转座事件引发的重组可以在不同的时空发生

作     者：吴红跃 

作者单位：浙江大学 

学位级别：硕士

导师姓名：董海涛

授予年度：2019年

学科分类：0710[理学-生物学] 07[理学] 09[农学] 071007[理学-遗传学] 0901[农学-作物学] 

主      题：转座元件 重组 MITE LA-PCR,RESite方法 

摘      要：二倍体水稻基因组上存在大量的转座元件序列,本研究利用生物信息学方法,将已获得的日本晴、93-11水稻的三组水稻全基因组序列进行比对,利用RESite方法在三组数据的差异性片段中筛选出具有微小倒置重复序列元件(miniature inverted-repeat transposable element,MITE)序列结构的 334 候选序列,选用水稻花药培养的手段应用转座子显示技术证明了单拷贝序列UC23、UC30、UC35单拷贝序列具有潜在的转座活性。又通过放宽筛选生物信息学的方法,重计算了存在于三组水稻全基因组序列中基因区内的差异MITE序列群,得到了一个大容量的候选MITE序列集合;在籼稻、粳稻和野生稻中比较了同源基因座位上同一转座元件的序列组成结构的多态性,获取了转座后发生重组事件的时空特征信息,证明了转座事件引发的重组可以在不同的时空发生。