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基于因果森林的三阴性乳腺癌术后放疗的个性化疗效评价

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中国卫生统计 2023年第1期40卷 32-35,40页

作者：王喆毛倩管佩霞刘玉洁朱高培李承圣包绮晗王素珍潘庆忠石福艳潍坊医学院公共卫生学院 261053

目的基于因果森林对三阴性乳腺癌(triple negative breast cancer,TNBC)患者术后放疗的疗效进行个性化评估,为个体化治疗提供决策依据。方法基于美国SEER数据库收集TNBC患者资料,根据患者全乳切除术后是否接受放疗分为两组,采用倾向性... 详细信息

目的基于因果森林对三阴性乳腺癌(triple negative breast cancer,TNBC)患者术后放疗的疗效进行个性化评估,为个体化治疗提供决策依据。方法基于美国SEER数据库收集TNBC患者资料,根据患者全乳切除术后是否接受放疗分为两组,采用倾向性评分匹配法得到拟随机化数据;基于因果森林探索术后放疗的个性化疗效,并识别异质性亚组。结果大约84.88%患者能够从术后放疗中获益,且具备T3~T4期或≥4个淋巴结转移或有远处转移特征的TNBC患者受益可能性较大。识别出有代表性的四个亚组,在亚组1(T1~T2分期且年龄≤59岁)和亚组3(T3~T4分期且年龄≤48岁)中术后放疗对TNBC患者5年生存率影响无统计学意义(亚组1:HR=0.98,95%CI=0.76~1.27,P=0.87;亚组3:HR=0.82,95%CI=0.56~1.21,P=0.31),在亚组2(T1~T2分期且年龄>59岁)和亚组4(T3~T4分期且年龄>48岁)中术后放疗均可以降低TNBC患者5年死亡风险(亚组2:HR=0.65,95%CI=0.48~0.89,P<0.01;亚组4:HR=0.67,95%CI=0.53~0.86,P<0.01)。结论因果森林有助于评价个性化疗效,通过因果森林能够发现三阴性乳腺癌术后放疗有特定受益患者。

关键词：三阴性乳腺癌因果森林术后放疗异质性治疗效应

基于Apriori算法的布鲁菌病感染相关危险因素关联性

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中华疾病控制杂志 2023年第7期27卷 776-782页

作者：周立雯孙喜红丁子琛王浩桦丛慧文包绮晗王廉源杨毅李承圣石福艳王素珍潍坊医学院公共卫生学院卫生统计学教研室潍坊261053 济宁市疾病预防控制中心传染病防制科济宁272000

目的分析布鲁菌病(布病)感染相关危险因素间的关联作用,为制定布病防控措施提供依据。方法基于全国传染病疫情信息网络直报系统中济宁市2014-2017年数据,识别布病感染高发地区;在高发地区中采用多阶段整群抽样的方法,依靠问卷和血样检... 详细信息

目的分析布鲁菌病(布病)感染相关危险因素间的关联作用,为制定布病防控措施提供依据。方法基于全国传染病疫情信息网络直报系统中济宁市2014-2017年数据,识别布病感染高发地区;在高发地区中采用多阶段整群抽样的方法,依靠问卷和血样检测共调查2892人。通过二分类logistic回归分析模型分析布病的危险因素;运用Apriori算法挖掘相关危险因素的关联规则。结果有279人感染布病,感染率为9.65%;logistic回归分析模型显示养殖人员(OR=2.406,95%CI:1.726~3.353)、接触羊(OR=3.323,95%CI:2.448~4.511)、收购皮毛(OR=21.141,95%CI:14.154~31.577)是布病感染的危险因素,差异均有统计学意义(均P<0.001);Apriori算法共挖掘出以感染布病为后项的强关联规则203条,最大提升比为10.37,最小为6.22,不同的危险因素组合对布病感染的可能性在关联强度等方面存在差异。结论布病感染率较高,应重点关注畜牧养殖、羔羊接触及皮毛收购等重点人群;多种危险因素存在紧密关联性,应注意同时具备强关联规则危险因素的人群,开展针对性措施以降低感染风险,筑牢布病防控屏障。

关键词：布鲁菌病危险因素健康教育关联规则

基于贝叶斯多变量联合模型的体检人群脑卒中发病风险因素的纵向研究

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中国全科医学 2023年第12期26卷 1437-1443页

作者：杨毅丛慧文王廉源杨丽萍包绮晗王浩桦李承圣周立雯丁子琛石福艳王素珍潍坊医学院公共卫生学院卫生统计学系山东省潍坊市261053 空军军医大学西京医院健康医学中心陕西省西安市710032

背景脑卒中是目前影响人类健康的主要公共卫生问题之一;健康体检纵向数据累积了大量的健康信息,由于缺失数据多、样本量小等诸多问题,导致其利用率低、重要信息未能得到充分挖掘,进而对常见慢性病的有效防控等工作带来一定困难。目的基... 详细信息

背景脑卒中是目前影响人类健康的主要公共卫生问题之一;健康体检纵向数据累积了大量的健康信息,由于缺失数据多、样本量小等诸多问题,导致其利用率低、重要信息未能得到充分挖掘,进而对常见慢性病的有效防控等工作带来一定困难。目的基于贝叶斯多变量联合模型,探讨体检人群脑卒中发病风险因素,为慢性病风险因素分析提供新的方法。方法本研究使用空军军医大学西京医院健康医学中心2008—2015年的体检资料。随访情况:以首次发生脑卒中为结局事件,发生结局事件立即停止随访;若未发生,到2015年体检信息收集完成后结束随访;体检间隔时间为1年。依据随访过程中是否发生脑卒中分为脑卒中组和非脑卒中组。纵向观察变量包括总胆固醇(TC)、三酰甘油(TG)、低密度脂蛋白胆固醇(LDL-C)、高密度脂蛋白胆固醇(HDL-C)、体质指数(BMI)和收缩压(SBP)。采用多因素Cox回归模型分析基线情况对脑卒中结局事件的影响;采用贝叶斯多变量联合模型,分析随访过程中TC、TG、LDL-C、HDL-C、BMI和SBP的纵向变化轨迹对脑卒中发病的影响。结果本研究共纳入234例研究对象,1581条纵向随访记录,平均随访时间为(7.4±1.2)年,其中70例(29.9%)在随访过程中发生脑卒中。多因素Cox回归模型结果显示:基线TC、TG、LDL-C、HDL-C、BMI、SBP对脑卒中发病均无影响(P>0.05)。贝叶斯多变量联合模型结果显示:TG每纵向升高1 mmol/L,脑卒中发病风险升高1.863倍[95%CI(1.018,3.294),P=0.042];LDL-C每纵向升高1 mmol/L,脑卒中发病风险升高1.347倍[95%CI(1.045,1.863),P=0.046]。结论TG、LDL-C水平随时间变化的纵向升高是体检人群脑卒中发病的危险因素;贝叶斯多变量联合模型可用于体检人群的慢性病风险因素探讨研究中。

关键词：卒中体格检查贝叶斯联合模型 Cox回归模型血脂异常危险因素

不同MMSE评分下阿尔兹海默病发病风险因素的贝叶斯分位数回归联合模型分析

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吉林大学学报（医学版） 2023年第2期49卷 395-401页

作者：王廉源杨毅丛慧文王浩桦包绮晗李承圣周立雯丁子琛李艳丽石福艳王素珍潍坊医学院公共卫生学院卫生统计学教研室山东潍坊261053 潍坊医学院图书馆山东潍坊261053

目的:探讨校正简易精神状态检查(MMSE)评分轨迹后的阿尔兹海默病(AD)发病风险影响因素,阐明不同MMSE评分人群AD发病的风险因素。方法:基于AD神经成像计划数据库收集2005—2016年的随访数据,经筛选后最终纳入425名随访者的随访数据,采用L... 详细信息

目的:探讨校正简易精神状态检查(MMSE)评分轨迹后的阿尔兹海默病(AD)发病风险影响因素,阐明不同MMSE评分人群AD发病的风险因素。方法:基于AD神经成像计划数据库收集2005—2016年的随访数据,经筛选后最终纳入425名随访者的随访数据,采用LASSO方法对变量进行筛选;采用贝叶斯分位数回归模型分析MMSE评分在不同分位数上的影响因素,采用Cox模型和贝叶斯分位数回归联合模型方法分析影响AD发病的主要风险因素。结果:经筛选后,纳入的变量包括白蛋白、总胆固醇和血糖浓度等10个变量。贝叶斯分位数回归联合模型的纵向子模型分析,在MMSE评分的不同分位数处,影响MMSE评分轨迹变化的因素相同,均为白蛋白、血糖浓度、年龄、性别、载脂蛋白E4 (APOE4)基因、种族和教育评分。联合模型的Cox回归子模型分析,种族和APOE4基因在所有分位数上均对AD发病有影响,其中APOE4基因在4个分位数上的风险比分别为2.188 (95%CI:1.775,2.620)、1.751 (95%CI:1.422,2.042)、1.706 (95%CI:1.391,2.102)和2.056 (95%CI:1.439,3.206)。总胆固醇水平和家族史仅在部分分位数上对AD发病有影响。结论:不同MMSE评分分布的人群,AD发病的风险因素不同,影响程度也有差异。有APOE4基因和白种人在不同分位数上均是AD发病的风险因素,总胆固醇水平和家族史仅在部分分位数上是AD发病的风险因素。

关键词：贝叶斯分位数回归联合模型分位数回归模型 Cox模型阿尔兹海默病简易精神状态检查量表风险因素

基于贝叶斯累加回归树模型的非小细胞肺癌患者个性化疗效研究

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山东大学学报（医学版） 2022年第10期60卷 92-98页

作者：丁子琛王浩桦周立雯丛慧文李承圣包绮晗杨毅王廉源王素珍石福艳潍坊医学院公共卫生学院山东潍坊261053

目的应用贝叶斯累加回归树(BART)模型对非小细胞肺癌(NSCLC)患者的仅手术与手术+化疗两种治疗方案的疗效进行个性化评价,并识别高受益患者亚组。方法提取美国SEER数据库中2012—2013年间所有NSCLC患者资料,以总生存时间不小于5年作为结... 详细信息

目的应用贝叶斯累加回归树(BART)模型对非小细胞肺癌(NSCLC)患者的仅手术与手术+化疗两种治疗方案的疗效进行个性化评价,并识别高受益患者亚组。方法提取美国SEER数据库中2012—2013年间所有NSCLC患者资料,以总生存时间不小于5年作为结局,按照治疗方案分类进行比较。运用倾向性评分匹配法使比较组间协变量均衡,应用BART模型计算个体处理效应(ITE),运用决策树模型进行亚组分析。结果本研究BART所对应的模型曲线下面积(AUC)大于0.8,结果可信度较高,99.5%患者采用手术+化疗方案获得不同程度更优疗效,得到AJCC分期、原发灶位置、转移程度等临床实践中重要的亚组分类特征,并得出疗效最优的亚组。所得亚组中,相较于仅手术的治疗方案,远处转移、原发灶位于肺中叶的女性患者更能于手术+化疗方案中受益。结论构建的BART模型可以较好地评价NSCLC患者两种治疗方案的个性化疗效,为今后同类疾病的个性化医疗实践提供依据。

关键词：贝叶斯累加回归树个体处理效应非小细胞肺癌手术辅助化疗

基于逆概率加权法的早期三阴性乳腺癌不同治疗方案的疗效评价

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山东大学学报（医学版） 2021年第8期59卷 113-118页

作者：王喆刘玉洁毛倩管佩霞包绮晗李承圣乔晓伟潘庆忠王素珍潍坊医学院公共卫生学院卫生统计学教研室山东潍坊261053 潍坊医学院公共卫生学院数学教研室山东潍坊261053

目的基于逆概率加权法(IPTW)评价保乳术联合术后放疗和乳房切除术治疗早期三阴性乳腺癌患者的疗效。方法基于美国SEER数据库,收集2010至2015年诊断为T1-2N0M0期三阴性乳腺癌患者相关资料,通过广义提升模型(GBM)估计倾向指数计算逆概率权... 详细信息

目的基于逆概率加权法(IPTW)评价保乳术联合术后放疗和乳房切除术治疗早期三阴性乳腺癌患者的疗效。方法基于美国SEER数据库,收集2010至2015年诊断为T1-2N0M0期三阴性乳腺癌患者相关资料,通过广义提升模型(GBM)估计倾向指数计算逆概率权重,加权均衡组间协变量后分析两种局部治疗方式对早期三阴性乳腺癌患者生存率的影响。结果 IPTW后,组间协变量达到完全均衡,log-rank检验结果表明,保乳术联合术后放疗组的总生存率(OS)高于乳房切除术组(P<0.001);多因素Cox回归分析结果显示,保乳术联合术后放疗组与乳房切除术组相比预后更好(HR=0.74,95%CI=0.65~0.84,P<0.001)。结论对T1-2N0M0期三阴性乳腺癌患者,保乳术联合术后放疗的疗效优于乳房切除术。

关键词： T1-2N0M0期三阴性乳腺癌逆概率加权法保乳术联合术后放疗乳房切除术疗效评价

2012—2021年疾病负担研究热点及研究趋势分析

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现代预防医学 2022年第24期49卷 4423-4429+4436页

作者：綦晓杨毅杨希周立雯丁子琛王浩桦包绮晗石福艳孔雨佳王素珍潍坊医学院公共卫生学院

目的系统分析2012—2021年国内外疾病负担研究的热点及趋势。方法通过中国知网（CNKI）和Web of Science(WoS)系统检索2012年1月1日—2021年12月31日疾病负担研究的文章，利用CiteSpaceV6.1 R2软件进行可视化分析。结果 CNKI纳入1 86... 详细信息

目的系统分析2012—2021年国内外疾病负担研究的热点及趋势。方法通过中国知网（CNKI）和Web of Science(WoS)系统检索2012年1月1日—2021年12月31日疾病负担研究的文章，利用CiteSpaceV6.1 R2软件进行可视化分析。结果 CNKI纳入1 869篇文献，发文最多的机构是中国疾病预防控制中心；发文量最多的学者是周脉耕，其次是刘世炜、殷鹏和曾新颖；近十年的热点关键词是死亡率、经济负担和发病率等，研究最多的疾病是恶性肿瘤、糖尿病等；研究前沿趋势由2012年的家庭和经济负担到2021年的早死概率和照顾负担。WOS纳入15 253篇文献，发文量最多国家是美国；排名前三的机构是华盛顿大学、墨尔本大学和牛津大学；MURRAY C,NAGHAVI M是发文最多的作者；研究最多的内容是患病率、死亡率和危险因素，传染病是出现频次最多的病种；研究前沿趋势由2012年的区域疾病负担到2021年的疾病别和性别特异死亡率。结论近十年国际上疾病负担研究的热点主要是传染病的死亡率，国内则集中在恶性肿瘤和糖尿病的发病和死亡上；国际和国内的研究前沿随着时间也均发生了变迁。

关键词：疾病负担研究热点研究趋势 CiteSpace 可视化

基于孟德尔随机化的血脂六项与冠心病因果关系研究

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现代预防医学 2023年第10期50卷 1736-1742+1753页

作者：王浩桦丁子琛包绮晗周立文李承圣王廉源丛慧文杨毅王素珍石福艳潍坊医学院公共卫生学院

目的探究血脂六项指标(甘油三酯、总胆固醇、高密度脂蛋白、低密度脂蛋白、载脂蛋白A、载脂蛋白B)与冠心病之间的因果关系，为血脂六项指标与冠心病发病风险关联提供遗传学证据支持。方法研究采用MR-Egger回归、加权中位数法(weight m... 详细信息

目的探究血脂六项指标(甘油三酯、总胆固醇、高密度脂蛋白、低密度脂蛋白、载脂蛋白A、载脂蛋白B)与冠心病之间的因果关系，为血脂六项指标与冠心病发病风险关联提供遗传学证据支持。方法研究采用MR-Egger回归、加权中位数法(weight median estimator, WME)、随机效应逆方差加权法(inverse-variance weighted, IVW)、加权模型4种回归模型对血脂六项指标与冠心病的因果关系进行孟德尔随机化分析。结果 IVW模型显示甘油三酯(OR=1.402)、总胆固醇(OR=1.414)、低密度脂蛋白(OR=1.867)、载脂蛋白B(OR=1.738)为冠心病的危险因素，高密度脂蛋白(OR=0.791)为冠心病的保护因素，IVW模型则显示载脂蛋白A为有统计学意义的影响因素；MR-Egger回归截距项P值均>0.05,即筛选出的SNP不存在基因多效性，因此孟德尔随机化在本研究中为因果推断的有效方法；异质性检验结果P值均<0.001,故应重点关注随机效应IVW模型。结论利用两样本孟德尔随机化方法排除混杂因素和反向因果关联后，得到无偏估计的结果，据此可以确定甘油三酯、总胆固醇、高密度脂蛋白、低密度脂蛋白、载脂蛋白B与冠心病之间存在因果关系。

关键词：血脂指标冠心病因果推断孟德尔随机化

基于孟德尔随机化法的BMI与2型糖尿病因果关系研究

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郑州大学学报（医学版） 2022年第5期57卷 645-649页

作者：包绮晗李承圣王浩桦丁子琛周立雯丛慧文王廉源杨毅石福艳潘庆忠王素珍潍坊医学院公共卫生学院卫生统计学系山东潍坊261053 潍坊医学院公共卫生学院数学教研室山东潍坊261053

目的:采用孟德尔随机化法,以单核苷酸多态性(SNP)为工具变量,探究BMI与2型糖尿病(T2DM)的因果关系。方法:从IEU OpenGWAS project网站获得近3 a、样本量最大的BMI(ieu-b-40)及T2DM(ebi-a-GCST006867)的GWAS数据。从ieu-b-40中筛选与BMI高度相关的SNP(以P0.8,缺失的SNP用与其具有高度连锁性的SNP代替,删除无替代位点的SNP)。汇总上述两个数据集,剔除与T2DM直接相关的SNP,最终纳入包括rs8047395、rs13021737、rs663128等451个SNP作为工具变量。采用MR-Egger回归、加权中位数法(WME)、随机效应逆方差加权法(IVW)、加权模型4种回归模型分析BMI与T2DM的因果关系。结果:GWAS数据均来源于欧洲人群,男女不限。MR-Egger回归截距项为0.0003(P=0.8261),即筛选出的SNP不存在基因多效性。MR-Egger回归、WME、IVW、加权模型的OR(95%CI)分别为2.906(2.347~3.598)、2.938(2.676~3.226)、2.842(2.619~3.085)、2.980(2.440~3.638);由于存在异质性(Q=1289.365,P<0.001),故关注随机效应IVW的结果。结论:BMI是T2DM的危险因素。

关键词： BMI 2型糖尿病孟德尔随机化