基于反应规则的生物合成途径设计
作者单位:中国科学院天津工业生物技术研究所
会议名称:《中国化学会第30届学术年会-第二十五分会:化学信息学与...》
会议日期:2016年
学科分类:08[工学] 09[农学] 0901[农学-作物学] 0836[工学-生物工程] 090102[农学-作物遗传育种]
摘 要:在合成生物学的理性设计中,生物合成途径的设计是非常关键性的一个环节。一条完整的生物合成途径往往涉及了多个复杂的生物合成反应,每一个生物合成反应又对应了一种化学结构之间的转化方式,涉及到不同元件和功能模块。化合物的生物合成几乎都是从简单的小分子前体开始,经由一系列顺序协作的酶催化反应而最终形成。组装一条全新的生物合成途径需要结合目标化合物的结构特征,根据已有的一些反应规则来推测其可能的合成前体化合物,确定相应的生化反应类型,寻找相关的元件和功能模块来实现。我们拟汇报在基于反应规则来设计生物合成途径过程中,反应规则的挖掘,反应类型的分类以及反应催化酶的预测方面取得的一些研究进展。相关工作细节可参见课题组网站:http://***/.