云南3个新发掘地方鸡种mtDNA D-loop区序列遗传多样性分析

作     者：王坤 豆腾飞 李琦华 柳明正 李丰耘 贾俊静 葛长荣 WANG Kun;DOU Tengfei;LI Qihua;LIU Mingzheng;LI Fengyun;JIA Junjing;GE Changrong

作者机构：云南农业大学动物科学技术学院昆明650201 

出 版 物：《中国畜牧兽医》 (China Animal Husbandry & Veterinary Medicine)

年 卷 期：2020年第47卷第10期

页      面：3232-3241页

学科分类：0710[理学-生物学] 07[理学] 08[工学] 0905[农学-畜牧学] 09[农学] 071007[理学-遗传学] 0836[工学-生物工程] 090501[农学-动物遗传育种与繁殖] 

基　　金：国家自然科学基金项目(U1702232、31560618、31572359) 云南省科技计划项目重大科技专项(2016ZA008) 云南省自然科学基金重点项目(2016FA046) 云南省科技厅苏正昌专家工作站(2019IC008) “十三五”农村领域国家科技计划课题(2015BAD03B03-4) 2018年云南省博士研究生学术新人奖项目 

主　　题：翻毛鸡 赤脖鸡 YN鸡 mtDNA D-loop区 遗传多样性 

摘      要：为研究在云南省怒江州及山区发现的3个地方鸡种翻毛鸡(FM)、赤脖鸡(CB)和YN鸡的群体遗传背景,试验采用线粒体DNA(mitochondral DNA,mtDNA)D-loop区序列为遗传标记,对3个鸡种共168个样品进行了检测分析。结果显示,翻毛鸡、赤脖鸡和YN鸡3个地方鸡种共定义了27种单倍型,其单倍型多样度分别为0.947、0.938和0.596;核苷酸多样度分别为0.01268、0.01434、0.00239。系统发生树分析显示,本研究检测的168个样品分布在A、B、C、E、F和G 6个世系中,其中翻毛鸡包含E、F和G 3个世系;赤脖鸡包含A、B、C、E、F和G 6个世系,E、F和G世系为其主要世系;YN鸡包含E、F和G 3个世系,其中E世系是其主要世系。YN鸡主要与印度亚种、白洛克鸡、白来航鸡和新汉夏鸡等蛋鸡品种进化关系较近,而赤脖鸡血缘较杂乱,与滇南亚种、海南亚种、指名亚种、印度尼西亚斗鸡及老挝鸡进化关系较近;翻毛鸡与赤脖鸡共享了较多的单倍型,2个品种间的进化关系较近。本试验结果为新发现的3个云南地方鸡品种的母系起源和遗传评估提供了依据。