miR-181b对甲状腺癌发生发展调控机制转录组学方法分析
Regulatory mechanism of miR-181b in thyroid cancer of genesis and development analyzed by transcriptomics作者机构:河北医科大学第一医院普外一科河北石家庄050031
出 版 物:《中华肿瘤防治杂志》 (Chinese Journal of Cancer Prevention and Treatment)
年 卷 期:2020年第27卷第11期
页 面:855-863页
学科分类:1002[医学-临床医学] 100214[医学-肿瘤学] 10[医学]
主 题:miR-181b 甲状腺癌 转录组测序 富集分析 SYK
摘 要:目的随着甲状腺癌发病率的提高,甲状腺癌的筛查与治疗受到了社会的关注。微小RNA在甲状腺肿瘤的发生和发展中发挥着重要作用。本研究旨在运用高通量测序技术和生物信息学技术来寻找与miR-181b相关的差异表达基因及信号通路并探讨其临床应用价值。方法选取甲状腺癌细胞BCPAP为研究对象,将miR-181b-5p的模拟物、空白模拟物和miR-181b-5p的抑制物及空白抑制物分别转染进BCPAP细胞,荧光定量PCR检测细胞miR-181b-5p的表达,高通量测序检测差异基因;用Cluster Profiles 3.0.5软件进行GO、KEGG及reactome富集分析。结果经验证转染成功后,通过测序检测,与转染空白模拟物的细胞相比,在转染miR-181b-5p模拟物的细胞中,有149个基因的表达量升高,fold change2,P2,P0.05。GO、KEGG及Reactome富集分析显示,下调的416个基因主要被富集在了白三烯生物合成、代谢等过程,并且差异有统计学意义,P0.05。通过蛋白印迹技术验证,miR-181b-5p模拟物中SYK蛋白表达较对照组明显减少,差异有统计学意义,P=0.002(n=3)。结论在甲状腺癌中,miR-181b高表达可能通过抑制抑癌基因SYK表达,促进甲状腺癌的发生和发展,为甲状腺癌潜在的诊断及治疗的靶点。