河南省部分地区猪流行性腹泻病毒ORF3和N基因的克隆及其遗传进化分析

作     者：张云飞 袁一心 崔新格 李倩 魏战勇 ZHANG Yun-fei;YUAN Yi-xin;CUI Xin-ge;LI Qian;WEI Zhan-yong

作者机构：河南农业大学牧医工程学院河南郑州450002 河南省动物性食品安全重点实验室河南郑州450002 

出 版 物：《动物医学进展》 (Progress In Veterinary Medicine)

年 卷 期：2020年第41卷第2期

页      面：23-28页

学科分类：090603[农学-临床兽医学] 090601[农学-基础兽医学] 09[农学] 0906[农学-兽医学] 

基　　金：国家自然科学基金项目(3177131339) 

主　　题：猪流行性腹泻病毒 ORF3基因 N基因 遗传进化分析 

摘      要：为探究河南省猪流行性腹泻病毒部分毒株的遗传进化情况,采用RT-PCR对2017年2月至2018年1月在河南省部分地区猪场收集到的25份PEDV阳性病料进行ORF3和N基因的扩增,并对其进行克隆、序列比对及遗传进化分析。结果显示,PEDV毒株的ORF3基因序列是由675个核苷酸组成的,与经典毒株CV777之间核苷酸及氨基酸同源性分别为95.2%~97.5%和95.1%~96.9%。N基因之间的核苷酸与氨基酸同源性分别为96.2%~100%和93.8%~99.8%;与经典毒株CV777核苷酸与氨基酸的同源性分别为94.7%~95.8%和93.2%~96.8%。河南部分地区PEDV流行毒株与经典毒株CV777不在同一分支,说明猪场暴发猪流行性腹泻与免疫接种疫苗后依旧难以控制的原因,可能与大多数PEDV河南流行株发生变异有关。