绵羊CARTPT基因的生物信息学分析

作     者：邵顺成 闫背背 张稳 张天闻 梁鹏 邹诗凡 冯登侦 Shao Shuncheng;Yan Beibei;Zhang Wen;Zhang Tianwen;Liang Peng;Zou Shifan;Feng Dengzhen

作者机构：宁夏大学农学院宁夏银川750000 

出 版 物：《现代畜牧兽医》 (Modern Journal of Animal Husbandry and Veterinary Medicine)

年 卷 期：2020年第11期

页      面：1-5页

学科分类：0905[农学-畜牧学] 09[农学] 

基　　金：宁夏优质肉羊新品种培育(NXNYYZ20150101) 

主　　题：绵羊 CARTPT基因 生物信息 

摘      要：试验旨在探究绵羊CARTPT基因所编码蛋白的结构与功能,利用生物信息学软件研究其理化性质、亲疏水性、信号肽、跨膜区域、蛋白质二级结构与三级结构、亚细胞定位和蛋白结构域、糖基化和磷酸化位点,并构建不同物种的CARTPT基因的系统发育树。结果表明:绵羊CARTPT基因CDS区全序列长为351 bp,编码116个氨基酸,编码蛋白的相对分子质量12790.18 Da,理论等电点8.22,脂肪系数114.48,总平均亲水性-0.006,属于分泌蛋白,没有跨膜区域结构;二级结构中主要以α-螺旋与无规则卷曲为主;亚细胞定位分析预测该蛋白最可能在细胞外基质发挥其生物学作用,有1个跨膜结构域;该蛋白质有5个丝氨酸(Ser)、1个苏氨酸(Thr)、2个酪氨酸(Tyr)磷酸化位点;系统进化树发现绵羊与山羊亲缘关系最近。