基于16SrDNA测序技术分析重症肺炎患者肠道菌群的变化

作     者：张小亚 杨小娟 张振祺 雷萌萌 张小彬 王晓红 杨晓军 Zhang Xiaoya;Yang Xiaojuan;Zhang Zhenqi;Lei Mengmeng;Zhang Xiaobin;Wang Xiaohong;Yang Xiaojun

作者机构：宁夏医科大学总医院重症医学科银川750004 中国矿业大学银川学院750011 宁夏医科大学银川750004 

出 版 物：《中华危重病急救医学》 (Chinese Critical Care Medicine)

年 卷 期：2019年第31卷第12期

页      面：1479-1484页

核心收录：

学科分类：1002[医学-临床医学] 100201[医学-内科学(含：心血管病、血液病、呼吸系病、消化系病、内分泌与代谢病、肾病、风湿病、传染病)] 10[医学] 

基　　金：宁夏自然科学基金(2018AAC03151) 十三五国家重点研发计划项目(2016YFD0400605) 宁夏回族自治区教育厅科研项目(NGY2018-268) 

主　　题：重症肺炎 16SrDNA 肠道菌群 肠道微生态 菌群多样性 

摘      要：目的用16SrDNA测序技术分析重症肺炎患者肠道菌群变化的特征.方法采用前瞻性研究方法,收集2018年6月至12月住宁夏医科大学总医院重症医学科(ICU)16例重症肺炎患者入院2 d内自然排便或灌肠所得的粪便标本,以及10例健康体检者的粪便标本,采用16SrDNA测序技术对粪便菌群进行检测并进行生物学信息分析.结果①对重症肺炎患者和健康者粪便样本进行16SrDNA测序共得到1015475条有效序列,样本序列平均有效长度为458.35 bp,总样本平均序列条数为39056.73条.②肠道菌群α多样性分析显示,与健康对照组比较,重症肺炎组患者肠道菌丰度指数Ace指数、Chao指数及肠道菌群多样性指数Shannon指数显著下降〔Ace指数:167.23(143.14,211.26)比227.71(214.53,247.05),Chao指数:152.38(138.09,182.54)比228.25(215.49,248.95),Shannon指数:2.37(1.68,2.89)比3.39(3.03,3.63),均P0.05〕;而致病菌梭杆菌属、葡萄球菌属比例较健康对照组明显升高〔0.01(0.01,0.08)%比0.01(0.01,0.01)%,0.01(0.01,0.02)%比0.01(0.01,0.01)%,均P0.05〕.结论重症肺炎患者肠道菌群发生紊乱,表现为丰度及多样性下降,菌群群落结构发生改变,有益共生菌属减少,致病菌属增多,可能与重症肺炎疾病的发生发展有关.