lncRNA相关ceRNA网络在伴海马硬化颞叶癫痫中的作用及机制研究

作     者：汤旺 

作者单位：中南大学 

学位级别：硕士

导师姓名：曾艺

授予年度：2023年

学科分类：1002[医学-临床医学] 100204[医学-神经病学] 10[医学] 

主      题：颞叶癫痫 海马硬化 长链非编码RNA 竞争性内源性RNA 网络 

摘      要：目的:颞叶癫痫(temporal lobe epilepsy,TLE)作为成人部分性癫痫最常见的形式,同时也是常见的难治性和耐药性癫痫,一直是癫痫研究热点和重点。海马硬化(hippocampal sclerosis,HS)是耐药性TLE最常见的组织病理学类型,其在耐药性TLE手术患者中发生率约占70%。然而,伴海马硬化颞叶癫痫(TLE with HS,TLEHS)的具体分子发病机制尚不明确。本研究拟从全转录组水平,首次利用TLE-HS患者脑组织,从长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)相关竞争性内源性RNA(competitive endogenous RNA,ceRNA)调控网络的全新角度,探讨TLE-HS的发病机制,为TLE的治疗提供新思路。方法:本研究纳入2014年4月至2017年8月于中南大学湘雅医院神经外科住院行标准海马切除术的6例TLE患者,6例对照组海马标本来自中南大学湘雅医学院的遗体捐献计划。对TLE-HS患者及对照组海马区脑组织进行全转录组测序,确定海马中lncRNA、微小RNA(micro RNA,mi RNA)和信使RNA(messenger RNA,m RNA)的表达水平,筛选差异表达RNA并进行功能分析。通过检索star Base等相关数据库,寻找到lncRNA-mi RNA之间以及m RNAmi RNA之间的关系对,基于差异表达RNA构建lncRNA相关ceRNA网络。最后,对ceRNA网络中的m RNA进行功能分析及蛋白-蛋白互作分析。结果:1、与对照组比较,TLE-HS组筛查出差异表达m RNA 853个(744个上调,109个下调)。功能分析表明,差异表达m RNA富集于甘氨酸、丝氨酸和苏氨酸代谢通路、钙离子信号通路、Gn RH信号通路等。2、与对照组比较,TLE-HS组筛查出差异表达lncRNA 1097个(673个上调,424个下调)及1729个差异表达mi RNA(828个上调,901个下调)。3、构建出的TLE-HS患者lncRNA相关ceRNA网络,包含了91个m RNA、51个lncRNA及4个mi RNA,其中mi R-7978、mi R-302d-3p、mi R-302c-3p和mi R-302a-3p是其关键节点。4、功能分析表明,TLE-HS患者lncRNA相关ceRNA网络中差异表达的m RNA与PI3K-Akt信号通路、细胞衰老等相关,蛋白-蛋白互作网络中TP53是其最核心节点。结论:lncRNA相关ceRNA网络与TLE-HS的病理机制相关,可能通过网络中mi R-7978、mi R-302d-3p、mi R-302c-3p和mi R-302a-3p等关键节点调控PI3K-Akt信号通路、细胞衰老等关键生物学通路而发挥作用。图8幅,表8个,参考文献60篇