基于吡咯烷与正丁烷类衍生物CCR5拮抗剂的药效团模型构建(英文)

作     者：孔韧 徐雪梅 陈慰祖 王存新 胡利明 KONG Ren;XU Xue-Mei;CHEN Wei-Zu;WANG Cun-Xin;HU Li-Ming

作者机构：北京工业大学生命科学与生物工程学院北京100022 

出 版 物：《物理化学学报》 (Acta Physico-Chimica Sinica)

年 卷 期：2007年第23卷第9期

页      面：1325-1331页

核心收录：

学科分类：1007[医学-药学(可授医学、理学学位)] 10[医学] 

基　　金：国家自然科学基金(30500429) 北京市教委(KZ20041000 5002,KM 20051000 5001,KM20061000 5029)资助项目 

主　　题：CCR5 HIV-1 药效团模型 基于配体的药物设计 

摘      要：吡咯烷与正丁烷类CCR5(化学趋化因子受体5)拮抗剂可通过抑制人类免疫缺陷病毒(HIV-1)包膜蛋白与CCR5的相互作用而阻断病毒进入细胞.本文使用已知拮抗剂结构和活性信息构建了一个三维药效团模型.按照Catalyst/HypoGen模块的要求,选择了25个结构和活性均具备差异性的分子作为药效团产生的训练集.其中训练集分子以IC_(50)值表示的生物活性值跨度为0.06到10000 nmol·L^(-1).最好的药效团模型(Hypo 1)由两个正离子化特征以及三个疏水特征组成,训练集预测相关系数为0.924,均方根偏差为1.068.模型用于预测由74个分子组成的测试集化合物活性,结果表明模型可以提供较好的活性预测结果并用于新的拮抗剂的设计.