鳃-耳综合征散发患者遗传病因研究

作     者：胡清强 

作者单位：大连医科大学 

学位级别：硕士

导师姓名：庞秀红

授予年度：2022年

学科分类：1002[医学-临床医学] 100210[医学-外科学(含：普外、骨外、泌尿外、胸心外、神外、整形、烧伤、野战外)] 100213[医学-耳鼻咽喉科学] 10[医学] 

主      题：鳃-耳综合征(BOS) EYA1基因 二代测序 de novo突变 大片段缺失 

摘      要：目的鳃-耳-肾谱系疾病(Branchio-oto-renal spectrum disorder,BORSD)是一类以耳聋伴有耳部畸形、鳃弓发育异常、肾脏发育不全为主要特征的常染色体显性遗传性综合征性耳聋谱系疾病。根据是否伴有肾脏异常分为:伴有肾脏异常的鳃-耳-肾综合征(Branchio-oto-renal syndrome,BORS)以及不伴有肾脏异常的鳃-耳综合征(Branchio-otic syndrome,BOS)。本研究拟对收集一例中国汉族散发鳃-耳综合征患者样本进行遗传性致病因素探寻,从而为该患者遗传咨询和婚育指导提供理论依据。方法对先证者及其父母进行详细的病史采集及全身体格检查,利用纯音测听、声导抗、耳声发射等听力学检查评估听力损失程度,影像学检查评估中、内耳畸形情况,泌尿系彩超及肾功能检查评估肾脏发育情况,绘制家系图。签署知情同意书,采集先证者及其父母外周静脉血,抽提全基因组DNA,利用PCR扩增技术对我国常见三大耳聋基因GJB2、SLC26A4及MT-RNR1筛查,如未发现致病基因则利用靶向捕获二代测序技术对406个已知耳聋基因进行全序列筛查,Sanger测序对发现的可疑突变位点进行家系内验证。依据《遗传变异分类标准与指南》最新ACMG指南,在遗传学数据库中查找可疑突变位点是否已报道,使用Mutation Taster、Phast Cons、Phylop、Poly Phen-2、PROVEAN及SIFT等工具软件对所有可疑致病突变位点进行生物信息学分析。根据孟德尔遗传定律,对先证者及其父母进行遗传咨询和婚育指导。结果1)表型:先证者具有双侧感音神经性聋、双侧先天性耳前瘘管、双侧第二鳃裂囊肿等常见表型,颞骨CT发现中、内耳畸形,无肾脏及其他系统异常表型。先证者父母未见上述异常表型。2)基因型:先证者及其父母未检出我国三大常见耳聋基因突变。406个已知耳聋基因外显子靶向捕获二代测序技术检出先证者携带跨越EYA1基因2-6号外显子的大片段缺失、EYA1基因***361Gln、GJB2基因***191Leu、TCOF1基因***859Glu和KARS基因***229His。依据《遗传变异分类标准与指南》最新ACMG指南,4个单基因错义突变在遗传学数据库中为已报道良性突变,Mutation Taster、Phast Cons、Phylop、Poly Phen-2、PROVEAN及SIFT工具软件分析预测EYA1、TCOF1、KARS基因为良性突变,GJB2基因倾向于致病突变。结论根据各个基因的突变来源、遗传方式、基因型-表型特点以及致病性分析,本研究推测EYA1基因***361Gln、GJB2基因***191Leu,TCOF1基因***859Glu和KARS基因***229His与先证者表型无相关性,EYA1基因大片段缺失很可能为先证者的遗传致病因素。亲缘研究及基因型-表型分析提示EYA1基因大片段缺失在家系内发生de novo突变,单倍体剂量不足很可能为其潜在致病机制。依据常染色体显性遗传特点,对先证者及其父母进行遗传咨询和婚育指导可避免后代患病。