一株塞内卡病毒A全基因组序列测定与致病性分析

作     者：赖隆永 刘小龙 谭礼宁 叶盛聪 邱灵姗 陈盛勇 刘楚楚 徐磊 LAI Longyong;LIU Xiaolong;TAN Lining;YE Shengcong;QIU Lingshan;CHEN Shengyong;LIU Chuchu;XU Lei

作者机构：派生特(福州)生物科技有限公司福州350500 福建农业职业技术学院福州350303 

出 版 物：《畜牧兽医学报》 (ACTA VETERINARIA ET ZOOTECHNICA SINICA)

年 卷 期：2020年第51卷第4期

页      面：820-826页

核心收录：

学科分类：090601[农学-基础兽医学] 09[农学] 0906[农学-兽医学] 

基　　金：福建省科技计划项目(2019N0025) 2018年福建省中青年教师教育科研项目(职业院校专项)(JZ180531) 2018年福建省禽病防治重点实验室开放基金课题(KF201902) 福建农业职业技术学院福建省动物保健与食品安全应用技术协同创新中心项目(闽教科〔2017〕49号) 福建省畜禽疫病防控技术重大研发平台项目(2014N2003) 2019年度江苏省博士后科研资助计划(2019K072) 2019年度福州市科技计划项目(2019-G-34) 福建省高层次人才和青年优秀人才访学研修资助计划(闵人社文239号) 福建省职业院校专业带头人培养计划(闵教办师40号)。 

主　　题：塞内卡病毒A RT-PCR扩增 序列分析 遗传进化树 同源性 SVA-FJLY株 致病性 

摘      要：本研究旨在明确塞内卡病毒A(Senecavirus A,SVA)FJLY株的基因组特性及其与其他毒株的同源性关系,并了解SVA-FJLY株的致病性。以分离自福建省某养殖场中的一株SVA-FJLY株为研究对象,参照其原型毒株SVV-001(GenBank No.DQ641257.1)全基因组序列设计5对引物,通过RT-PCR扩增、测序、拼接,获得SVA-FJLY株全基因组序列并进行序列分析;并通过滴鼻攻毒3~4周龄仔猪。结果表明,SVA-FJLY株基因组全长7275 bp(不包括PolyA),SVA-FJLY株基因组存在一个多聚蛋白、VP1蛋白和VP2蛋白。SVA-FJLY株与参考毒株之间的基因组一级结构有较高的相似性,与HeB01-2017株(MF967574.1)相似性最高,达98.5%;而与SVA原型毒株SVV-001株(DQ641257.1)的相似性较低,为93.9%。SVA-FJLY株与国内几个毒株属于同一个分支,与国内的HeB01-2017株亲缘关系最近,同时与国外Colombia-2016株(KX857728.1)的亲缘关系最近。通过动物试验发现试验组猪攻毒10 d后,试验组2/3发病,对照组3/3正常,未出现仔猪死亡。通过全基因组序列测定获得了SVA-FJLY株全基因组序列并进行序列分析,明确SVA-FJLY株的基因组特性及其与其他毒株的相似性关系,了解了SVA-FJLY株的致病性,为SVA的反向遗传学和疫苗的研制提供参考依据,同时也丰富了SVA的基因组信息数据库。