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基于改进遗传算法的蛋白质三维折叠模拟

分析化学 2009年第1期37卷 57-61页

作者：李绍新张延娇广东医学院物理教研室广东医学院生理科学实验室

根据氨基酸的序列预测蛋白质的空间结构在基因治疗药物分子设计等方面有巨大的潜在应用价值。本研究基于HP格子模型利用改进的遗传算法预测了蛋白质的三维空间结构。改进的遗传算法引入了克隆体数量限制策略、巢穴竞争选择策略及局部优... 详细信息

根据氨基酸的序列预测蛋白质的空间结构在基因治疗药物分子设计等方面有巨大的潜在应用价值。本研究基于HP格子模型利用改进的遗传算法预测了蛋白质的三维空间结构。改进的遗传算法引入了克隆体数量限制策略、巢穴竞争选择策略及局部优化策略等。实验结果表明,改进的遗传算法显著地提高了蛋白质结构的预测效率,模拟的蛋白质结构紧凑,更接近真实蛋白质的构型。

关键词：遗传算法蛋白质折叠三维HP模型

上皮钠离子通道阻滞剂阿米洛利对雌性大鼠骨代谢的影响

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中国老年学杂志 2018年第22期38卷 5536-5539页

作者：张延娇陈博广东医科大学基础医学院生理科学实验室广东东莞523808

目的探讨上皮钠离子通道阻滞剂阿米洛利对雌性大鼠骨代谢的作用。方法 40只SD雌性大鼠随机分成5组,每组8只,分别为基础对照组、假手术组、假手术组+阿米洛利组、去卵巢组、去卵巢+阿米洛利组,连续灌胃给药55 d,测定血碱性磷酸酶、血清... 详细信息

目的探讨上皮钠离子通道阻滞剂阿米洛利对雌性大鼠骨代谢的作用。方法 40只SD雌性大鼠随机分成5组,每组8只,分别为基础对照组、假手术组、假手术组+阿米洛利组、去卵巢组、去卵巢+阿米洛利组,连续灌胃给药55 d,测定血碱性磷酸酶、血清雌二醇、N端骨钙素、股骨下段骨量变化。结果生长期大鼠去卵巢2个月,可成功建立大鼠骨质疏松模型。阿米洛利促进去卵巢大鼠骨丢失,对假手术大鼠骨量无明显影响。结论 10 mg·kg^(-1)·d^(-1)阿米洛利加剧去卵巢大鼠骨高转换下的骨丢失。

关键词：上皮钠离子通道阻滞剂雌激素骨质疏松

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改进的遗传算法在蛋白质结构预测中的应用

华南师范大学学报（自然科学版） 2009年第1期41卷 56-60页

作者：李绍新张延娇广东医学院物理教研室广东湛江524023 广东医学院生理科学实验室广东湛江524023

为了提高蛋白质结构预测效率,针对蛋白质HP模型折叠问题,在标准遗传算法的基础上,提出了一系列改进的搜索策略:控制群体中全同体数目,保持群体多样性;在交叉阶段实施单点交叉父子竞争提高个体生存竞争力;对最优个体实施系统变异局部优化... 详细信息

为了提高蛋白质结构预测效率,针对蛋白质HP模型折叠问题,在标准遗传算法的基础上,提出了一系列改进的搜索策略:控制群体中全同体数目,保持群体多样性;在交叉阶段实施单点交叉父子竞争提高个体生存竞争力;对最优个体实施系统变异局部优化等.实验结果表明,与标准遗传算法相比,改进后的遗传算法较大幅度地提高了搜索效率和成功率,遗传算法在蛋白质空间结构预测上是一个有相当潜力的算法.

关键词：遗传算法蛋白质折叠 HP模型

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哌嗪雌酚酮对骨质疏松小鼠骨和子宫的影响

中国老年学杂志 2010年第6期30卷 767-769页

作者：张延娇李青南郑虎翁玲玲广东医学院广东东莞523808 广东药学院生命科学与生物制药学院四川大学华西医学中心药学院

目的研究新型雌激素——哌嗪雌酚酮(PE)对去卵巢骨质疏松小鼠骨代谢及子宫的影响。方法将60只昆明种小鼠,体重30～35g,随机分6组,正常对照组,去卵巢模型组(Ovx组),Ovx+PE0.5mg/kg组,Ovx+PE1.0mg/kg组,Ovx+PE2.0mg/kg组,Ovx+雌酚酮(E)0.7... 详细信息

目的研究新型雌激素——哌嗪雌酚酮(PE)对去卵巢骨质疏松小鼠骨代谢及子宫的影响。方法将60只昆明种小鼠,体重30～35g,随机分6组,正常对照组,去卵巢模型组(Ovx组),Ovx+PE0.5mg/kg组,Ovx+PE1.0mg/kg组,Ovx+PE2.0mg/kg组,Ovx+雌酚酮(E)0.71mg/kg组。去卵巢后连续灌胃给药42d,处死小鼠后行骨代谢相关指标检测、骨组织胶原染色及子宫病理学检查。结果PE能预防去卵巢小鼠的骨丢失,高剂量组有统计学意义(P<0.05),与模型组比较,中、高剂量组能够显著的提高去卵巢小鼠骨内羟脯氨酸的含量(P<0.01,P<0.05);对单位骨重骨钙、骨磷含量无明显影响;与雌酚酮组比较,对骨质疏松小鼠子宫的作用较弱。结论PE主要是通过提高骨组织胶原的含量维持骨量,对子宫表现出弱刺激作用。

关键词：哌嗪雌酚酮骨质疏松去卵巢骨子宫

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机能学实验室开放模式的研究

现代医药卫生 2012年第23期28卷 3656-3658页

作者：陈博张延娇广东医学院生理科学实验室广东东莞523808

实验室开放已经成为高校提高学生实践水平、优化资源利用的重要手段。从实验室开放的方法、模式等方面阐述实验室开放的重要意义,实践探索出实验室开放的最佳途径,充分发挥了实验室在培养高质量医学人才中的重要作用。

关键词：教学方法教育改革实验室开放模式机能学实验

新型雌激素哌嗪雌酚酮对雌激素受体表达的影响及其对靶基因的转录激活作用

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中国药理学通报 2009年第12期25卷 1599-1601页

作者：张延娇李青南郑虎翁玲玲王永东广东医学院生理科学实验室广东东莞523808 广东药学院生命科学与生物制药学院广东广州510006 四川大学华西医学中心药学院四川成都610041 东莞理工学院化学与环境工程学院广东东莞523808

目的探讨哌嗪雌酚酮对雌激素受体表达的影响及其对靶基因ERE的转录激活作用。方法小鼠去卵巢后,每天灌服不同剂量的哌嗪雌酚酮(0.5、1、***-1)以及雌酚酮(***-1),连续42d,采用免疫组织化学的方法观察哌嗪雌酚酮对去卵巢小鼠子宫中两种... 详细信息

目的探讨哌嗪雌酚酮对雌激素受体表达的影响及其对靶基因ERE的转录激活作用。方法小鼠去卵巢后,每天灌服不同剂量的哌嗪雌酚酮(0.5、1、***-1)以及雌酚酮(***-1),连续42d,采用免疫组织化学的方法观察哌嗪雌酚酮对去卵巢小鼠子宫中两种雌激素受体(ERα和ERβ)蛋白表达的影响;采用Tfx-50脂质体共转染目的基因和报告基因于MCF-7细胞株,探讨哌嗪雌酚酮对ERE的转录激活作用。结果与去卵巢模型组比较,哌嗪雌酚酮各剂量组能够上调子宫组织中两种雌激素受体亚型的表达(有剂量依赖性),对ERα亚型作用明显于ERβ;哌嗪雌酚酮能够激活雌激素受体的经典信号途径,与等摩尔剂量的雌酚酮相比仅表现出弱雌激素活性。结论哌嗪雌酚酮能够上调子宫组织中ERs的表达;与雌酚酮比较,其对靶基因ERE的转录激活作用非常微弱。

关键词：哌嗪雌酚酮雌酚酮雌激素受体(ER) 雌激素反应元件(ERE) 子宫免疫组化

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ER-β的研究现状及其组织分布

中国新医药 2003年第12期2卷 44-46页

作者：张延娇李青南广东医学院524023

雌激素替代疗法一直被认为是防治绝经后期因雌激素分泌不足所引发的潮热、阴道干燥、和骨丢失等临床症状的经典治疗手段。而雌激素在体内的活性主要是通过其靶器官内的相应受体起效的。近年来，随着ER研究的日益深入，雌激素在体内的作... 详细信息

雌激素替代疗法一直被认为是防治绝经后期因雌激素分泌不足所引发的潮热、阴道干燥、和骨丢失等临床症状的经典治疗手段。而雌激素在体内的活性主要是通过其靶器官内的相应受体起效的。近年来，随着ER研究的日益深入，雌激素在体内的作用机制日趋得以阐明。继1986年，ER-a基因的克隆与定位。

关键词： ER 体内雌激素替代疗法组织分布潮热绝经后期治疗手段临床症状防治克隆

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ER作用机制及其信号传导的研究现状

中国骨质疏松杂志 2004年第2期10卷 244-248页

作者：张延娇李青南广东医学院骨生物实验室湛江524023

雌激素维持许多器官生长和分化,以及组织细胞的正常生理功能起着重要的作用,也是一些恶性肿瘤(乳腺癌、子宫内膜癌)的一个危险因素.雌激素在体内的活性主要是通过其靶器官内的相应受体起效的.近年来,随着分子生物学在科学研究中的应用,... 详细信息

雌激素维持许多器官生长和分化,以及组织细胞的正常生理功能起着重要的作用,也是一些恶性肿瘤(乳腺癌、子宫内膜癌)的一个危险因素.雌激素在体内的活性主要是通过其靶器官内的相应受体起效的.近年来,随着分子生物学在科学研究中的应用,与雌激素相关的生理、病理机制研究的日益深入,雌激素在体内的作用机制也日趋得以阐明.继1986年,ER-α基因的克隆与定位.1996年又克隆出一种新的ER被命名为ER-β[1].ER-β的发现和分离为雌激素在其靶器官的作用机制提供了更加完备的解释,为相关疾病鉴别新的治疗靶点和开发理想的靶向类新药提供了依据.本文作者就ER的基因定位,结构特点、作用机制以及信号传导综述如下.

关键词： ER 信号传导雌激素转录活性病理机制生理机制

动态光散射测定电介质溶液中蛋白质HAMAKER常量实验研究

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东莞理工学院学报 2007年第5期14卷 52-57页

作者：李绍新张延娇广东医学院物理教研室广东东莞523808 广东医学院生理科学实验室广东东莞523808

通过动态光散射技术间接的测量了电介质溶液中蛋白质的Hamaker常量。溶液中粒子的扩散系数对浓度的一阶线性依赖关系主要取决于粒子在溶液中所占的体积分数和粒子间的排斥力与吸引力.通过动态光散射技术测量不同离子强度不同浓度蛋白分... 详细信息

通过动态光散射技术间接的测量了电介质溶液中蛋白质的Hamaker常量。溶液中粒子的扩散系数对浓度的一阶线性依赖关系主要取决于粒子在溶液中所占的体积分数和粒子间的排斥力与吸引力.通过动态光散射技术测量不同离子强度不同浓度蛋白分子的扩散系数,根据扩散系数随蛋白浓度变化的斜率与离子浓度变化的相关性,回归出蛋白的Hamaker常量和蛋白的有效电荷.

关键词：动态光散射蛋白相互作用扩散系数 Hamaker常量