二维高效液相色谱蛋白质预分级与高灵敏度质谱鉴定用于血浆蛋白质组研究
作者单位:中科院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所蛋白质组研究分析中心蛋白质组学重点实验室 中科院大连化学物理研究所国家色谱研究与分析中心
会议名称:《中国蛋白质组学第二届学术大会》
会议日期:2004年
学科分类:0710[理学-生物学] 071010[理学-生物化学与分子生物学] 081704[工学-应用化学] 07[理学] 08[工学] 0817[工学-化学工程与技术]
摘 要:作为人体中最重要的体液,血浆蕴涵了大量与疾病相关的信息,因此对血浆蛋白质组的分析受到广泛的关注。但由于血浆蛋白质组的动态范围达到109以上,对蛋白质分离和鉴定提出了很大的挑战。我们建立了在线强阳离子交换/反相二维高效液相色谱联用技术,用于人血浆中蛋白质的预分级,通过对所收集30个组分蛋白质的酶解和在线毛细管反相液相色谱/电喷雾/线性离子阱质谱鉴定和生物信息学的统计与分析,采用非常严格的筛选标准(1.9,2.2,3.75,Rsp≤4,DeltaCN≥0.1),成功鉴定了1292个