Tospovirus属病毒的ssRNA-S链的比对分析
作者单位：云南农业大学农学与生物技术学院 云南农业大学植保学院 云南农业大学烟草学院
会议名称：《中国植物病理学会2009年学术年会》
会议日期：2009年
学科分类：09[农学] 0904[农学-植物保护] 090401[农学-植物病理学]
基 金：云南省自然基金面上项目(No.2005C0036M和2007C0036M) 云南省教育厅自然基金项目(No.5Y0171B) 国家973项目(2006CB100204)
摘 要：Tospovirus属引起多种农作物和花卉的严重病害。本研究应用生物信息学软件DNAstar、DNAman对Tospovirus属所有成员的RNA-S中的外壳蛋白（NC）和非结构蛋白（NSs）的编码核酸和氨基酸序列进行了较为系统的分析:同源性树状图、进化树图以及一致性（Identity）的值,同源性的值以及进化树的值。同时应用网络软件NPSA和SMART进行了该蛋白质氨基酸组成和蛋白质拓扑结构的预测,发现ssRNA-S链中的NC的特异性非常高。为将来应用RT-PCR或IC-RT-PCR技术鉴定番茄斑萎病毒种的引物设计及致病机制研究提供依据。