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卷积神经网络在核小体定位识别中的应用

哈尔滨工程大学学报 2021年第5期42卷 751-758页

作者：崔颖施丹丹徐泽龙张兆功李建中哈尔滨医科大学生物信息科学与技术学院黑龙江哈尔滨150086 黑龙江大学计算机科学与技术学院黑龙江哈尔滨150080

为更准确识别核小体定位,本文提出一种基于Z曲线理论(Z-Curve)的卷积神经网络(CNN)方法,称为ZCN方法。ZCN方法以Z曲线三维坐标矩阵表示核小体序列特征,通过十倍交叉验证,进行卷积神经网络方法进行模型训练和验证,使用标准评估指标进行... 详细信息

为更准确识别核小体定位,本文提出一种基于Z曲线理论(Z-Curve)的卷积神经网络(CNN)方法,称为ZCN方法。ZCN方法以Z曲线三维坐标矩阵表示核小体序列特征,通过十倍交叉验证,进行卷积神经网络方法进行模型训练和验证,使用标准评估指标进行性能评价。结果表明:ZCN方法在酵母中具有良好的识别效能,敏感性Sn、准确性Sp、ROC曲线面积分别为92.4%、90.2%和0.9704,可推广到人类、线虫和果蝇的核小体定位识别中,其ROC曲线面积分别为0.796、0.940和0.772,与其他方法比较,进一步证实ZCN方法具有较好的识别效能和可推广性。在酵母全基因组进行核小体定位预测,发现16条染色体的预测准确率均值为78.83%,在基因GAL和GAL10中进行核小体定位预测,研究了降低假阳性的方法,给出了预测核小体定位的图谱。ZCN方法为研究核小体定位识别、预测及功能分析提供了有价值的方法和指导。

关键词：计算生物学卷积神经网络 Z曲线理论核小体 DNA序列连接区

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青藏高原地区人群棘球蚴病的分布特征

中国病原生物学杂志 2022年第2期17卷 243-246页

作者：施丹丹伍卫平中国疾病预防控制中心寄生虫病预防控制所(国家热带病研究中心) 国家卫生健康委员会寄生虫病原与媒介生物学重点实验室世界卫生组织热带病合作中心国家级热带病国际联合研究中心上海200025

棘球蚴病是一种由棘球绦虫幼虫引起的危害严重的人畜共患寄生虫病,在全球范围内广泛分布。青藏高原地区是我国棘球蚴病的高度流行区,了解其人群棘球蚴病的分布特征有助于制定针对性的棘球蚴病防治策略及采取有效的防治措施。本文从地区... 详细信息

棘球蚴病是一种由棘球绦虫幼虫引起的危害严重的人畜共患寄生虫病,在全球范围内广泛分布。青藏高原地区是我国棘球蚴病的高度流行区,了解其人群棘球蚴病的分布特征有助于制定针对性的棘球蚴病防治策略及采取有效的防治措施。本文从地区、时间和人群分布三方面对青藏高原地区人群棘球蚴病的分布特征进行综述。

关键词：棘球蚴病分布特征综述

母体血清25-羟维生素D3水平与妊娠期糖尿病发病的相关性

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上海医学 2019年第4期42卷 198-202页

作者：施丹丹张若曦上海交通大学医学院附属同仁医院妇产科

目的分析母体血清25-羟维生素D3水平与妊娠期糖尿病(GDM)发病的相关性。方法选择2015年1月—2017年6月在上海交通大学医学院附属同仁医院产科建立产前检查档案的4 478例孕妇为研究对象,根据孕妇妊娠早期空腹血糖(FBG)水平和口服葡萄糖... 详细信息

目的分析母体血清25-羟维生素D3水平与妊娠期糖尿病(GDM)发病的相关性。方法选择2015年1月—2017年6月在上海交通大学医学院附属同仁医院产科建立产前检查档案的4 478例孕妇为研究对象,根据孕妇妊娠早期空腹血糖(FBG)水平和口服葡萄糖耐量试验(OGTT)结果分为GDM组(465例)和正常组(4 013名)。分别测定两组孕妇的血清25-羟维生素D3和糖脂代谢产物水平,并分析其与GDM发病的相关性。结果 4 478例孕妇中GDM孕妇占10.38%。GDM组孕妇的维生素D不足发生率为38.71%(180/465),显著高于正常组的14.28%(573/4 013),两组孕妇维生素D不足的总发生率为16.82%(753/4 478);GDM组的25-羟维生素D3水平显著低于正常组(P<0.01)。GDM组孕妇的FBG、三酰甘油(TG)、低密度脂蛋白胆固醇(LDL-C)水平和稳态模型评估的胰岛素抵抗指数(HOMA-IRI)均显著高于正常组(P值均<0.01)。多元线性回归分析结果显示,25-羟维生素D3(OR=0.845,95%CI为0.807~0.878)和TG水平(OR=1.743,95%CI为1.321~1.934)均与孕妇GDM的发病相关(P值分别<0.01、0.05),其中25-羟维生素D3水平是孕妇GDM发病的保护因素,而TG水平是孕妇GDM发病的危险因素。妊娠早期血清25-羟维生素D3水平预测GDM发病的ROC曲线的AUC为0.845,以28.2 nmol/L为参考值,其诊断GDM的灵敏度、特异度、阳性预测值和阴性预测值分别为86.06%、83.60%、56.55%和95.90%。结论 25-羟维生素D3和TG水平可能是GDM发生的相关因素,GDM发病可能与体内25-羟维生素D3水平较低有关。

关键词：糖尿病,妊娠骨化二醇空腹血糖

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高中思想政治课系列化教学情境创设研究

现代教学 2021年第6期 43-46页

作者：施丹丹上海市澄衷高级中学上海200434

创设系列化教学情境,引导学生分析和解决情境问题是落实学科核心素养的一个重要策略。依据由知而识、由浅入深、由此及彼系列化教学情境创设的三个原则,在教学实践的基础上梳理了系列化教学情境具体创设的思路,即创设复杂度逐步提升的情... 详细信息

创设系列化教学情境,引导学生分析和解决情境问题是落实学科核心素养的一个重要策略。依据由知而识、由浅入深、由此及彼系列化教学情境创设的三个原则,在教学实践的基础上梳理了系列化教学情境具体创设的思路,即创设复杂度逐步提升的情境,并以“情境+”的方式整合问题、活动,进而帮助学生掌握学科知识、提高思辨能力、树立正确的价值观。

关键词：高中思想政治课系列化教学情境

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浅析新媒体在环保宣传和舆论引导中的作用

环境教育 2021年第9期 36-38页

作者：施丹丹南通市环境保护宣传教育中心

在信息化时代,环境宣传工作需要借助各种新媒体平台,传统媒介与新媒体创新融合,借助新媒体强大的宣传优势,有效提高公众的环境保护意识,更好地推进环保宣传工作。宣传工作是环保人的优良传统和环保事业的重要组成部分。宣传教育不是生产... 详细信息

在信息化时代,环境宣传工作需要借助各种新媒体平台,传统媒介与新媒体创新融合,借助新媒体强大的宣传优势,有效提高公众的环境保护意识,更好地推进环保宣传工作。宣传工作是环保人的优良传统和环保事业的重要组成部分。宣传教育不是生产力,但是能够促进生产力,也能够抵消甚至毁损生产力;我们要是不会说,很多事情会事倍功半。

关键词：新媒体平台传统媒介环境保护意识环保事业宣传教育媒体信息化时代宣传优势

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水墨画教学在幼儿美术教学中的探索与实践

中国科技经济新闻数据库教育 2021年第2期 8-9页

作者：施丹丹浙江省杭州市萧山区瓜沥镇第三幼儿园浙江杭州311241

新课程改革思想逐步融入到幼儿园的日常教学引导中,要求幼儿园在日常活动的开展中全面强化幼儿的综合素质。因此,在幼儿美术课堂的指导内,教师应践行先进思想,将水墨画融入指引过程中,通过水墨画让幼儿了解传统文化艺术,让幼儿能够增强... 详细信息

新课程改革思想逐步融入到幼儿园的日常教学引导中,要求幼儿园在日常活动的开展中全面强化幼儿的综合素质。因此,在幼儿美术课堂的指导内,教师应践行先进思想,将水墨画融入指引过程中,通过水墨画让幼儿了解传统文化艺术,让幼儿能够增强在美术课堂学习中的体会,通过水墨画的知识教学讲解,幼儿的潜力会得到有效的开发。通过水墨画丰富幼儿想象力、创造力和综合学习能力,在实践中提升幼儿的综合学习素养,让幼儿感受到传统文化魅力,为幼儿的茁壮成长提供条件。基于此,文章中主要分析了水墨画在幼儿美术教学中的引导策略。

关键词：水墨画教学幼儿美术探索实践分析

循证护理在蒙药沙参四味汤联合化疗治疗肺部肿瘤中的应用效果

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中国民族医药杂志 2023年第3期29卷 79-80页

作者：施丹丹河南科技大学第一附属医院肿瘤内科河南洛阳471000

目的:探究循证护理在蒙药沙参四味汤联合化疗治疗肺部肿瘤中的应用效果。方法:从河南科技大学第一附属医院收治的肺部肿瘤患者中抽取78例作为研究对象,随机分为对照组与研究组,每组39例。对照组在治疗期间给予常规的护理方法,研究组则... 详细信息

目的:探究循证护理在蒙药沙参四味汤联合化疗治疗肺部肿瘤中的应用效果。方法:从河南科技大学第一附属医院收治的肺部肿瘤患者中抽取78例作为研究对象,随机分为对照组与研究组,每组39例。对照组在治疗期间给予常规的护理方法,研究组则在联合治疗中实施循证护理措施。对比两组护理总有效率、不良反应发生率及生活质量。结果:在护理总有效率上,研究组明显高于对照组;在不良反应发生率上,研究组明显低于对照组;在生活质量上,研究组的评分均明显高于对照组,组间差异有统计学意义(P<0.05)。结论:对于肺部肿瘤在给予蒙药沙参四味汤联合化疗治疗后实施循证护理是科学合理的,能够提高护理效果,减少不良反应,在各方面提高生活质量。

关键词：循证护理蒙药沙参四味汤肺部肿瘤