盖塔病毒TaqMan探针荧光定量RT-PCR检测方法的建立
TaqMan-based real-time RT-PCR for rapid detection of the Getah virus作者机构:中国农业科学院特产研究所吉林长春130112 佛山科学技术学院广东佛山528000
出 版 物:《中国兽医学报》 (Chinese Journal of Veterinary Science)
年 卷 期:2020年第40卷第7期
页 面:1290-1295页
学科分类:090601[农学-基础兽医学] 1001[医学-基础医学(可授医学、理学学位)] 09[农学] 0906[农学-兽医学] 100103[医学-病原生物学] 10[医学]
主 题:GETV TaqMan探针 荧光定量RT-PCR
摘 要:为了建立特异、灵敏、快速的荧光定量RT-PCR方法用于检测盖塔病毒(Getah virus,GETV)的核酸,并初步应用于GETV的临床标本检测。根据GenBank登录的GETV全基因组序列,应用生物学软件进行序列比对,在NSP1保守区设计1对特异性引物和TaqMan探针。建立实时荧光定量RT-PCR检测GETV的方法,并对建立的方法进行敏感性、特异性测定和临床样品检验。结果显示,该方法能特异性地鉴别检测GETV;检测灵敏度高,检测的最低模板量可以达到2.03×10^1 copies/μL;将收集到的10000只蚊子样品分成100份进行检测,共检测出8份GETV阳性样品,与常规反转录PCR(RT-PCR)检测及病毒分离结果吻合。本研究建立的GETV TaqMan实时荧光定量RT-PCR检测方法特异、灵敏,适用于GETV的临床早期诊断。