基于基因芯片整合分析筛选及验证BeWo细胞合体化相关调控因子

作     者：顾珺巍 丁裕斌 付利娟 王永恒 王应雄 刘太行 Gu Junwei;Ding Yubin;Fu Lijuan;Wang Yongheng;Wang Yingxiong;Liu Taihang

作者机构：重庆医科大学公共卫生与管理学院生殖生物学实验室教育部生殖与发育国际合作联合实验室 

出 版 物：《重庆医科大学学报》 (Journal of Chongqing Medical University)

年 卷 期：2019年第44卷第8期

页      面：1041-1048页

学科分类：1002[医学-临床医学] 100211[医学-妇产科学] 10[医学] 

基　　金：国家自然科学基金资助项目（编号：81801458） 中国博士后科学基金资助项目（编号：2018M633328） 

主　　题：BeWo 合体化 基因芯片 生物信息 

摘      要：目的:合体滋养层细胞(syncytiotrophoblast,STB)是一类多核化上皮细胞位于人类胎盘最外层,由单核滋养细胞(cytotrophoblast,CTB)分化、融合而来,肩负妊娠维持关键激素的分泌和母胎间营养交换的重要职责,也是母胎屏障重要组成部分之一。然而,目前关于胎盘滋养细胞的合体化过程的调控机制仍不明确。本研究即利用生物信息学的方法筛选并初步验证潜在调控绒毛膜癌BeWo细胞合体化调控的关键基因。方法:从GEO数据库检索并下载BeWo细胞合体化前后的基因芯片数据集,并利用生物信息学分析方法对所有相关数据集进行综合分析,筛选出差异表达基因并进行GO及KEGG聚类分析,进一步通过PPI蛋白互作网络寻找节点基因,最后利用qRT-PCR验证候选基因在合体化前后的差异表达。结果:从2组数据中共筛选出137个差异表达基因,其中25个差异基因为2组数据集共有,参与细胞迁移、细胞黏附、激素代谢、MAPK信号通路等。进一步借助蛋白质互作网络分析,得到3个候选基因并通过qRT-PCR验证,结果与信息分析结果一致。结论:本研究为滋养细胞合体化研究提供了潜在靶基因,也为解析其分子调控机制提供了线索。