松辽黑猪A-FABP基因SNPs位点及其与肉质性状的相关分析

作     者：于小燕 

作者单位：吉林大学 

学位级别：硕士

导师姓名：张嘉保

授予年度：2008年

学科分类：0905[农学-畜牧学] 09[农学] 

主      题：松辽黑猪 A-FABP基因 肉质性状 SNP 相关分析 

摘      要：脂肪酸结合蛋白(Fatty Acid-Binding Proteins ,FABPs)在动物机体中参与细胞内脂肪酸的摄取,协助将脂肪酸运至其进行β-氧化的场所(如线粒体或过氧化物酶体)以及甘油三酯和磷脂的合成部位。而A-FABP只在脂肪细胞中表达,是调控动物肌内脂肪(IMF)合成的重要因子。IMF含量与猪肉感官特性密切相关,是决定猪肉品质的一个重要因子。因而研究A-FABP基因的遗传变异对猪肉品质的改善具有重要的实际意义和学术价值。文献报导的对猪A-FABP基因的研究多采用RFLP的方法,采用SSCP方法分析其单核苷酸多态性(SNP)的报道不多。因此本文采用PCR-SSCP方法,研究松辽黑猪A-FABP基因SNPs;并将多态位点与松辽黑猪的肉质性状进行相关分析,以期为松辽黑猪关于肉质性状的选种选育和遗传改良提供理论依据。 研究结果表明:松辽黑猪A-FABP基因P1引物对扩增的5′UTR区域、P3引物对扩增的5′UTR区域、P4引物对扩增的Intron1区域和第二外显子均未发现PCR-SSCP遗传多态;在P2引物对扩增的5′UTR区域,P5引物对扩增的Intron1区域均发现了多态位点。其中在5′非翻译区1321bp处存在一处C→A的碱基突变,有AA、AB和BB三种基因型;该位点的多态性对松辽黑猪IMF含量有极显著影响(P0.01),对滴水损失和大理石纹有显著影响(P0.05)。BB型和AB型个体的IMF含量极显著高于AA型(P0.01),滴水损失BB型和AB型显著高于AA型(P0.05),大理石纹BB型显著高于AB型和AA型(P0.05)。在P5引物对扩增的Intron1区域中存在一连锁突变,分别是3440bp处T→G的转换,3481bp处A→G的转换和3514bp处G→T的转换。有EE、EF和FF三种基因型;该位点的多态性对松辽黑猪大理石纹和IMF含量有极显著影响(P0.01),FF型大理石纹极显著高于EF型和EE型(P0.01),IMF含量三者差异均极显著,FF型极显著高于EF型(P0.01),EF型极显著高于EE型(P0.01)。可以初步推断A-FABP基因是影响松辽黑猪肉质性状的一个主效基因或是一个与影响猪肉质性状的QTL连锁的基因。