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不同类型标本中blaNDM基因和mcr-1～mcr-5基因的筛查和分析

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不同类型标本中blaNDM基因和mcr-1～mcr-5基因的筛查和分析

作者：吕东月青岛大学

学位级别：硕士

目的抗生素耐药性已成为全球公共卫生关注的焦点。本研究目的是确定bla (New Delhi metallo-β-lactamase)和mcr(mobile colistin resistance)基因在中国的分布特征,判断bla 和mcr基因的出现与碳青霉烯和多粘菌素类抗生素的选择性压力... 详细信息

目的抗生素耐药性已成为全球公共卫生关注的焦点。本研究目的是确定bla (New Delhi metallo-β-lactamase)和mcr(mobile colistin resistance)基因在中国的分布特征,判断bla 和mcr基因的出现与碳青霉烯和多粘菌素类抗生素的选择性压力的关系,为抗生素耐药的控制措施提供理论依据。方法本研究在2010-2020年之间随机选取中国的10个地区,采集家畜家禽、禽类屠宰环境、腹泻病人和野生动物的肠道标本,基于标本对bla 和mcr基因进行筛查。首先,对采集的标本进行核酸提取,然后对bla 和mcr基因进行PCR初筛,来确定标本中是否存在这两种基因,比较两种基因在不同来源的检出率并进行序列分析,对初筛存在突变的标本扩增开放阅读框(Open Reading Frame,ORF),并将获得的ORF序列与参考序列进行核苷酸和氨基酸比较,最后对bla 和mcr基因进行流行病学分析和序列分析。结果本研究在2010年-2019年间7个地区的标本中均有bla 和mcr基因的检出,但在2020年未检出这两种基因。总体来看,mcr基因的检出率(5.09%,356/6991)高于bla 基因的检出率(0.41%,29/6991)。不同标本来源的bla 和mcr基因的检出率也不同。其中,bla 基因的检出率在不同来源之间的差异具有统计学意义(P家畜家禽(0.88%)>腹泻病人(0.17%),而在野生动物中尚未检测到该基因;mcr基因的检出率在不同来源之间的差异也具有统计学意义(P家畜家禽(14.81%)>腹泻病人(1.43%)>野生动物(0.36%)。通过序列分析,本研究除了检出bla 、bla 、mcr-1.1、mcr-3.18、mcr-3.3、mcr-4.3外,还发现了多个新的mcr基因亚型——mcr-1.29、mcr-1.30、mcr-2.4、mcr-2.5、mcr-2.6、mcr-2.7、mcr-3.31、mcr-3.32,并已上传至Gen-Bank数据库。其中mcr-1.30、mcr-2.4、mcr-2.5、mcr-2.6、mcr-2.7、mcr-3.32均来自家畜家禽,mcr-1.29来自禽类屠宰环境,mcr-3.31来自野生动物。在地区分布方面,广西、安徽和云南有mcr新亚型的检出。本研究还发现了mcr-1分别与bla 、bla 、mcr-2、mcr-3、mcr-4共存于同一标本的现象,而且这些具有共存基因的肠道标本均来自家畜家禽(0.38%,7/1823)和禽类屠宰环境(0.86%,3/350)。另外,mcr-1和bla 共存的肠道标本仅在安徽检出,除了1份mcr-1.1和mcr-3.3基因共存的标本在安徽检出外,其余mcr-1和mcr其他基因型共存的肠道标本都是从广西检出的。结论我们的研究表明,bla 和mcr基因的出现与碳青霉烯和多粘菌素抗生素的选择性压力密切相关,应加强抗生素耐药性的监测与监督。我们基于标本直接进行基因检测的研究方法有望成为监督抗生素使用的策略之一。

关键词： blaNDM mcr 碳青霉烯多粘菌素耐药

耐药基因blaNDM-1和mcr-1在肠道细菌中的研究进展

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中国人兽共患病学报 2020年第8期36卷 660-664页

作者：吕东月汪照国王鑫青岛大学公共卫生学院青岛266021 中国疾病预防控制中心传染病预防控制所北京102206

随着抗菌药物的频繁使用,细菌耐药性已成为21世纪全球公共卫生共同关注的问题之一。全球相继发现碳青霉烯类抗生素耐药基因blaNDM-1和多黏菌素耐药基因mcr-1,两种耐药基因均能通过质粒水平转移,对人类造成严重威胁。本文就blaNDM-1基因... 详细信息

随着抗菌药物的频繁使用,细菌耐药性已成为21世纪全球公共卫生共同关注的问题之一。全球相继发现碳青霉烯类抗生素耐药基因blaNDM-1和多黏菌素耐药基因mcr-1,两种耐药基因均能通过质粒水平转移,对人类造成严重威胁。本文就blaNDM-1基因和mcr-1基因的发现、流行、耐药机制及检测方法等方面进行综述,以期能为严格控制抗生素的使用提供理论依据。

关键词：抗菌素 blaNDM-1 mcr-1 耐药性

基于思维导图的教学模式在生物会考复习中的应用研究

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基于思维导图的教学模式在生物会考复习中的应用研究

喜马拉雅旱獭自然感染鼠疫耶尔森菌后部分脏器病理变化的研究

广东教育学会教育现代化专业委员会“教科研课题研究与论文...

作者：吕东月深圳市宝安区凤凰学校

选择八年级的两个班级研究思维导图在初中生物复习中的应用效果,随机分为实验班级和对照班级。结果发现实验班级测试成绩高于对照班级,差异具有显著性(P≤005);实验班级的学生对基于思维导图的复习模式评价较好。这表明基于思维导图... 详细信息

选择八年级的两个班级研究思维导图在初中生物复习中的应用效果,随机分为实验班级和对照班级。结果发现实验班级测试成绩高于对照班级,差异具有显著性(P≤005);实验班级的学生对基于思维导图的复习模式评价较好。这表明基于思维导图的复习模式有利于激发学生的学习兴趣,营造良好的课堂教学氛围,不断提高课堂教学质量和教学效果。

关键词：思维导图初中生物复习教学

来源： cnki会议评论

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中国媒介生物学及控制杂志 2023年第1期34卷 9-13页

作者：张芃周永运吕东月贺兆锴段然秦帅汤德铭肖萌景怀琦王鑫中国疾病预防控制中心传染病预防控制所应急实验室北京102206 中国合格评定国家认可中心北京100062 上海市浦东新区疾病预防控制中心上海200120 杭州市疾病预防控制中心浙江杭州310021

目的了解喜马拉雅旱獭(旱獭)自然感染鼠疫耶尔森菌(鼠疫菌)所导致的脾质量和主要脏器的组织病理变化,揭示鼠疫的致病特点。方法分析2020-2021年获得的活体旱獭及自毙旱獭脾质量与体质量的比值,取正常旱獭以及感染鼠疫菌自毙旱獭的肝、... 详细信息

目的了解喜马拉雅旱獭(旱獭)自然感染鼠疫耶尔森菌(鼠疫菌)所导致的脾质量和主要脏器的组织病理变化,揭示鼠疫的致病特点。方法分析2020-2021年获得的活体旱獭及自毙旱獭脾质量与体质量的比值,取正常旱獭以及感染鼠疫菌自毙旱獭的肝、肺、脾脏3种器官制作病理切片,并观察组织病理学变化。结果感染鼠疫菌的自毙旱獭脾质量与体质量的比值明显高于未感染鼠疫菌的旱獭,且差异有统计学意义(χ^(2)=33.144,P<0.001)。感染鼠疫菌自毙旱獭的肝、肺、脾脏均有细胞形态被破坏,炎性细胞浸润,血管扩张等炎症病变,脾脏的血管损伤和红髓白髓的变化更为明显。结论鼠疫菌可引起旱獭机体产生严重的炎症反应,脾脏的病变对于探讨鼠疫菌的致病过程和机制更具研究意义。

关键词：鼠疫喜马拉雅旱獭病理学

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甘肃省野生岩羊不明原因死亡分析

中国媒介生物学及控制杂志 2022年第6期33卷 888-894页

作者：张丹色拥军付国明贺兆锴吕东月春花段然秦帅梁俊容肖萌景怀琦王鑫中国疾病预防控制中心传染病预防控制所应急实验室北京102206 甘肃盐池湾国家级自然保护区管理局甘肃肃北736300 甘肃省肃北蒙古族自治县疾病预防控制中心甘肃肃北736300 杭州市疾病预防控制中心浙江杭州310021 浦东新区疾病预防控制中心上海200120

目的探明甘肃省野生岩羊异常死亡的原因。方法运用分子克隆的方法,挑选多个样本核酸16S rRNA基因克隆子,通过测序技术得到基因序列,在美国国立生物技术信息中心(NCBI)数据库中用BLAST进行比对,并结合鞭毛蛋白基因多重PCR检测,进行死... 详细信息

目的探明甘肃省野生岩羊异常死亡的原因。方法运用分子克隆的方法,挑选多个样本核酸16S rRNA基因克隆子,通过测序技术得到基因序列,在美国国立生物技术信息中心(NCBI)数据库中用BLAST进行比对,并结合鞭毛蛋白基因多重PCR检测,进行死因探索。结果 2018年12月-2020年4月发现35只岩羊异常死亡,在4只岩羊的5个组织标本核酸中检测到致病梭状芽孢杆菌属细菌的16S rRNA基因序列,其中2只岩羊的3个标本核酸均是致病梭状芽孢杆菌属细菌丰度最高(61.90%~91.12%);其他标本核酸16S rRNA基因克隆子中,均是非梭状芽孢杆菌属细菌丰度最高,其中5只岩羊丰度最高的为反刍动物正常肠道细菌。结论多种梭状芽孢杆菌属细菌感染和消化道正常细菌的易位,可能分别是野生岩羊的主要致死原因和次要致死原因。

关键词：岩羊诺维梭状芽孢杆菌产气荚膜梭菌索氏梭状芽孢杆菌 16S rRNA基因鞭毛蛋白基因

bla_(NDM)和mcr-1~mcr-5基因在中国不同标本中的分布

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中国校医 2022年第1期36卷 21-25页

作者：郑效瑾吕东月俞全喜秦帅段然景怀琦王鑫阿克塞哈萨克族自治县疾病预防控制中心甘肃酒泉735000 浦东新区疾病预防控制中心肃北蒙古族自治县疾病预防控制中心中国疾病预防控制中心传染病预防控制所

目的了解碳青霉烯类耐药基因(bla_(NDM))和多粘菌素耐药基因(mcr)在中国不同地区不同类型标本中的分布特征,为抗生素耐药的监督与控制提供理论依据。方法2015—2020年在中国不同地区的城村养殖场及人烟稀少的高原牧区共采集人、家畜家... 详细信息

目的了解碳青霉烯类耐药基因(bla_(NDM))和多粘菌素耐药基因(mcr)在中国不同地区不同类型标本中的分布特征,为抗生素耐药的监督与控制提供理论依据。方法2015—2020年在中国不同地区的城村养殖场及人烟稀少的高原牧区共采集人、家畜家禽、禽类屠宰环境和野生动物标本4324份,对标本进bla_(NDM)和mcr基因的检测和序列分析。结果耐药基因bla_(NDM)和mcr-1~mcr-5的检出率为5.16%,检出了bla_(NDM-1)(0.58%)、bla_(NDM-24)(0.07%)、mcr-1.1(4.53%)、mcr-1.29(0.02%)、mcr-3.18(0.05%)、mcr-3.3(0.05%)、mcr-4.3(0.12%)共7种耐药基因亚型,其中以mcr-1.1亚型占比最多(87.89%);检测到携带共存基因bla_(NDM-1)+mcr-1.1、bla_(NDM-24)+mcr-1.1以及mcr-1.1+mcr-3.3;bla_(NDM)和mcr基因在禽类屠宰环境中分布最高(3.14%,16.00%),在野生动物中分布最少(0.00%,0.13%,P值均3);bla_(NDM)多分布于擦拭标本(Fisher's exact P<0.001),mcr多分布于饲养动物下消化道、环境水体、擦拭标本(χ^(2)=230.564,P<0.001);bla_(NDM)和mcr基因在城村养殖场标本中检出率为12.46%(203/1629)高于高原牧区的0.74%(20/2695)(χ^(2)=285.096,P<0.01)。结论中国不同类型标本中耐药基因bla_(NDM)和mcr基因普遍存在,人烟稀少地区中的检出率低于城村养殖场。

关键词： bla_(NDM)基因 mcr基因碳青霉烯多粘菌素

2014-2019年阜阳市食品和病人分离单增李斯特菌的分子特征分析

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中国人兽共患病学报 2020年第12期36卷 1019-1024页

作者：孟昭倩段然吕东月郭国侠郭靓子卜戈安徽省阜阳市疾病预防控制中心阜阳236000 中国疾病预防控制中心传染病预防控制所北京102206

目的比较分析阜阳市食品和病人分离单增李斯特菌的毒力基因、分子型别,建立阜阳市单增李斯特菌分子特征信息数据库,为防控单增李斯特菌病提供科学依据。方法对阜阳市2014-2019年分离自食品和病人的55株单增李斯特菌,用聚合酶链反应(PCR... 详细信息

目的比较分析阜阳市食品和病人分离单增李斯特菌的毒力基因、分子型别,建立阜阳市单增李斯特菌分子特征信息数据库,为防控单增李斯特菌病提供科学依据。方法对阜阳市2014-2019年分离自食品和病人的55株单增李斯特菌,用聚合酶链反应(PCR)检测其毒力基因prfA、plcB、hly、actA、iap、inlA;用脉冲场凝胶电泳(PFGE)技术进行分子分型及同源性分析;用多位点序列分型(MLST)技术进行分子分型和聚类分析。结果 55株单增李斯特菌全部携带prfA、plcB、hly、actA、iap、inlA基因;PFGE将其分为21个带型,相似度60.3%~100%;MLST将其分为14个ST型,ST9型为优势型别;3株病人分离菌株的PFGE带型和ST型互不相同,其中2株病人来源菌株分别与食品分离株具有相同PFGE带型和ST型。结论阜阳市食品和病人中分离的单增李斯特菌均携带6个毒力基因,食品分离菌株的分子型别呈现出多样性,其中存在同型别单增李斯特菌持续性污染现象,病人分离菌株具有与食品来源菌株相同的PFGE带型和ST型,提示食源性感染的风险较高。

关键词：单增李斯特菌毒力基因 PFGE MLST

改良分子信标-实时荧光PCR同时检测猪霍乱沙门菌和丙型副伤寒沙门菌

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卫生研究 2011年第4期40卷 514-516页

作者：林一曼石晓路朱玉梅邱亚群李迎慧吕东月扈庆华深圳市疾病预防和控制中心深圳518055 深圳市慢性病防治中心

目的建立猪霍乱沙门菌和丙型副伤寒沙门菌的实时荧光PCR快速检测方法,应用于食品和食物中毒病人标本的猪霍乱沙门菌检测以及沙门菌属C群的鉴别诊断。方法根据GenBank公布的猪霍乱沙门菌和丙型副伤寒沙门菌的保守序列(CP000857.1),设计... 详细信息

目的建立猪霍乱沙门菌和丙型副伤寒沙门菌的实时荧光PCR快速检测方法,应用于食品和食物中毒病人标本的猪霍乱沙门菌检测以及沙门菌属C群的鉴别诊断。方法根据GenBank公布的猪霍乱沙门菌和丙型副伤寒沙门菌的保守序列(CP000857.1),设计引物和改良分子信标探针,优化PCR程序和PCR成分,以11种细菌为对照,建立实时荧光PCR检测方法,并用71株常见血清型的沙门菌评价该方法的灵敏度和特异性,所建立的方法应用于70份食品样品的检测。结果该改良分子信标—荧光PCR方法的DNA最低检出限为10fg/反应体系,菌液最低检出限为20 CFU/反应体系;无交叉荧光信号产生。针对目标菌均出现特异荧光信号。对71株沙门菌属的检测,该方法的灵敏度和特异度为100%。70份食品样品用荧光PCR和传统方法检测猪霍乱沙门菌和丙型副伤寒沙门菌,结果均为阴性。该方法从菌株的核酸提取到检测仅需1.5小时,从样品处理到检测仅需1天时间。结论建立的实时PCR检测方法快速、灵敏度高、特异性强,可用于食品及食物中毒标本的猪霍乱沙门菌检测以及沙门菌属C群的鉴别诊断,保障食品安全。

关键词：改良分子信标实时荧光PCR 猪霍乱沙门菌丙型副伤寒沙门菌

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健康体检人群中高血压与临床指标相关性分析

中国校医 2020年第7期34卷 544-546页

作者：赵菊花吕东月秦帅景怀琦甘肃省肃北县人民医院内儿科甘肃酒泉736300 中国疾病预防控制中心传染病预防控制所

目的了解健康人群中高血压与临床指标的关系,以科学有效防控高血压。方法采用回顾性研究,选择2018年1月-2020年1月甘肃省肃北县某医院进行健康体检的患者作为研究对象,随机选择61例符合高血压组纳入标准的高血压患者作为观察组;随机抽... 详细信息

目的了解健康人群中高血压与临床指标的关系,以科学有效防控高血压。方法采用回顾性研究,选择2018年1月-2020年1月甘肃省肃北县某医院进行健康体检的患者作为研究对象,随机选择61例符合高血压组纳入标准的高血压患者作为观察组;随机抽取同期的61例符合非高血压组纳入标准的患者作为对照组,比较两组间各项临床指标的差异。结果观察组总蛋白(65.56±4.10)g/L、直接胆红素(4.33±2.82)mmol/L、肌酐(85.34±46.55)umol/L、胆固醇(4.84±1.06)mmol/L,均高于对照组水平:(63.52±5.42)g/L、(3.39±1.44)mmol/L、(71.42±17.37)umol/L、(4.71±0.87)mmol/L,差异有统计学意义(P>0.05)。两组的胆固醇、直接胆红素和高血压具有相关性,其中胆固醇与高血压呈正相关,OR值和95%CI分别为17.972和(2.209~146.204);直接胆红素与高血压呈负相关,相应OR值和95%CI分别为0.735和(0.559~0.967)。结论血清中的胆固醇和直接胆红素水平与高血压具有相关性,对高血压有很好的预警提示作用。

关键词：健康体检高血压相关分析