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绵羊B4GALNT2和ESR1基因多态性及其与产羔数的关联分析

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中国畜牧兽医 2021年第9期48卷 3332-3342页

作者：荣轩邵顺成梁鹏张天闻邹诗凡孟科强浩冯登侦宁夏大学农学院银川750021

为探究影响宁夏地区优质肉羊培育中多羔性状的候选位点,试验以杜泊羊、滩寒杂交羊、杂一代、杂二代和横交一代5个绵羊群体为研究对象,采用飞行质谱技术对5个绵羊群体β-1,4-N-乙酰半乳糖胺转移酶2(beta-1,4-N-acetyl-galactosaminyl tra... 详细信息

为探究影响宁夏地区优质肉羊培育中多羔性状的候选位点,试验以杜泊羊、滩寒杂交羊、杂一代、杂二代和横交一代5个绵羊群体为研究对象,采用飞行质谱技术对5个绵羊群体β-1,4-N-乙酰半乳糖胺转移酶2(beta-1,4-N-acetyl-galactosaminyl transferase 2,B4GALNT2)基因g.36933082 G>A和g.36946470 G>A位点以及雌激素受体1(estrogen receptor 1,ESR1)基因g.75378892 A>T位点进行多态性检测,并与绵羊产羔数进行关联分析;应用生物信息学在线软件分析B4GALNT2和ESR1基因突变前后蛋白质的二级结构和三级结构。结果显示,B4GALNT2基因的g.36933082 G>A和g.36946470 G>A位点均存在3种基因型:AA、AG和GG,且GG基因型均为优势基因型;ESR1基因的g.75378892 A>T位点存在3种基因型:AA、TA和TT,且AA基因型为优势基因型。g.36933082 G>A和g.36946470 G>A位点在5个绵羊群体中均表现为低度多态(PICT位点在5个绵羊群体中均表现为中度多态(0.250.05)。关联分析结果表明,g.36933082 G>A和g.36946470 G>A位点不同基因型在5个绵羊群体中的产羔数均无显著差异(P>0.05);g.75378892 A>T位点在杂一代绵羊群体中TA基因型个体产羔数显著高于TT基因型(PA和g.36946470 G>A位点不适用于5个绵羊群体多羔性状的选育,ESR1基因g.75378892 A>T位点可作为杂一代绵羊群体多羔性状的分子辅助标记。

关键词：绵羊 B4GALNT2基因 ESR1基因多态性生物信息学分析产羔数

绵羊BMP2、BMP4和BMP7基因多态性与产羔数的关联分析

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中国畜牧杂志 2022年第5期58卷 113-118,123页

作者：孟科荣轩梁鹏强浩冯登侦宁夏大学农学院宁夏银川750021

为探究BMP2、BMP4、BMP7基因多态性与绵羊产羔数之间的关联性,筛选与绵羊产羔数相关的分子标记,本研究利用飞行质谱技术对5个群体(杜泊羊、滩寒杂交羊、杂一代、杂二代和横交一代)768只绵羊BMP2基因g.48462350C>T位点和BMP4基因g.634547... 详细信息

为探究BMP2、BMP4、BMP7基因多态性与绵羊产羔数之间的关联性,筛选与绵羊产羔数相关的分子标记,本研究利用飞行质谱技术对5个群体(杜泊羊、滩寒杂交羊、杂一代、杂二代和横交一代)768只绵羊BMP2基因g.48462350C>T位点和BMP4基因g.63454744T>G位点以及BMP7基因g.58171856C>G位点进行检测,并与产羔数进行关联分析。结果表明:BMP2基因g.48462350C>T位点检测出CC、CT、TT 3种基因型,在5个绵羊群体中均为中度多态(0.25G位点检测出TT、TG、GG 3种基因型,在5个绵羊群体均表现为低度多态(PICG位点检测出CC、CG、GG 3种基因型,在5个绵羊群体均为低度多态(PICT位点在杜泊羊群体中不处于哈代-温伯格平衡状态(P0.05);BMP4基因g.63454744T>G位点和BMP7基因g.58171856C>G位点在5个绵羊群体均处于哈代-温伯格平衡状态(P>0.05)。产羔数关联分析表明,3个位点不同基因型在5个绵羊群体中的产羔数无显著差异。综上所述,BMP2基因g.48462350C>T位点和BMP4基因g.63454744T>G位点以及BMP7基因g.58171856C>G位点不适用于上述5个绵羊群体多羔性状的选育。

关键词：绵羊 BMP2 BMP4 BMP7 多态性产羔数

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miRNA调控绵羊排卵过程的研究进展

家畜生态学报 2023年第4期44卷 1-6页

作者：荣轩邵顺成梁鹏张天闻邹诗凡孟科强浩冯登侦宁夏大学农学院宁夏银川750021

繁殖性能是绵羊的重要经济性状之一,受主效基因或微效多基因的调控,很难通过传统的育种手段来快速提高。通过研究microRNA(miRNA)对绵羊排卵过程的作用机制,有助于提高绵羊的繁殖性能。文章主要综述了miRNA在绵羊排卵过程中的表达与功能... 详细信息

繁殖性能是绵羊的重要经济性状之一,受主效基因或微效多基因的调控,很难通过传统的育种手段来快速提高。通过研究microRNA(miRNA)对绵羊排卵过程的作用机制,有助于提高绵羊的繁殖性能。文章主要综述了miRNA在绵羊排卵过程中的表达与功能,以及调控此过程的相关信号通路的作用机制,以期为提高绵羊的繁殖效率提供理论依据。

关键词：绵羊排卵 miRNA 信号通路研究进展

5个绵羊群体LHR基因多态性与产羔数的关联分析

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中国畜牧杂志 2021年第12期57卷 132-136页

作者：邵顺成闫背背张天闻梁鹏邹诗凡李新海冯登侦宁夏大学农学院宁夏银川750000

实验旨在探究绵羊LHR基因rs410734874、rs401906902、rs398733991、rs4243283244个位点的多态性与5个绵羊群体产羔数之间的关系,以期为绵羊高繁殖力分子育种提供新的遗传标记。利用Sequenom Mass ARRAY®SNP技术对5个绵羊群体(杜泊、滩... 详细信息

实验旨在探究绵羊LHR基因rs410734874、rs401906902、rs398733991、rs4243283244个位点的多态性与5个绵羊群体产羔数之间的关系,以期为绵羊高繁殖力分子育种提供新的遗传标记。利用Sequenom Mass ARRAY®SNP技术对5个绵羊群体(杜泊、滩寒羊、杂交一代、杂交二代、横交一代)共768只绵羊LHR基因的4个位点进行检测,并与产羔数进行关联分析。结果表明:LHR基因rs401906902位点在杜泊、滩寒羊、杂交一代、杂交二代、横交一代5个群体中均表现为低度多态;rs398733991位点在滩寒羊群体中表现为中度多态,在杜泊、杂交一代、杂交二代、横交一代群体中表现低度多态;rs424328324、rs4107348742个位点在5个群体中均表现为中度多态。经Hardy-Weinberg平衡检验分析,rs401906902、rs398733991、rs4107348743个位点在5个群体均处于Hardy-Weinberg平衡状态,表明这3个位点在5个群体中已趋于稳定;rs424328324位点除横交一代羊群体外,在其他群体处于Hardy-Weinberg平衡状态;rs410734874位点在横交一代群体中与产羔数有一定的关联性,其中TT型产羔数显著高于TA型,说明rs410734874位点适用于横交一代绵羊群体多羔性状的选育;rs401906902、rs398733991、rs4243283243个位点各基因型之间产羔数差异均不显著,不适用于绵羊多羔性状的选育。本研究将为开展提高绵羊繁殖力的标记辅助选育提供参考。

关键词：绵羊 LHR基因多态性产羔数

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细胞命运转变——谱系重编程技术研究进展

遗传 2012年第8期34卷 985-992页

作者：孙红艳王锋曹文广南京农业大学动物科技学院动物胚胎工程中心南京210095 中国农业科学院北京畜牧兽医研究所北京100193

体细胞核移植和诱导多能干细胞技术表明已分化的体细胞可以转变命运。最近的研究再一次验证了成熟体细胞可以通过外源转录因子的导入,直接重编程为其他类型的体细胞或祖细胞。这种重编程技术称为谱系重编程(Lineage reprogramming)。这... 详细信息

体细胞核移植和诱导多能干细胞技术表明已分化的体细胞可以转变命运。最近的研究再一次验证了成熟体细胞可以通过外源转录因子的导入,直接重编程为其他类型的体细胞或祖细胞。这种重编程技术称为谱系重编程(Lineage reprogramming)。这项技术不仅在再生医学领域具有广阔的应用前景,而且在动物生物技术中也应用广泛。它不但避免了伦理争议,还提供了便利的重编程方法,同时也为基因表达调控的研究提供了重要的手段。文章从谱系重编程的方式、谱系重编程的特点及应用前景等3个方面进行了综述,旨在对相关领域的研究人员起到借鉴作用。

关键词：体细胞谱系重编程转录因子命运转变

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绵羊多胎主效基因研究进展

遗传 2011年第9期33卷 953-961页

作者：王建起曹文广中国农业科学院北京畜牧兽医研究所北京100193

绵羊存在影响多胎性状的主效基因。BMPR-IB的突变体FecB对排卵数的增加具有增强效应,GDF-9的突变体FecGH和FecI及BMP-15的突变体FecXI、FecXH、FecXG、FecXB、FecXL和FecXR均为纯合子不育,杂合子增加排卵数,而GDF-9的突变体FecGE只有纯... 详细信息

绵羊存在影响多胎性状的主效基因。BMPR-IB的突变体FecB对排卵数的增加具有增强效应,GDF-9的突变体FecGH和FecI及BMP-15的突变体FecXI、FecXH、FecXG、FecXB、FecXL和FecXR均为纯合子不育,杂合子增加排卵数,而GDF-9的突变体FecGE只有纯合子增加排卵数。Woodlands和Lacaune是遗传方式已知的多胎主效基因。Woodlands是与X染色体连锁的母系印迹基因,Lacaune与FecB类似对排卵数的增加具有增强效应。主效基因突变体单拷贝增加排卵数的效应具有差异性,FecB和FecXL的效应最高可增加1.5个,Woodlands最低可增加0.4个。研究绵羊多胎性状主效基因不仅有助于家畜的选种选育,提高绵羊繁殖力,而且为研究哺乳动物的繁殖机制开拓了新的方向。文章综述了绵羊多胎主效基因的来源、定位、表型、作用机制以及我国绵羊品种多胎主效基因的研究现状,旨在为深入研究绵羊多胎主效基因的作用机制及为绵羊多胎品种的选育提供参考。

关键词：绵羊多胎主效基因突变体

绵羊ADIPOQ多态性与生长性状的关联分析

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中国农业科学 2022年第11期55卷 2239-2256页

作者：梁鹏张天闻孟科邵顺成邹诗凡荣轩强浩冯登侦宁夏大学农学院

【目的】探讨ADIPOQ遗传变异对绵羊生长性状的影响，找到与宁夏优质肉羊培育中生长性状相关的分子遗传标记，为宁夏优质肉羊的分子辅助育种的研究提供依据。【方法】首先利用液相捕获测序技术获得ADIPOQ在杜泊羊、滩羊和小尾寒羊中的变... 详细信息

【目的】探讨ADIPOQ遗传变异对绵羊生长性状的影响，找到与宁夏优质肉羊培育中生长性状相关的分子遗传标记，为宁夏优质肉羊的分子辅助育种的研究提供依据。【方法】首先利用液相捕获测序技术获得ADIPOQ在杜泊羊、滩羊和小尾寒羊中的变异位点，同时采集383只3个品种的不同杂交后代群体耳组织，采用飞行质谱技术对确定的SNPs位点进行基因分型检测，并使用Haploview软件对多态性位点进行连锁不平衡分析和构建单倍型，与绵羊初生和3月龄的生长性状进行关联分析。【结果】共筛选到7个SNPs位点，且7个位点在杂交后代群体中均表现出多态性，SNP1—SNP7位点的优势基因型分别为CC、GG、GG、CT、AG、GG和AA，优势等位基因分别为C、G、G、C、G、G和A。X~2检验发现，所有位点均处于Hardy-Weinberg平衡状态(除SNP7位点在所有个体中偏离了平衡)。SNP1(F代除外)、SNP4、SNP5和SNP6位点在各杂交后代及所有个体中均处于中度多态(0.25≤PIC0.05)。单倍型组合关联分析发现：H2H3基因型的初生体重和初生体斜长显著高于其他基因型(P宁夏优质肉羊选育中生长性状的潜在分子标记。

关键词：绵羊 ADIPOQ 多态性生长性状单倍型

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基于转录组学筛选绵羊肌苷酸调控相关基因

基于转录组学筛选绵羊肌苷酸调控相关基因

作者：聂玮宁夏大学

学位级别：硕士

肌苷酸（IMP）又名次黄嘌呤核苷酸或次黄苷酸,是机体在嘌呤代谢过程中合成的物质,是反映肉质鲜味的重要指标。因此获得与肌苷酸调控相关的候选基因已成为畜禽遗传改良的重点工作之一。本研究以杜泊羊、滩羊和小尾寒羊（各3只）为研究对... 详细信息

肌苷酸（IMP）又名次黄嘌呤核苷酸或次黄苷酸,是机体在嘌呤代谢过程中合成的物质,是反映肉质鲜味的重要指标。因此获得与肌苷酸调控相关的候选基因已成为畜禽遗传改良的重点工作之一。本研究以杜泊羊、滩羊和小尾寒羊（各3只）为研究对象,通过转录组测序技术筛选影响绵羊肌苷酸调控相关信号通路和基因,为分子水平上研究肌苷酸形成机制和宁夏优质肉羊新品种的培育提供新的基础,主要研究结果如下:1.通过转录组测序技术,在|log2Fold Change|≥1和P-value宁夏优质肉羊新品种的培育提供新的基础。

关键词：绵羊肌苷酸转录组候选基因

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绵羊背最长肌脂肪沉积相关基因筛选

绵羊背最长肌脂肪沉积相关基因筛选

作者：郭晨浩宁夏大学

学位级别：硕士

脂肪沉积影响肉的嫩度,风味和多汁性,是复杂的数量性状,也是养羊生产中重要的经济性状之一,与羊肉品质密切相关。如何提高肉类的产量和质量,满足人类追求健康的饮食需求是改良育种的主要参考因素。脂肪沉积作为影响肉品质的重要因素非... 详细信息

脂肪沉积影响肉的嫩度,风味和多汁性,是复杂的数量性状,也是养羊生产中重要的经济性状之一,与羊肉品质密切相关。如何提高肉类的产量和质量,满足人类追求健康的饮食需求是改良育种的主要参考因素。脂肪沉积作为影响肉品质的重要因素非常重要。因此,本研究以杜泊羊、滩羊和小尾寒羊为研究对象,采用转录组测序的方法筛选绵羊脂肪沉积相关候选基因及相关通路,以探究绵羊脂肪沉积相关候选基因的调控规律,为绵羊分子育种提供理论依据,从而促进宁夏肉羊产业的快速发展。研究结果如下:（1）通过转录组测序技术在小尾寒羊和滩羊组筛选出836个差异mRNA,杜泊羊和滩羊组筛选出578个差异mRNA,两组差异表达基因取交集共得到226个差异mRNA。GO富集分析发现,差异表达mRNA富集到1205个GO条目中。KEGG信号通路分析结果显示,差异表达mRNA富集到152个信号通路中。其中与脂肪沉积相关的通路有受体结合、去乙酰化酶活性、GABA能突触、昼夜节律、黑色素的形成和谷氨酸突触等信号通路,经分析筛选出FGF14、FGF9、WNT8B、FGF2、PER3、CRH、ADCY8、TNC、CASR、PRKAA2等基因参与动物的脂肪代谢过程,可能与绵羊的脂肪沉积密切相关。（2）通过转录组测序技术在小尾寒羊和滩羊组筛选出832个差异lncRNA,杜泊羊和滩羊组筛选出344个差异lncRNA,两组差异表达基因取交集共得到308个差异lncRNA。通过对308个差异lncRNA进行靶基因预测,共预测到1475个靶基因,其中预测到coxpression（共表达）靶基因687个。通过对预测到的共表达靶基因进行GO和KEGG富集分析,发现共表达靶基因富集到与脂肪代谢的相关通路:cAMP信号通路、细胞外基质、核糖体、胆汁分泌和水解酶活性;通过对共表达靶基因功能和通路分析,进一步筛选出和脂肪代谢相关的基因:CREBBP、ATP1B3、COL6A6、ADAMDEC1、ADAMTS4、ADAR、RETN、TG、IRF4、RPLP1。（3）差异lncRNA预测到的1475个靶基因中,coocation（共位置）靶基因有788个。通过对预测到的共位置靶基因进行GO和KEGG富集分析,共位置靶基因富集到与脂肪代谢相关通路:PI3K-Akt信号通路、胰岛素信号传导途径、PPAR信号通路、Wnt信号传导途径、FoxO信号传导途径、脂肪细胞因子信号通路、AMPK信号传导途径。通过对共位置靶基因功能和通路分析,进一步筛选出和脂肪代谢相关的基因,如:PPP1R3C、PIK3R1、PPP2R5C、SOCS3、PPARGC1A、MAPK13、PCK2 及 TCONS0113536、TCONS0196476、TCONS0084166 和 TCONS0096659,这些基因可能影响了绵羊的脂肪沉积。

关键词：绵羊脂肪沉积转录组候选基因