青海省自然疫源性病区小型兽类空间分布及分子鉴定研究

作     者：李海龙 魏有文 何建 赵延梅 杨汉青 马英 Li Hailong;Wei Youwen;He Jian;Zhao Yanmei;Yang Hanqing;Ma Ying

作者机构：青海省地方病预防控制所鼠疫预防控制科西宁811602 

出 版 物：《中华地方病学杂志》 (Chinese Journal of Endemiology)

年 卷 期：2020年第39卷第2期

页      面：93-98页

学科分类：07[理学] 

基　　金：国家自然科学基金(81560521、31060279) 青海省科技厅基础研究计划项目(2016-ZJ-770) 国家卫健委基地平台建设项目(2019PT310004) 青海省鼠疫防控与研究重点实验室(2020)。 

主　　题：小型兽类 细胞色素C氧化酶亚基Ⅰ 分子鉴定 

摘      要：目的 了解青海省自然疫源性病区小型兽类空间分布,并以线粒体细胞色素C氧化酶亚基I(COI)基因作为分子标记,对捕获的小型兽类进行分子水平的物种鉴定。方法 2009 - 2016年,在青海省6个州的16个市(县),采集小型兽类标本为研究对象,分析小型兽类地区分布、不同海拔分布、生态环境类型分布;采用PCR扩增小型兽类的COI基因部分片段序列(长度约650 bp),并进行同源性比较、遗传距离和系统发育分析。结果 共捕获小型兽类1 631只,分别隶属于3目7科21属30种;其中啮齿动物926只,分别隶属于5科19属25种,占56.78%。格尔木市采集的小型兽类数量最多(313只),2 800 ~ 3 000 m的海拔段为小型兽类分布最高峰(532只),沙地草原捕获数量最多(612只)。共成功扩增292只小型兽类COI基因,同源性比对与目标序列一致。种内遗传距离为0.01% ~ 2.90%,种间遗传距离为4.00% ~ 12.00%,种间遗传距离大于种内遗传距离;属间遗传距离为13.00% ~ 21.00%,科间遗传距离为22.00% ~ 25.00%。邻接法(NJ)系统发育树显示,同种个体聚为有很高支持度的单一分支共形成20个,置信度为98% ~ 100%。结论 青海省小型兽类空间分布受地区、海拔、生态环境等自然地理因素的综合影响,且分子鉴定法可弥补形态学鉴定中的不足。