PEDV N蛋白的原核表达纯化及B细胞抗原表位预测分析

作     者：郭富城 金丽 苏强 粟雨芯 李方琳 陈士恩 马晓霞 GUO Fucheng;JIN Li;SU Qiang;SU Yuxin;LI Fanglin;CHEN Shien;MA Xiaoxia

作者机构：西北民族大学生物医学研究中心甘肃兰州730030 西北民族大学生命科学与工程学院甘肃兰州730030 

出 版 物：《浙江农业学报》 (Acta Agriculturae Zhejiangensis)

年 卷 期：2020年第32卷第5期

页      面：762-769页

核心收录：

学科分类：0905[农学-畜牧学] 09[农学] 

基　　金：中央高校基本科研业务费(31920200073) 动物医学生物工程创新团队发展计划(IRT_17R88) 

主　　题：猪流行性腹泻病毒 N蛋白 纯化 二级结构 B细胞抗原表位预测 

摘      要：本研究旨在对猪流行性腹泻病毒(porcine epidemic diarrhea virus,PEDV)N基因进行克隆构建、表达与其B细胞抗原表位性质的预测。将PEDV的N基因进行PCR扩增,克隆到原核表达载体pET-28a(+)中,经酶切验证获得阳性克隆,将阳性克隆在表达菌*** BL21(DE3)中表达。通过对表达条件及纯化条件的优化,获得高纯度表达蛋白。利用生物信息同源模型化软件Swiss-Pdb Viewer建立PEDV-N蛋白的3D结构,并根据生物信息学软件DNA-Star预测PEDV-N蛋白的二级结构、抗原性、亲水性和表面可及性分析,综合分析预测其B细胞抗原表位。经预测PEDV-N蛋白氨基酸序列中存在13个B细胞优势抗原表位区域。研究结果将进一步为PEDV-N蛋白体外表达产物的应用及研制基因工程疫苗提供理论基础。