中国巴尔通体属系统发育多样性分析

作     者：龙露 陆家海 LONG Lu;LU Jia-hai

作者机构：中山大学公共卫生学院广东广州510080 

出 版 物：《热带医学杂志》 (Journal of Tropical Medicine)

年 卷 期：2020年第20卷第4期

页      面：455-459页

学科分类：0710[理学-生物学] 07[理学] 071007[理学-遗传学] 

基　　金：国家科技重大专项(2018ZX10101002-001-001) 广东省重点领域研发计划项目(2018B020241002) 广东省科技计划项目(2018B020207013) 

主　　题：巴尔通体属 系统发育多样性 gltA基因 中国 

摘      要：目的通过对中国范围内分布的巴尔通体进行系统发育多样性分析,了解我国巴尔通体分布种类情况,可为临床诊断提供参考。方法下载GenBank中2000-2019年公布的中国范围内的巴尔通体gltA基因序列,采用CLUSTAL X 2.0进行多序列比对确定变异体,再在NCBI中在线采用Blastn策略同源性搜索与各变异体相似性最高且是有效发表种的gltA基因序列,作为参考序列,然后利用MEGA 7.0进行系统发育分析,构建系统发育树。结果中国的巴尔通体大致可归为25个种类,其中有11个种类可对人类致病,分别为***、***、***、***、***、***、***、***、***、***、***;还有27个变异体可能是潜在的新种。云南、黑龙江、新疆巴尔通体种类最丰富。结论中国巴尔通体种类丰富,可致人类患病的种类也较多,还有一些潜在新种,尤以云南、黑龙江、新疆等地的多样性最高,可为一些不明原因疾病的诊断提供参考。