基于TP0136蛋白异质性建立一种新的苍白密螺旋体分子分型方法

作     者：魏然 柯吴坚 陈文韬 谭玲俏 刘雅慧 吕萍 黄涛 张君 张晓辉 王柳苑 车雅敏 Wei Ran;Ke Wujian;Chen Wentao;Tan Lingqiao;Liu Yahui;Lyu Ping;Huang Tao;Zhang Jun;Zhang Xiaohui;Wang Liuyuan;Che Yamin

作者机构：天津医科大学总医院皮肤性病科300052 南方医科大学皮肤病医院皮肤二科广州510091 阳江市公共卫生医院皮肤性病科广东529500 清远市慢性病防治医院皮肤性病科广东511500 

出 版 物：《中华皮肤科杂志》 (Chinese Journal of Dermatology)

年 卷 期：2020年第53卷第7期

页      面：546-550页

核心收录：

学科分类：1002[医学-临床医学] 100206[医学-皮肤病与性病学] 10[医学] 

基　　金：国家自然科学基金(81772240) 广东省医学科研基金(A2018248、A2017224) 广州市健康医疗协同创新重大专项(201704020219) 南方医科大学皮肤病医院基础研究苗圃项目(C2019001) 深圳龙华区引进高层次医学团队项目(HLPM201907020105) 

主　　题：密螺旋体属 梅毒 基因分型技术 序列分析,蛋白质 TP0136 

摘      要：目的基于苍白密螺旋体属(TP)TP0136蛋白的异质性,建立一种新的TP分子分型方法。方法从GenBank中查询9株梅毒苍白密螺旋体(TPA)、3株雅司苍白密螺旋体(TPE)、1株未分类的类人猿密螺旋体(FB)和1株地方密螺旋体(TEN)的TP0136开放阅读框(ORF)氨基酸序列并进行多重序列比对,得出TP0136蛋白分子分型结果。利用建立的TP0136蛋白分子分型方法,对2015年1月至2018年12月南方医科大学皮肤病医院收集的23株TPA临床分离株进行分类,并将分型结果与传统的Arp/Tpr/TP0548三基因分型方法进行比较。结果TP0136蛋白在不同种TP株中具有高度异质性,根据TP0136氨基酸序列,TPE、FB和TEN分为Ⅰ~Ⅳ4个亚型,TPA分为Ⅴ~Ⅹ6个亚型,TPA临床株分为Ⅶ、Ⅸ、Ⅹ、Ⅺ4个亚型。通过TPA传统的三基因分型方法可将23株TPA临床株分为13D/d、14D/f、14D/g、15D/f、16A/e 5型。将TP0136分型法与传统分型法相结合,可将上述临床株进一步细分为10型,其中14D/f型应用TP0136分型法可进一步分为3个亚型。结论TP0136分子分型方法可用于TP种的区分,有助于传统TPA分子分型的进一步完善。