基于转录组测序的谷红注射液抗脑缺血分析

作     者：周瑞 项昌培 高金环 张毅 张晶晶 杨洪军 ZHOU Rui;XIANG Chang-pei;GAO Jin-huan;ZHANG Yi;ZHANG Jing-jing;YANG Hong-jun

作者机构：云南中医药大学昆明650500 中国中医科学院中药研究所北京100700 

出 版 物：《中国实验方剂学杂志》 (Chinese Journal of Experimental Traditional Medical Formulae)

年 卷 期：2020年第26卷第7期

页      面：195-203页

核心收录：

学科分类：1008[医学-中药学(可授医学、理学学位)] 1006[医学-中西医结合] 100602[医学-中西医结合临床] 10[医学] 

基　　金：国家自然科学基金项目(81974550 81330086 81603422) 

主　　题：谷红注射液 脑缺血 RNA-Seq 丝裂原激活的蛋白激酶(MAPK) 

摘      要：目的:在确定谷红注射液保护脑缺血的基础上,采用RNA-Seq转录组测序与生物信息分析的方法探究谷红注射液抗脑缺血的分子机制。方法:采用线栓法制备大脑中动脉栓塞(MCAO)模型,设置假手术组,模型组,谷红注射液低、中剂量组(0.625,2.5 m L·kg^-1·d^-1),阳性药组(金纳多注射液,8 m L·kg^-1·d^-1),通过Ludmila Belayev 12分评分法进行药效学评价,并采用RNA-Seq技术检测药物干预前后的差异基因,使用DAVID,String及The Human Phenotype Ontology等数据库,进行富集分析、聚类分析、以及与脑缺血疾病靶标的关联分析,通过Cytoscape3.4.0构建相关的调控网络。结果:与假手术组相比,模型组大鼠可见明显神经功能缺损(P0.01);与模型组比较,谷红注射液高剂量组减轻了大鼠神经功能损伤(P0.05)。转录组数据分析表明谷红注射液主要是通过调控细胞凋亡,炎症反应,氧化应激,Toll样受体信号通路及丝裂原激活的蛋白激酶(MAPK)信号通路等生物学过程干预脑缺血。此外,谷红液射液干预脑缺血的差异基因关联到20个脑缺血疾病相关的靶标,且关联到64个MAPK信号通路相关的基因,其中23个基因参与凋亡与炎症等过程。结论:谷红注射液通过多条途径发挥抗脑缺血作用,其中MAPK信号通路是其发挥抗凋亡及炎症作用的重要途径。