豹属线粒体基因组分析

作     者：魏磊 吴孝兵 诸立新 蒋志刚 

作者机构：安徽师范大学生命科学学院重要生物资源保护与利用安徽省重点实验室芜湖241000 宿州职业技术学院宿州234000 滁州学院化学与生命科学系滁州239000 中国科学院动物研究所动物生态与保护生物学实验室北京100080 

出 版 物：《中国科学：生命科学》 (Scientia Sinica(Vitae))

年 卷 期：2011年第41卷第9期

页      面：699-713页

核心收录：

学科分类：0710[理学-生物学] 07[理学] 071007[理学-遗传学] 

基　　金：国家自然科学基金(批准号:30470244和30870359) 安徽省优秀青年基金(批准号:04043409) 安徽省教育厅自然科学基金(批准号:KJ2009B015) 重要生物资源保护与利用安徽省重点实验室资助项目 

主　　题：雪豹 豹 虎 线粒体全序列 系统发育 分歧时间 

摘      要：采用PCR扩增方法,测定了虎、豹和雪豹线粒体基因组全序列,长度分别为16990,16964和16773bp.每个线粒体基因组包括:13个蛋白编码基因,22个tRNA,2个rRNA,一个非编码的控制区(D-loop)以及一个轻链复制起点(OLR),其基因组结构与家猫、美洲狮和云豹具有较高的相似性.基于两组线粒体合并序列和线粒体全序列,采用最大简约法、最大似然法及贝叶斯法(Bayesian)推测豹属的分子系统关系.结果显示,豹属(Panthera)由虎、豹、雪豹、美洲虎、狮和云豹组成,云豹并归于豹属.属内物种间的系统关系为:云豹(虎(美洲虎(豹(狮,雪豹)))).基于ML最优树的枝长和4个可靠的分歧时间校正点进行了分歧时间的估算,豹属约在11.3百万年前(MYA)从猫科动物中分化出来;云豹、虎、雪豹和豹的分化时间分别为8.66,6.55,4.63和4.35MYA,比化石时间略早.尤其是雪豹这一青藏高原的特有物种,其分歧事件、演化过程、物种形成和分布模式与发生在8,3.6,2.5和1.7MYA晚新生代青藏高原的地质构造事件及气候重大转型期呈现相关性.