锌指结构域序列的进化生成模拟——遗传算法在蛋白质结构研究中的应用

作     者：孙之荣 韩浩 

作者机构：清华大学生物科学与技术系生物膜与膜工程国家重点实验室北京100084 

出 版 物：《科学通报》 (Chinese Science Bulletin)

年 卷 期：1997年第42卷第17期

页      面：1871-1874页

核心收录：

学科分类：0710[理学-生物学] 071010[理学-生物化学与分子生物学] 081704[工学-应用化学] 07[理学] 08[工学] 0817[工学-化学工程与技术] 070102[理学-计算数学] 0701[理学-数学] 

主　　题：遗传算法 锌指结构域 进化模拟 蛋白质结构 

摘      要：遗传算法(Genetic algorithms, GA)是具有高频率的搜索机制的算法.遗传算法不仅为蛋白质结构研究提供了一种全局自适应搜索算法,使能量最低状态(按热力学假说,蛋白质的天然状态的能量最低)的搜索更加方便,而且为我们提供了一种新的想法和研究思路.通过应用遗传算法对锌指结构域序列进行进化模拟,成功地从随机产生的氨基酸序列中,进化生成了一些潜在的锌指结构域序列,不仅在一定意义上证明了氨基酸序列起源的随机性,而且对遗传算法在大规模解空间的搜索能力进行了测试.