宏基因二代测序在儿童重症肺炎中的临床应用价值研究

作     者：邢芮宁 

作者单位：重庆医科大学 

学位级别：硕士

导师姓名：李渠北

授予年度：2022年

学科分类：1002[医学-临床医学] 100202[医学-儿科学] 10[医学] 

主      题：宏基因二代测序 传统检测方法 重症肺炎 儿童 

摘      要：目的:比较宏基因二代测序（Metagenornic Next Generation Sequencing,m NGS）与传统检测方法在儿童重症肺炎上的检测效能,探讨m NGS的临床应用价值。方法:回顾性分析2020年10月至2021年11月期间53例完善m NGS检测的重症肺炎患儿的临床资料,比较传统检测方法与m NGS在病原学检测方面的性能,评估m NGS对临床治疗是否有指导意义。结果:共纳入53名患儿,共获得54份m NGS检测报告。m NGS检测阳性率高于传统检测方法,差异具有统计学意义（92.6%VS71.7%,P=0.005）,但二者一致性较差（Kappa=0.2060.4）,在细菌（35.8%VS79.6%,P0.001）、病毒（39.6%VS74.0%,P0.001）、真菌（1.9%VS20.3%,P=0.004）的检出上均高于传统检测方法,在混合感染的检出上也具有优势（92.1%VS75%,P=0.038）。对于BALF、痰液、外周血三种m NGS检测标本,BALF（70.7%VS95.1%,P=0.007）及痰液（71.4%VS100%,P=0.462）的标本检出阳性率均高于传统,且BALF标本的差异具有统计学意义。对于检测前使用抗生素的患儿,m NGS的检测阳性率高于传统检测方法（92.1%VS75%,P=0.038）。结论:本研究中,m NGS的检出阳性率高于传统检测方法,在病原体检出（细菌、真菌、病毒）及混合感染的检出均具有一定优势。m NGS对儿童重症肺炎的治疗具有一定指导意义,尤其是在细菌及真菌感染方面。目前m NGS尚不能代替传统检测方法,但可与传统检测方法联合使用,对重症肺炎患儿尽早明确病原、调整治疗有积极意义。