绍了当前对水的微观结构的一些研究及其进展,讨论了液态水中的氢键模式与水的结构关系,进而用一个简化模型探讨了氢键的取向性与强弱性对水的异常行为的作用.

关键词：液态水局域结构强弱氢键水的异常行为

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完善机制提升城市管理综合行政执法水平

中华建设 2021年第11期 34-35页

作者：涂育松福建省大田县城建监察大队

目前,国内城市管理综合水准显著提升,然而,在管理相应的行政执法进程中依旧出现各种各样的问题,比如法律法规不健全、管理人员素质薄弱、工作体制不完善等严重干扰了行政执法工作成效,造成城市建设规划管理难、管理人员与商家及摊贩矛...

目前,国内城市管理综合水准显著提升,然而,在管理相应的行政执法进程中依旧出现各种各样的问题,比如法律法规不健全、管理人员素质薄弱、工作体制不完善等严重干扰了行政执法工作成效,造成城市建设规划管理难、管理人员与商家及摊贩矛盾越发激烈,同时也严重干扰了城市现代化建设。

关键词：

有限时间尺度内分子指向相关的不对称扩散研究

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同方期刊数据库

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物理 2014年第7期43卷 439-445页

作者：盛楠涂育松方海平中国科学院上海应用物理研究所上海201800 扬州大学扬州225009

传统的经典扩散理论常常将分子和物体假设为球形,这些分子和物体的扩散是无偏移各向同性的。然而,当我们在纳米尺度去看分子和物体时,这些分子和物体呈现出各种不对称的结构。进一步,当我们观察的时间有限到小于几十纳秒时,我们会看到... 详细信息

传统的经典扩散理论常常将分子和物体假设为球形,这些分子和物体的扩散是无偏移各向同性的。然而,当我们在纳米尺度去看分子和物体时,这些分子和物体呈现出各种不对称的结构。进一步,当我们观察的时间有限到小于几十纳秒时,我们会看到这些分子和物体的自由扩散表现出与它们的初始方位相关的特性。对于像甲醇分子这样的小分子,在约100 ps的有限时间内,常温下,不对称扩散能占到总扩散的10%左右。这样的不对称扩散丰富了分子的扩散理论,对生命和其他自然界现象的理解具有重要的意义,同时也可能提供一种通过控制分子的方向来驱动分子的方法。

关键词：有限时间不对称扩散指向相关纳米尺度

Influence of atomic force microscope(AFM) probe shape on adhesion force measured in humidity environment

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Applied Mathematics and Mechanics(English Edition) 2014年第5期35卷 567-574页

作者：阳丽涂育松谭惠丽 College of Physics Science and Technology Guangxi Normal University Institute of Systems Biology Shanghai University

In micro-manipulation, the adhesion force has very important influence on behaviors of micro-objects. Here, a theoretical study on the effects of humidity on the adhesion force is presented between atomic force microscope （AFM） tips and substrate. The analysis shows that the precise tip geometry plays a critical role on humidity depen- dence of the adhesion force, which is the dominant factor in manipulating micro-objects in AFM experiments. For a blunt （paraboloid） tip, the adhesion force versus humidity curves tends to the apparent contrast （peak-to-valley corrugation） with a broad range. This paper demonstrates that the abrupt change of the adhesion force has high correla- tion with probe curvatures, which is mediated by coordinates of solid-liquid-vapor contact lines （triple point） on the probe profiles. The study provides insights for further under- standing nanoscale adhesion forces and the way to choose probe shapes in manipulating micro-objects in AFM experiments.

关键词： capillary force van der Waals force adhesion force curvatures probe shape,

Comparisons of Criteria for Analyzing the Dynamical Association of Solutes in Aqueous Solutions

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Chinese Physics Letters 2016年第3期33卷 123-126页

作者：赵亮涂育松王春雷方海平 College of Physical Science and Technology Yangzhou University Division of Interfacial Water and Key Laboratory of Interfacial Physics and Technology Shanghai Institute of Applied PhysicsChinese Academy of Sciences

How to determine accurately the association states of solutes in aqueous systems is of fundamental importance in a variety of chemical, physical, and biological processes, We apply four widely used criteria to analyze the dynamic association processes of solutes, e.g., amphiphilic molecules, and to find the inappropriate selections of representative sites on solutes in these criteria may bring about appreciable influence on the estimation of dynamic association behaviors such as unrealistic packing radii and even misleading packing structures. It would be better to select dynamically representative sites on solute molecules based on the characteristic of solute associations. Our detailed discussions give a guide on how to determine an appropriate criterion to accurately analyze the association behaviors of solute molecules in aqueous solutions.

关键词： of on is in for Comparisons of Criteria for Analyzing the Dynamical Association of Solutes in Aqueous Solutions