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通过构建蛋白质结构域功能模版库做基于氨基酸序列的蛋白质功能位点预测(英文)

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复旦学报（自然科学版） 2013年第6期52卷 768-778,783页

作者：安雄博武肖坤明灯明复旦大学生命科学学院生理学和生物物理学系上海200433

由蛋白质序列预测蛋白质功能位点对于理解蛋白质功能具有重大的意义,它同时也为生物学实验提供了重要依据.长期以来,基于知识库的方法一直是预测蛋白质功能位点的可靠方法.通过适当修改蛋白质结构分类库SCOP构建了一个附带功能注释的结... 详细信息

由蛋白质序列预测蛋白质功能位点对于理解蛋白质功能具有重大的意义,它同时也为生物学实验提供了重要依据.长期以来,基于知识库的方法一直是预测蛋白质功能位点的可靠方法.通过适当修改蛋白质结构分类库SCOP构建了一个附带功能注释的结构域模版库(fDPD),其中每个模版都包含一组序列和结构都非常相近的已知的蛋白质成员.fDPD通过隐马尔可夫模型方法HMMER由未知蛋白质的序列预测其功能位点.为了考察本方法的效果我们检测了两个通用的酶催化位点数据库,一个由约1 500个序列构成的钙离子结合蛋白数据库和从CASP9中提取出的数条蛋白质序列.我们的方法对于配体结合位点以及钙结合位点的预测取得了较高的精度和覆盖率,其催化位点的预测效果仅次于目前已知的最好的方法.我们的计算结果表明,结构上相似的蛋白质其功能位点倾向于出现在蛋白质表面上相似的位置.

关键词：功能位点预测 SCOP结构域 HMM FDPA fDPD

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肝病代谢物脂多糖检测的研究进展

南京工业大学学报（自然科学版） 2022年第6期44卷 600-614页

作者：李以婷明灯明杨雅琼南京工业大学生物与制药工程学院江苏南京211800 南京师范大学食品与制药工程学院江苏南京210023

肝癌是世界上发病率最高的恶性肿瘤之一,超过3/5的患者被发现时病程已经进入中晚期,因此肝癌的早期诊断尤为重要。肝病代谢物脂多糖(LPS)是革兰氏阴性细菌细胞膜的主要成分,是肝病早期诊断的关键指标,准确检测LPS含量对疾病的预防、诊... 详细信息

肝癌是世界上发病率最高的恶性肿瘤之一,超过3/5的患者被发现时病程已经进入中晚期,因此肝癌的早期诊断尤为重要。肝病代谢物脂多糖(LPS)是革兰氏阴性细菌细胞膜的主要成分,是肝病早期诊断的关键指标,准确检测LPS含量对疾病的预防、诊断和治疗具有重要意义。本文首先回顾LPS在生命代谢过程中的作用机制,LPS的结构和性质以及近年来LPS的主要检测技术,包括家兔热源法和内毒素鲎试剂测定法、气质联用法、酶联免疫吸附分析法、基于荧光/电化学生物传感器法;然后,分析各种方法的可行性、优缺点和脂多糖检测中存在的问题以及实际应用效果,以期为以脂多糖为检测目标物的肝病早期诊断和早期防治提供理论和数据支撑;最后,对脂多糖检测方法未来的发展方向进行展望。

关键词：肝病代谢物脂多糖检测传感器检测法革兰氏阴性细菌肝病早期诊治

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玉米赤霉烯酮检测方法研究进展

南京工业大学学报（自然科学版） 2020年第1期42卷 9-17页

作者：谭新柳黄菲缪文俊明灯明杨雅琼南京工业大学生物与制药工程学院江苏南京211800 南京工业大学药学院江苏南京211800

玉米赤霉烯酮是一种由镰刀菌分泌、广泛污染谷物类粮食作物的真菌毒素,其化学性质稳定,高温下难分解,且具有肝毒性和免疫毒性,严重威胁人类健康。因此,建立快速、灵敏、准确的玉米赤霉烯酮检测方法对食品安全具有重要的意义。本文结合... 详细信息

玉米赤霉烯酮是一种由镰刀菌分泌、广泛污染谷物类粮食作物的真菌毒素,其化学性质稳定,高温下难分解,且具有肝毒性和免疫毒性,严重威胁人类健康。因此,建立快速、灵敏、准确的玉米赤霉烯酮检测方法对食品安全具有重要的意义。本文结合国内外的研究进展,简述了玉米赤霉烯酮的检测方法,简要介绍了各种检测方法的原理及其在实际样品检测中的应用,为玉米赤霉烯酮的检测方法的探索起到重要的作用。

关键词：玉米赤霉烯酮真菌毒素食品安全检测方法

文体学理论方法参照下的词谱编撰--徐师曾《文体明辩·诗余》的贡献与意义

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学术研究 2024年第1期 166-174,178页

作者：刘尊明深圳大学人文学院广东深圳518060

徐师曾的《文体明辩·诗余》因长期受到《啸余谱》的遮蔽,故历代研究较为薄弱,或多关注其文体学一隅,或仅局限于词谱学的范围。实际上,徐师曾是在文体学理论方法的参照下编撰《诗余》图谱的,他借用了图谱的形式对独特而多样的词体进行... 详细信息

徐师曾的《文体明辩·诗余》因长期受到《啸余谱》的遮蔽,故历代研究较为薄弱,或多关注其文体学一隅,或仅局限于词谱学的范围。实际上,徐师曾是在文体学理论方法的参照下编撰《诗余》图谱的,他借用了图谱的形式对独特而多样的词体进行阐释和印证,对文体学和词谱学都做出了开拓和创新,因而具有双重理论价值和实践意义。具体表现在五个方面:其一是文体分辨与词谱编撰的结合与共存;其二是作品采选和文献征引的拓展与丰富;其三是图谱编撰和谱式设计的改进与创新;其四是词调分类和编排体例的创新与突破;其五是同调异体和词体分辨的开拓与深化。

关键词：徐师曾《文体明辩》诗余文体学词谱

负载UiO-66-NH2基光催化剂碳化木材的制备及其降解罗丹明B的性能研究

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负载UiO-66-NH2基光催化剂碳化木材的制备及其降解罗丹明B的性能...

作者：梁展明广西大学

学位级别：硕士

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乳及乳制品中抗生素残留检测研究进展

生物加工过程 2021年第3期19卷 329-336页

作者：王雪晴郝爱月谭新柳张立慧梅艳珍戴传超明灯明黄菲杨雅琼南京工业大学药学院江苏南京211800 南京师范大学生命科学学院江苏南京210046 南京师范大学食品与制药工程学院江苏南京210046

近年来,食品安全问题越来越引起社会的关注,而乳及乳制品作为动物源食品(牛奶,肉类等)中的重要来源,其安全问题更是涉及广泛,而其中的抗生素残留问题更是重中之重。主要介绍了牛奶中抗生素残留类别,其中包括四环素类抗生素、β内酰胺类... 详细信息

近年来,食品安全问题越来越引起社会的关注,而乳及乳制品作为动物源食品(牛奶,肉类等)中的重要来源,其安全问题更是涉及广泛,而其中的抗生素残留问题更是重中之重。主要介绍了牛奶中抗生素残留类别,其中包括四环素类抗生素、β内酰胺类抗生素以及氨基糖苷类抗生素,并阐述了牛奶中抗生素残留的危害。高灵敏、高特异性和快速检测的新型传感器将是未来乳及乳制品中抗生素检测的发展方向。重点介绍了抗生素残留目前使用的检测方法,包括微生物检测法、理化检测法和免疫分析法等,并从检测灵敏度、检测特异性和适用范围等方面,以及所存在的问题和发展方向进行了讨论与展望。

关键词：乳及乳制品抗生素残留检测方法

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近海工程多道地震高分辨率处理技术应用研究

铁道工程学报 2024年第6期41卷 17-22页

作者：刘振明周学明祁晓雨中国铁路设计集团有限公司天津300251

研究目的:跨海大桥、海底隧道等重大工程建设需要通过多道地震方法查明海域沉积层结构与厚度、断裂分布与活动性特征、基岩起伏与风化层厚度,以及特殊地质体分布范围等。但是在近海海域多道地震施工的条件受到诸多限制,如水深较浅、流... 详细信息

研究目的:跨海大桥、海底隧道等重大工程建设需要通过多道地震方法查明海域沉积层结构与厚度、断裂分布与活动性特征、基岩起伏与风化层厚度,以及特殊地质体分布范围等。但是在近海海域多道地震施工的条件受到诸多限制,如水深较浅、流速大、养殖区和渔业活动密集等,进而导致采集电缆较短且缺乏姿态控制,同时由于采集电缆较短产生覆盖次数少、速度分析困难等问题。最终获得的地震资料品质相对较差,存在信噪比低、多次波发育、电缆姿态不好等问题,需要进行针对性地分析和处理。研究结论:(1)地震数据经过联合噪声压制、多次波组合压制、提高覆盖次数、电缆时差校正等技术处理,显著提高了地震剖面的分辨率和信噪比;(2)处理后的地震剖面自浅至深各主要反射层的产状和构造形态清晰,地质现象清楚;(3)针对数据处理中遇到的噪声类型复杂、多次波压制难度大、速度分析困难等难点和挑战,总结出了一套适用于近海工程的多道地震数据处理技术流程,对后续近海工程高分辨率多道地震探测的数据处理工作具有一定的指导意义。

关键词：近海工程多道地震噪声压制多次波

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大倾角断层不良地质下TBM隧道稳定性分析

煤炭学报 2024年第S1期49卷 121-128页

作者：王利明隧道掘进机及智能运维全国重点实验室中铁隧道局集团有限公司

依托滇中引水大理Ⅰ段香炉山隧洞工程，利用自主研制的微型TBM掘进综合试验系统，开展了TBM穿越断层不良地质工况室内模型试验及数值模拟，研究高地应力下断层对TBM隧道稳定性的影响，分析总结隧道围岩应力应变变化规律及隧道破坏现象... 详细信息

依托滇中引水大理Ⅰ段香炉山隧洞工程，利用自主研制的微型TBM掘进综合试验系统，开展了TBM穿越断层不良地质工况室内模型试验及数值模拟，研究高地应力下断层对TBM隧道稳定性的影响，分析总结隧道围岩应力应变变化规律及隧道破坏现象，揭示断层不良地质卡机致灾机理。研究结果表明：利用微型TBM掘进综合试验平台成功实现了高地应力条件下TBM开挖大倾角断层工况相似模拟试验，隧道成型质量好。TBM掘进过程中隧道上部围岩首先产生裂缝，当TBM掘进至两种材料交接处时拱顶产生少许掉落，在TBM刀盘整体进入断层带后，拱顶产生大范围塌方，最终形成筒仓式塌落腔，隧道结构被破坏；受断层界面上方围岩滑动影响，原岩内(交界面下方)围岩压力整体呈现先增大后减小的趋势。TBM掘进时对掌子面前方围岩压力影响范围主要在0.43D～0.50D(D为洞径)，围岩压力最大增大1.19倍。隧道拱顶上方内部围岩位移随TBM掘进具有4个明显的变化阶段。上部围岩越靠近隧道轮廓线变形越大，TBM穿越断层交界面时围岩变形速率最大，对围岩内部位移影响范围主要在掌子面前方1.21D和上方1.50D以内，断层影响范围约在1.73H(H为断层交界面水平投影长度)以内。这主要是由于断层交界面上方松散围岩滑移松动，同时它极易导致TBM卡机，因此施工宜先对断层交界面处进行超前处理，降低TBM施工风险。

关键词：断层隧道稳定性室内模型试验数值分析围岩压力围岩内部位移

基于事件驱动的无人机吊挂系统在线自适应轨迹规划

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控制理论与应用 2024年第5期41卷 817-828页

作者：蔡佳明鲜斌天津大学电气自动化与信息工程学院天津300072

本文针对四旋翼无人机吊挂系统空运过程中负载摆角的非线性最优调节问题,提出了一种基于事件驱动的在线自适应轨迹规划策略.在事件驱动的自适应评价网框架下,利用神经网络的逼近学习能力得到吊挂负载摆动抑制的折现最优控制律.同时结合... 详细信息

本文针对四旋翼无人机吊挂系统空运过程中负载摆角的非线性最优调节问题,提出了一种基于事件驱动的在线自适应轨迹规划策略.在事件驱动的自适应评价网框架下,利用神经网络的逼近学习能力得到吊挂负载摆动抑制的折现最优控制律.同时结合该控制律进一步规划四旋翼无人机的飞行轨迹,实现了对无人机位置的精确调节和吊挂负载摆动的快速抑制,并且显著降低了无人机机载处理器的计算负担.然后采用基于Lyapunov稳定性的分析方法,证明了神经网络输出权值估计误差一致最终有界,并证明了无人机位置跟踪误差和吊挂负载摆动运动的收敛.最后,通过飞行对比实验验证了所提出的轨迹规划策略的有效性.

关键词：轨迹规划事件驱动无人机吊挂系统摆动抑制

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