苹果茎尖组织中GA2ox基因的结构特征及蛋白序列的生物信息学分析

作     者：白牡丹 王彩虹 田义轲 陈宝印 刘云龙 BAI Mu-dan;WANG Cai-hong;TIAN Yi-ke;CHEN Bao-yin;LIU Yun-long

作者机构：青岛农业大学园林园艺学院山东青岛266109 

出 版 物：《华北农学报》 (Acta Agriculturae Boreali-Sinica)

年 卷 期：2012年第27卷第5期

页      面：55-59页

核心收录：

学科分类：0710[理学-生物学] 07[理学] 08[工学] 09[农学] 071007[理学-遗传学] 0901[农学-作物学] 0836[工学-生物工程] 090102[农学-作物遗传育种] 

基　　金：山东省良种工程项目 青岛市科技计划基础研究项目(11-2-4-5(4)-jch) 

主　　题：苹果 GA2ox 保守结构域 氨基酸同源性分析 氨基酸聚类分析 

摘      要：GA2ox是赤霉素合成代谢的关键酶,以苹果品种富士茎尖为供试材料,应用同源克隆技术克隆GA2ox基因,获得长度为1 656 bp的DNA序列和1 014 bp cDNA序列。对比分析表明,DNA序列存在3个外显子和2个内含子。GA2ox的开放性阅读框编码337个氨基酸残基,推断其相对分子量为37.679 8 kDa,等电点为6.41。蛋白质结构域检索表明,GA2ox属于依赖于2-酮戊二酸的双加氧酶家族成员;氨基酸同源性分析表明,GA2ox与已报道的其他植物的GA2ox氨基酸序列同源性为51%～97%;氨基酸聚类分析表明,苹果和梨首先聚类,其次是毛果杨。