FRAP1和PDGFRA基因上的多态性位点与汉族人群近视的关联性分析

作     者：郑睿 

作者单位：电子科技大学 

学位级别：硕士

导师姓名：石毅

授予年度：2019年

学科分类：1010[医学-医学技术（可授医学、理学学位）] 10[医学] 

主      题：高度近视 FRAP1基因 PDGFRA基因 单核苷酸多态性 病例对照研究 

摘      要：目的:近视眼是世界上最常见的屈光不正,而高度近视往往引发多种眼部并发症,严重将致盲,然而高度近视的致病机制目前尚不明确。FRAP1和PDGFRA这两个基因与角膜曲率以及散光的相关性在之前的多个全基因组关联分析(GWAS)研究中已经被发现,而角膜曲率异常和散光是导致屈光不正的重要原因。极少的研究和报道关注FRAP1和PDGFRA与高度近视之间的关联,所以,本论文采取病例对照关联研究来探索中国汉族人群中FRAP1和PDGFRA基因上的共11个多态性位点(Single Nucleotide Polymorphism,SNP)位点(rs12142905,rs17036631,rs17084051,rs2076655,rs2114039,rs2275525,rs6540964,rs7660560,rs7677751,rs1057079,rs7682912)与高度近视易感性之间的关联。研究方法:本研究共招募1868名志愿者(均为汉族人群),其中包括921名高度近视患者以及947名健康对照。分别从他们的肘静脉中抽取外周血,提取全基因组DNA样本。通过聚合酶链式反应(Polymerase Chain Reaction,PCR)扩增相应DNA片段,再用ABI Snapshot单碱基延伸的方法特异性扩增相应位点,从而对11个多态性位点进行基因分型。并且,本研究运用了五种遗传模式(等位基因模型、纯合模型、杂合模型、显性模型、隐性模型)来进一步探究11个多态性位点和中国汉族人群高度近视(high myopia,HM)、超高度近视(extreme myopia,EM)以及病理性近视(pathologic myopia,PM)的关联性。结果:本研究中11个多态性位点在病例组和对照组中的基因型频率无显著性差异(P0.001),均符合哈迪-温伯格(Hardy-Weinberg)定律。(1)11个SNPs位点等位基因频率在高度近视组和健康对照组之间并无显著的统计学差异,P值分布在0.202到0.997之间。用Haploview(version 4.2)进行单倍体型分析,结果显示在FRAP1基因上5个SNPs位点rs6540964、rs2275525、rs1057079、rs2076655和rs12142905位于同一个连锁不平衡结构区(Linkage disequilibrium,LD),包含五种单体型TCTAT、CTCGC、CCCGT、CTCGT、TCTGT,P值在0.170到0.978之间,均无统计学意义;PDGFRA基因上rs17084051和rs2114039位于同一个LD,包含CT、AC和CC三种单体型,P值在0.645到0.754之间,无统计学差异。(2)等位基因频率在超高度近视和健康对照组中也没有明显差异,P值介于0.286到0.999之间。在连锁分析和单体型分析中,与高度近视不同的是,超高度近视样本和病理性近视样本在PDGFRA基因上纳入了其他三个SNP即一共有5个SNP构成五种单体型,但同样没有找到具有统计学意义的单体型。在超高度近视患者和对照人群进行五种模型下的分析时,在rs7660560的隐性模型分析中,与携带AG+GG人群相比,携带AA的个体敏感度略低,P值等于0.045,具备统计学意义(P=0.045,OR=0.416,95%CI=0.172-1.007)。(3)在对11个多态性位点与病理性近视进行相关性分析时,等位基因频率在病理性近视和健康对照组中也没有明显差异(P值介于0.144-0.921),但rs17036631位点的杂合和显性模型分析显示,与CC携带者相比较,携带rs17036631CT和rs17036631CT+TT的个体对病理性近视的敏感度将会增加(P=0.020,OR=1.429,95%CI=1.056-1.935;P=0.048,OR=1.352,95%CI=1.002-1.830)。Rs7660560位点的纯合和隐性模型分析显示,与携带rs7660560GG和rs7660560GG+AG的个体相比较,AA携带者对病理性近视的敏感度将会降低,P值分别为0.020、0.016,具有统计学意义(P=0.020,OR=0.211,95%CI=0.050-0.889;P=0.016,OR=0.202,95%CI=0.048-0.849)。结论:在中国汉族人群中,FRAP1和PDGFRA基因的多态性位点与高度近视和超高度近视无显著相关性,但与病理性近视的关系还需要进一步探究。此外,我们的研究显示角膜曲率和散光与高度近视之间的遗传背景是不同的。但需要更多的临床研究和动物实验来证明FRAP1和PDGRA基因在高度近视、病理性近视发生发展进程中发挥的作用。