直肠癌相关基因与其临床病理特征的关系分析

作     者：卢臣 

作者单位：昆明医科大学 

学位级别：硕士

导师姓名：梁道明

授予年度：2022年

学科分类：1002[医学-临床医学] 100214[医学-肿瘤学] 10[医学] 

主      题：直肠癌 基因 临床病理特征 

摘      要：[目 的]探讨直肠癌患者中直肠癌相关基因APC、TP53、KRAS、NRAS、BRAF、ERBB2、MMR相关基因的突变情况以及TMB、MSI表达情况,并分析其与直肠癌临床病理特征之间的关系。[方 法]回顾性分析昆明医科大学第一、第二附属医院、云南省第一人民医院三家医院胃肠外科2019年12月至2021年12月收治的,并已经高通量测序平台行基因检测的直肠癌患者,收集其临床病理特征资料及基因检测报告,并分析二者间的关系。[结果]1.APC突变40例,突变率70.18%;TP53突变42例,突变率73.68%;KRAS突变33例,突变率57.89%;BRAF突变3例,突变率5.26%;ERBB2突变3例,突变率5.26%;NRAS突变4例,突变率7.02%;检测MMR相关基因突变患者45例,其中突变3例,突变率6.67%;检测TMB患者30例,低 TMB 9 例（30.00%）,中 TMB 10例（33.33%）,高 TMB1 1 例（36.67%）;57例患者均行MSI检测,1例未通过MS计算质控,无法判断,余均未检测到MSI-H。2.不同肿瘤位置APC及MMR相关基因突变率存在显著差异（P0.05）,均上段突变率高于中段和下段;不同分化程度肿瘤组织中KRAS突变率存在显著差异（P0.05）,低分化组基因突变率明显低于中低、中、中高分化组,低分化与高分化无显著差异;TP53、BRAF、ERBB2、NRAS突变率及TMB表达水平在不同临床病理特征中差异无统计学意义（均P0.05）。3.基因与临床病理特征相关性分析:仅BRAF与分化程度存在正相关,r=0.273,P=0.040.05。4.APC和TP53共突变者为34例,共突变率为59.65%,两者突变率无显著差异（P=0.7910.05）;Kappa=0.393,P=0.0030.01,提示两种基因突变率在直肠癌患者中具有一致性,但一致性差;APC和KRAS共同突变23例,共突变率为40.35%,两者突变率无显著差异（P=0.2480.05）;TP53和KRAS共突变者为24例,共突变率为42.11%,两者突变率无显著差异（P=0.1220.05）;APC和TP53以及KRAS共突变18例,共突变率31.58%,这三个基因的共突变率较高,且APC、TP53、KRAS分别与BRAF、ERBB2、NRAS均存在共突变,突变率差异均有统计学意义（均P0.05）,但无一致性（均P0.05）。5.发现罕见KRAS与BRAF共同突变1例,KRAS为p.G12V第2外显子错义突变,突变型c.35GT（p.G12V）,BRAF为p.G32D第1外显子错义突变,突变型c.95GA（p.G32D）。[结 论]1.APC、MMR相关基因突变率与直肠癌肿瘤位置有关,上段突变率明显高于中段和下段;KRAS突变率与直肠癌分化程度有关,低分化组明显低于中低、中、中高分化组,低分化与高分化组无显著差异。2.直肠癌中TP53及APC突变存在一致性。3.直肠癌中TP53、APC、KRAS突变率及共突变率均高。