申克孢子丝菌4Hppd基因结构功能的生物信息学分析

作     者：吴晓雁 张静 黄家敏 孙瑶 黄晓雯 高文超 吴榕 陈三妹 黄怀球 WU Xiao-yan;ZHANG Jing;HUANG Jia-min;SUN Yao;HUANG Xiao-wen;GAO Wen-chao;WU Rong;CHEN San-mei;HUANG Huai-qiu

作者机构：中山大学附属第三医院皮肤科广东广州510630 中山大学孙逸仙纪念医院皮肤科广东广州510120 深圳市人民医院皮肤科广东深圳518020 安徽医科大学第一附属医院皮肤性病科安徽合肥230022 南方医科大学南方医院皮肤科广东广州510515 中山大学附属第三医院全科医学广东广州510630 

出 版 物：《皮肤性病诊疗学杂志》 (Journal of Diagnosis and Therapy on Dermato-venereology)

年 卷 期：2020年第27卷第2期

页      面：79-82,88页

学科分类：1007[医学-药学(可授医学、理学学位)] 100705[医学-微生物与生化药学] 1001[医学-基础医学(可授医学、理学学位)] 100103[医学-病原生物学] 10[医学] 

基　　金：国家自然科学基金(编号:81974300,81371746) 中山大学三大建设超算专项(编号:82000-31143405) 

主　　题：申克孢子丝菌 对羟苯基丙酮酸双加氧酶基因 生物信息学分析 

摘      要：目的:初步预测及分析申克孢子丝菌(Sporothrix schenckii,Ss.)对羟苯基丙酮酸双加氧酶基因(4Hppd)编码蛋白的结构和生物学功能特征。方法:应用生物信息学在线工具预测分析Ss.4Hppd编码蛋白的理化性质及功能特征。结果:Ss.4Hppd基因编码蛋白含对羟苯基丙酮酸双加氧酶保守域,由477个氨基酸构成,理论分子量为52.0 kD,等电点为5.98,半衰期较长,该蛋白为非分泌蛋白,定位于线粒体中。其二级结构以无规则卷曲及α-螺旋为主,另外还存在乙二醛酶功能域及丰富的磷酸化位点,与其他致病真菌同源蛋白有较高的相似度。结论:预测Ss.4HppD位于线粒体中,具有乙二醛酶功能域结构功能特点及丰富修饰位点,可为其表达、晶体结构分析及小分子抑制剂开发提供参考。