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H7N2禽流感病毒CK/HB/1/02株NA全基因序列分析

Sequencing analysis of NA gene of H7N2 AIV CK/HB/1/02 strain

作     者:王传彬 孙明 金萍 王宏伟 遇秀玲 陈西钊 田克恭 WANG Chuan-bin;SUN Ming;JIN Ping;WANG Hong-wei;YU Xiu-ling;CHEN Xi-zhao;TIAN Ke-gong

作者机构:农业部兽医诊断中心北京100094 

出 版 物:《中国兽医学报》 (Chinese Journal of Veterinary Science)

年 卷 期:2007年第27卷第1期

页      面:31-34页

核心收录:

学科分类:0710[理学-生物学] 090601[农学-基础兽医学] 07[理学] 08[工学] 09[农学] 0906[农学-兽医学] 071007[理学-遗传学] 0901[农学-作物学] 0836[工学-生物工程] 090102[农学-作物遗传育种] 

主  题:禽流感病毒 H7N2亚型 NA基因 同源性 

摘      要:采用RT—PCR扩增了国内H7N2禽流感病毒(AIV)CK/HB/1/02分离株的完整神经氨酸酶(NA)基因节段,测定了其核苷酸序列,并与GenBank中AIVNA基因序列进行了同源性比较和氨基酸编码分析,绘制了NA基因的系统发育进化树。结果表明,AIVCK/HB/1/02分离株NA基因的完整序列长度为1467bp,包括5’-末端和3’-末端的非编码区,其最大阅读框(ORF)编码469个氨基酸,第61~65位氨基酸序列为-NITGI-。不同于国内H9N2AIV的特殊遗传标记。谊病毒NA基因的核苷酸序列与GenBank中人类流感病毒A/Leningrad/134/57(H2N2)的NA基因同源性最高,为93.3%;其次为香港的鸭源、人源、猪源H3N2病毒(89%~93%);而与我国北京、广东、香港和韩国的H9N2AIV以及芙国的H7N2AIV的同源性较低(85%~88%)。在N2基因系统发育进化树中。CK/HB/1/02分离株处于欧亚分支内,与H2N2人流感病毒的亲缘关系较近;与北美HTN2AIV处在不同分支,遗传距离较远。

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