五个山羊品种微卫星DNA的遗传多样性研究

作     者：武艳平 

作者单位：山西农业大学 

学位级别：硕士

导师姓名：韩俊文;马月辉

授予年度：2005年

学科分类：0905[农学-畜牧学] 09[农学] 090501[农学-动物遗传育种与繁殖] 

主      题：山羊 微卫星 遗传多样性 遗传距离 聚类分析 

摘      要：本研究利用微卫星DNA标记,分析了安哥拉山羊、山东莱芜黑山羊、罕山白绒山羊、太行山羊、乌珠穆沁绒山羊5个山羊品种的分子水平上的遗传多样性,探讨了各品种内的遗传变异及群体间的遗传关系,旨在为山羊遗传资源的合理利用及保护提供科学依据。研究结果如下: 1.从已发表的微卫星标记种筛选出25个位点,在5个山羊品种中进行了遗传多样性分析,共检测到199个等位基因,平均每个位点检测到7.96个等位基因。表明所选取的25个微卫星位点在5个山羊群体中多态性比较丰富。 2.哈代-温伯格平衡检验结果表明:5个群体基本处于遗传不平衡状态,究其原因有选择、迁移、遗传漂变等。 3.以等位基因为基础,得出位点的平均杂合度在0.4361～0.8204之间,群体平均杂合度在0.5915～0.7380之间。在25个位点中,除BM315在罕山白绒山羊上(0.4926)PIC0.5表现为中度多态外,其余位点均为高度多态。 4.对群体进行了基因流分析,结果是:引进品种安哥拉山羊与其他4个国内品种基因流值较小。内蒙的罕山白绒山羊和乌珠穆沁绒山羊有较大的基因流值(15.7534),说明其交流比较活跃。 5.对25个微卫星位点5个山羊群体进行了中性测试,共有11个位点(BM3413、BM203、BMS1943、BMS1290、BMS875、BM1225、BM315、FCB193、BM6404、BMS812、BMC3224)在95%置信区间之内,属于中性位点,但另外14个位点为非中性位点。 6.计算了总群体杂合度和亚群体杂合度以及遗传分化系数,结果表明群体间变异程度不高。 7.对各微卫星标记进行F-统计量结果,Fst的变化范围是从BMC1206的0.0107到BMS1943的0.0776;群体每代迁移数在2.9716～23.1145,平均值为8.8840。 8.计算了共祖遗传距离,并进行了NJ和UPGMA聚类,两种聚类较一致,内蒙的罕山白绒山羊和乌珠穆沁绒山羊总能聚到一起。