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冬瓜实时荧光定量PCR内参基因的筛选与评价

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园艺学报 2024年第4期51卷 748-760页

作者：何长霞罗陈闫晋强刘文睿王敏谢大森吴智明江彪仲恺农业工程学院园艺园林学院广州510225 广东省农业科学院蔬菜研究所广东省蔬菜新技术研究重点实验室广州510640

运用3种统计学软件GeNorm、NormFinder和BestKeeper分析冬瓜9个内参基因(18SrRNA、ACT、CYP、EF-1α、F-box、GAPDH、TUA、TUB和UBQ)在冬瓜不同组织(根、茎、叶、雄花、雌花和子房)、不同发育时期果实(授粉后0、10和20 d)、生物胁迫(疫... 详细信息

运用3种统计学软件GeNorm、NormFinder和BestKeeper分析冬瓜9个内参基因(18SrRNA、ACT、CYP、EF-1α、F-box、GAPDH、TUA、TUB和UBQ)在冬瓜不同组织(根、茎、叶、雄花、雌花和子房)、不同发育时期果实(授粉后0、10和20 d)、生物胁迫(疫霉侵染)和非生物胁迫(盐、高温和低温处理)植物叶片样品中的表达稳定性。结果表明,在不同组织中,EF-1α的表达稳定性最好;在不同发育时期果实和疫霉处理植物叶片中,F-box的表达稳定性最好;在盐胁迫处理植物叶片中,18SrRNA表现出较强的稳定性;在高温胁迫处理植物叶片中,ACT的表达稳定性最好;在低温胁迫处理植物叶片中,TUA的稳定性最好。

关键词：冬瓜实时荧光定量PCR 内参基因

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复方生脉成骨胶囊修复激素性股骨头坏死的作用机制

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中国组织工程研究 2024年第2期28卷 200-207页

作者：林天烨吴智明张文胜何晓铭何敏聪张庆文何伟魏秋实李子祺广东省中医骨伤研究院广东省广州市510405 广州中医药大学第三附属医院广东省广州市510405 广州中医药大学第一临床医学院广东省广州市510080

背景:复方生脉成骨胶囊治疗早期激素性股骨头坏死的疗效佳,但具体治疗机制尚不完全明确。目的:观察复方生脉成骨胶囊干预对激素性股骨头坏死大鼠骨组织中岩藻糖基转移酶8、成骨基因及Wnt/β-catenin信号通路蛋白表达的影响。方法:取60... 详细信息

背景:复方生脉成骨胶囊治疗早期激素性股骨头坏死的疗效佳,但具体治疗机制尚不完全明确。目的:观察复方生脉成骨胶囊干预对激素性股骨头坏死大鼠骨组织中岩藻糖基转移酶8、成骨基因及Wnt/β-catenin信号通路蛋白表达的影响。方法:取60只雄性SD大鼠,采用随机数字表法分为空白组、模型组、中药低剂量组、中药中剂量组及中药高剂量组,每组12只。模型组和中药低、中、高剂量组通过皮下注射咪喹莫特(每2周一次,共2次)与臀肌注射甲强龙(1次/周,共4次)的方法建立激素性股骨头坏死模型,末次造模给药后第2天,中药低、中、高剂量组分别灌胃给予1.89,3.78,7.56 g/(kg·d)的复方生脉成骨胶囊溶液,模型组灌胃给予等量生理盐水,连续给药8周。给药结束后,分别进行股骨头micro-CT扫描、组织学染色、压缩实验、RT-qPCR及Western blot检测。结果与结论:①micro-CT扫描显示,与空白组比较,模型组大鼠骨小梁体积分数、骨小梁数量及骨小梁厚度减少(P<0.05),骨小梁离散度增加(P<0.05);与模型组比较,中药低、中、高剂量组骨小梁体积分数、骨小梁数量及骨小梁厚度增加(P<0.05),骨小梁离散度减少(P<0.05),且呈剂量依赖性。②苏木精-伊红染色显示,与模型组比较,中药低、中、高剂量组空骨陷窝率减少(P<0.05),且呈剂量依赖性;免疫组化染色显示,与空白组比较,模型组岩藻糖基转移酶8、Runx2、骨形态发生蛋白2的蛋白表达降低(P<0.05);与模型组比较,中药低、中、高剂量组岩藻糖基转移酶8、Runx2、骨形态发生蛋白2的蛋白表达升高(P<0.05),且呈剂量依赖性。③压缩实验显示,与模型组相比,中药低、中、高剂量组股骨头最大载荷及弹性模量升高(P<0.05),且呈剂量依赖性;④RT-qPCR及Western blot检测显示,与空白组相比,模型组岩藻糖基转移酶8、Runx2、碱性磷酸酶、骨钙素、成骨细胞特异性转录因子及骨形态发生蛋白2的mRNA与蛋白表达降低(P<0.05);与模型组相比,中药低、中、高剂量组上述指标的mRNA与蛋白表达升高(P<0.05),且呈剂量依赖性。与空白组比较,模型组Wnt2、低密度脂蛋白受体相关蛋白5及β-连环蛋白的mRNA与蛋白表达降低(P<0.05),糖原合成酶激酶3β的mRNA与蛋白表达升高(P<0.05);与模型组比较,中药低、中、高剂量组Wnt2、低密度脂蛋白受体相关蛋白5及β-连环蛋白的mRNA与蛋白表达升高(P<0.05),糖原合成酶激酶3β的mRNA与蛋白表达降低(P<0.05),且呈剂量依赖性。⑤结果表明,复方生脉成骨胶囊治疗激素性股骨头坏死的机制可能是通过上调岩藻糖基转移酶8表达来激活Wnt/β-catenin信号通路,促进骨形成。

关键词：激素性股骨头坏死复方生脉成骨胶囊岩藻糖基转移酶8 成骨核心岩藻糖基化

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辣椒基因组学研究进展

广东农业科学 2024年

作者：程蛟文赖泽培董骥驰覃成吴智明廖毅陈长明宋钊陈木溪崔竣杰宋建文胡开林华南农业大学园艺学院/农业农村部华南地区园艺作物生物学与种质创制重点实验室仲恺农业工程学院园艺园林学院遵义职业技术学院现代农业系/贵州省遵义辣椒种质资源保护及繁育种植工程研究中心广东省农业科学院蔬菜研究所广东和利农生物种业股份有限公司佛山大学食品科学与工程学院

辣椒是我国重要蔬菜作物和调味品之一。开展辣椒基因组学研究对于认识辣椒遗传与进化、挖掘辣椒重要功能基因以及利用生物技术开展品种遗传改良等具有重要意义。2014年辣椒基因组草图发布标志着辣椒步入基因组学研究时代。近10年来，辣... 详细信息

辣椒是我国重要蔬菜作物和调味品之一。开展辣椒基因组学研究对于认识辣椒遗传与进化、挖掘辣椒重要功能基因以及利用生物技术开展品种遗传改良等具有重要意义。2014年辣椒基因组草图发布标志着辣椒步入基因组学研究时代。近10年来，辣椒基因组学研究取得显著进展，深入揭示辣椒基因组的基本特征，并初步构建辣椒泛基因组。同时，辣椒基因组学还在探究辣椒种间分化和基因渗入、解析辣椒重要性状进化机制、阐明辣椒遗传多样性特征、揭示辣椒人工驯化特征、追溯辣椒全球扩张传播历史和发掘辣椒重要性状控制基因等方面得到广泛应用。该文主要回顾和总结过去近10年辣椒基因组研究领域取得的进展，并对构建更高质量辣椒参考基因组和泛基因组以及完善辣椒功能基因组学研究平台进行展望，旨在为辣椒基因组学及其相关应用研究提供参考。

关键词：辣椒基因组学种间分化基因渗入遗传多样性人工驯化扩张传播

赤泥保温材料烧结过程中液相形成温度与分解型发泡剂分解温度匹配研究

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成都理工大学学报（自然科学版） 2023年第4期50卷 504-512页

作者：刘全吴智明王轩中国地质大学计算机网络中心北京100083 中国地质大学材料科学与工程学院北京100083

为了获得烧结法制备保温材料发泡剂的选择依据,为高温烧结法制备保温材料提供可利用的规律,以山西某公司提供的赤泥为主要原料,通过双氧水室温发泡和高温发泡剂在煅烧过程中的二次发泡,制备赤泥基保温材料。通过选用发泡温度不同的高温... 详细信息

为了获得烧结法制备保温材料发泡剂的选择依据,为高温烧结法制备保温材料提供可利用的规律,以山西某公司提供的赤泥为主要原料,通过双氧水室温发泡和高温发泡剂在煅烧过程中的二次发泡,制备赤泥基保温材料。通过选用发泡温度不同的高温发泡剂、加入影响赤泥保温材料液相形成温度的无定型SiO_(2)和陶瓷抛光废料调节保温材料烧结过程中液相形成温度,研究烧结过程中组织组成变化、保温材料导热系数、吸水率和抗压强度,探讨保温材料制备过程中液相形成温度与高温发泡剂的发泡温度间的匹配关系。结果表明高温发泡剂分解温度应该在基体软化温度以上,两个温度越接近,形成的材料导热系数越低。优化条件下高温发泡剂保温材料的导热系数为0.2832 W/(m·K),抗压强度为6.79 MPa。

关键词：赤泥发泡剂多孔保温材料导热系数

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葫芦科作物抗氧化基因的全基因组鉴定及分析

江苏农业科学 2023年第8期51卷 51-61页

作者：钱玉磊闫晋强刘文睿吴智明谢大森江彪广东省农业科学院蔬菜研究所/广东省蔬菜新技术研究重点实验室广东广州510640 仲恺农业工程学院园艺园林学院广东广州510225

抗氧化(oxidation resistance, OXR)基因是含有TLDc结构域的一类基因,能有效清除活性氧,在抗氧化过程中发挥着重要作用。基于葫芦科基因组数据库,从6个葫芦科作物中共鉴定出37个OXR成员,其中冬瓜、西瓜、甜瓜、葫芦和黄瓜均有6个成员,... 详细信息

抗氧化(oxidation resistance, OXR)基因是含有TLDc结构域的一类基因,能有效清除活性氧,在抗氧化过程中发挥着重要作用。基于葫芦科基因组数据库,从6个葫芦科作物中共鉴定出37个OXR成员,其中冬瓜、西瓜、甜瓜、葫芦和黄瓜均有6个成员,南瓜有7个成员。通过系统发育以及保守结构域分析,将这些OXR成员分为5个亚族:OXR1、OXR2、OXR3、OXR4和OXR5。OXR基因在染色体上呈不均匀分布,同一亚族OXR成员所编码的氨基酸数、分子量、外显子数、内含子数以及保守基序的排列模式都极为相似,表明OXR基因具有高度保守性。顺式作用元件分析结果显示,OXR基因的启动子区域含有多种顺式作用元件以及MYB转录因子的结合位点。基因复制分析发现,葫芦科OXR2成员通过片段复制或全基因组复制发生了一定扩张,这些复制基因对均受到纯化选择。共线性分析结果显示,在亲缘关系较近的葫芦科作物之间,OXR基因所在的共线性区块较大。不同组织的表达谱分析结果显示,葫芦科OXR4成员有相似的表达模式,在叶片中表达量均较高;OXR2亚族内复制基因出现了非对称表达的现象。

关键词：葫芦科 OXR基因保守结构域顺式作用元件生物信息学表达谱亲缘关系

新农村PC建筑应用BIM技术的SWOT分析

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湖北第二师范学院学报 2023年第2期40卷 35-41页

作者：吴智明莆田学院土木工程学院福建莆田351100

新农村建设中推广PC建筑及BIM技术是国家乡村振兴战略与美丽乡村建设的重要内容之一。新农村PC建筑应用BIM技术是乡村建筑工业化和信息化发展的耦合产物。本文通过文献研究、现场调研以及专家访谈等方式,对福建省新农村PC建筑应用BIM技... 详细信息

新农村建设中推广PC建筑及BIM技术是国家乡村振兴战略与美丽乡村建设的重要内容之一。新农村PC建筑应用BIM技术是乡村建筑工业化和信息化发展的耦合产物。本文通过文献研究、现场调研以及专家访谈等方式,对福建省新农村PC建筑应用BIM技术进行SWOT分析,分析与研究对象密切相关的各种主要内部优势、劣势、面临的外部机会和威胁;然后结合工程实践,展示出BIM技术在新农村PC建筑的设计、生产、运输、安装及运维各阶段应用的优势;最后给出了关于新农村PC建筑应用BIM技术的若干发展建议。

关键词：新农村乡村振兴 PC建筑 BIM技术 SWOT分析

基于组合赋权的新农村推广PC建筑影响因素分析

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海南大学学报（自然科学版） 2022年第4期40卷 415-425页

作者：吴智明祁皑莆田学院土木工程学院福建莆田351100 福州大学土木工程学院福建福州350108

针对城镇型新农村建设很少采用PC建筑的问题,通过文献检索、现场调研及专家访谈,构建出城镇型新农村推广PC建筑的影响因素指标体系.首先通过AHP法计算得出各指标的权重,然后考虑到AHP法较少考虑指标之间的相互影响,另采用DEMATEL法确定... 详细信息

针对城镇型新农村建设很少采用PC建筑的问题,通过文献检索、现场调研及专家访谈,构建出城镇型新农村推广PC建筑的影响因素指标体系.首先通过AHP法计算得出各指标的权重,然后考虑到AHP法较少考虑指标之间的相互影响,另采用DEMATEL法确定指标之间影响权重,最后运用博弈论将上述2种方法分别计算出的指标权重进行科学组合,使指标权重的确定更加合理.将理论方法运用于实际案例进行研究分析并从政策因素、市场因素、经济因素、技术因素和管理因素等5个方面分别给出对策建议.研究结果表明,影响城镇型新农村建设推广PC建筑的前五名因素分别是相关的政策支持和激励、社会对装配式的推广和接纳程度、产业链的完整度、建造成本和运输成本、标准化体系等,需要相关部门重点关注.

关键词：城镇型新农村 PC建筑 AHP法 DEMATEL法博弈论

辣椒染色质甲基化酶基因CaCMT1的克隆与表达分析

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分子植物育种 2022年

作者：韦丽丽庄泽岳欧雪连化青珠徐小万吴智明广东省农业科学院蔬菜研究所广东省蔬菜新技术研究重点实验室仲恺农业工程学院园艺园林学院

染色质甲基化酶(chromomethylase CMT)是植物体中DNA甲基转移酶的一种类型，主要负责维持CHG和CHH甲基化。为揭示辣椒染色质甲基化酶基因CaCMT1的结构特征及功能，本研究以一年生辣椒(Capsicum annuum L.)栽培种‘遵辣1号’(Zunla-1)为... 详细信息

染色质甲基化酶(chromomethylase CMT)是植物体中DNA甲基转移酶的一种类型，主要负责维持CHG和CHH甲基化。为揭示辣椒染色质甲基化酶基因CaCMT1的结构特征及功能，本研究以一年生辣椒(Capsicum annuum L.)栽培种‘遵辣1号’(Zunla-1)为试验材料，克隆CaCMT1基因全长，对其进行生物信息学分析及组织特异性表达分析。结果表明，CaCMT1编码序列全长2 253 bp，含有一个完整开放阅读框(ORF)，编码750个氨基酸，蛋白分子量为84.54 kDa，理论等电点4.92，不稳定系数为31.08，总平均亲水指数(GRAVY)为-0.344，为亲水稳定性蛋白。CaCMT1蛋白质二级结构包含α-螺旋(29.20%)、β-折叠(6.00%)、延伸链(17.87%)和无规则卷曲(46.93%)。同源性分析表明CaCMT1与茄子、本氏烟草、三叶裂薯和拟南芥的序列相似性分别为70.85%、68.65%、67.68%和47.20%，均含有BAH结构域和Cyt-c5-DNA-methylase结构域，且都有自身的高度保守性。预测CaCMT1基因启动子中含有激素响应元件、光响应元件、胁迫型响应元件等共27个作用元件。荧光定量表达分析表明，辣椒CaCMT1在不同组织中均有表达，但花中表达量最高且与其他组织有极显著差异，说明CaCMT1基因参与辣椒花器官的生长发育。本研究获得了辣椒CaCMT1基因序列及其表达情况，为探讨DNA甲基化调控辣椒花器官发育机制提供了有力的支持。

关键词：辣椒染色质甲基化酶基因克隆表达生物信息学

糖尿病合并尿道感染患者分离尿道致病性大肠埃希菌毒力因子、耐药性及NLRP3表达

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中华医院感染学杂志 2023年第6期33卷 842-846页

作者：吉娆媛吴智明云长缨何林海口市骨科与糖尿病医院检验科海南海口570311 海南医学院第二附属医院检验科海南海口570311

目的探讨糖尿病合并尿道感染患者尿道致病性大肠埃希菌(UPEC)毒力因子特点和耐药性,并分析UPEC对核苷酸结合寡聚化结构域样受体蛋白3(NLRP3)表达的影响。方法选取2019年1月-2021年5月海口市骨科与糖尿病医院105例糖尿病合并UPEC感染... 详细信息

目的探讨糖尿病合并尿道感染患者尿道致病性大肠埃希菌(UPEC)毒力因子特点和耐药性,并分析UPEC对核苷酸结合寡聚化结构域样受体蛋白3(NLRP3)表达的影响。方法选取2019年1月-2021年5月海口市骨科与糖尿病医院105例糖尿病合并UPEC感染患者为感染组,46例无泌尿系统感染的糖尿病患者为非感染组。收集感染组尿液分离UPEC以及非感染组粪便分离大肠埃希菌。检测大肠埃希菌毒力因子,并进行药敏试验。检测NLRP3 mRNA及NLRP3蛋白表达量、血清半胱氨酸蛋白酶(Caspase)-1、核转录因子(NF)-κB、白细胞介素(IL)-1β、IL-18水平。结果感染组UPEC毒力因子相关基因papC、fimH、hly、cnf1、aer的检出率分别为100.00%、51.43%、60.00%、35.24%、62.86%,非感染组检出率为0.00%、15.22%、10.87%、6.52%、28.26%(P<0.05)。感染组NLRP3 mRNA及NLRP3蛋白表达量均高于非感染组(P<0.05)。感染组血清Caspase-1、NF-κB、IL-1β和IL-18水平均高于非感染组(P<0.05)。结论 UPEC毒力因子相关基因papC、fimH、hly、cnf1、aer检出率较高,多药耐药严重,糖尿病患者UPEC感染的机制可能与NLRP3炎症小体激活有关。

关键词：糖尿病尿道致病性大肠埃希菌毒力因子核苷酸结合寡聚化结构域样受体蛋白3 耐药性