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基于SSR标记构建宝巾花品种的分子指纹

Using the SSR fluorescent labling to establish SSR fingerprint for 131 cultivars in Bougainvillea (Nyctaginaceae)

作     者:孙利娜 周群 黄妹平 周长品 徐世松 杨舒婷 杜铃 甘四明 唐庆 SUN Lina;ZHOU Qun;HUANG Meiping;ZHU Changpin;XU Shisong;YANG Shuting;DU Ling;GAN Siming;TANG Qing

作者机构:中国林业科学研究院热带林业研究所热带林业研究国家林业局重点实验室广东广州510520 广西壮族自治区林业科学研究院广西优良用材林资源培育重点实验室中南速生材繁育国家林业局重点实验室广西南宁530002 厦门市园林植物园福建厦门361003 中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所海南儋州571737 

出 版 物:《南京林业大学学报(自然科学版)》 (Journal of Nanjing Forestry University:Natural Sciences Edition)

年 卷 期:2019年第43卷第6期

页      面:60-66页

核心收录:

学科分类:0710[理学-生物学] 090701[农学-林木遗传育种] 090706[农学-园林植物与观赏园艺] 0907[农学-林学] 07[理学] 09[农学] 071007[理学-遗传学] 

基  金:广西科技计划项目(桂科AD17129021) “广西主要用材林资源高效培育与利用人才小高地”专项(桂财社函112号) 

主  题:宝巾花 品种分类 SSR标记 指纹图谱 亲缘关系 

摘      要:【目的】针对宝巾花(Bougainvillea)品种繁多、同物异名和同名异物多有发生的现象,利用可靠的分子标记技术进行品种的有效分类。【方法】基于15个简单重复序列(SSR)位点,利用荧光标记的引物对131个宝巾花品种进行PCR扩增,扩增产物经毛细管电泳检测,分析品种多样性和遗传距离,并构建品种聚类图和指纹图谱。【结果】15个SSR位点共扩增出85个等位基因,平均每个位点的等位片段数5.60个,Shannon’s信息指数、观测杂合度和期望杂合度的变化范围分别为0.38~1.53、0.11~0.94和0.16~0.73,平均值分别为1.04、0.50和0.57,位点的多态性信息量介于0.15~0.69之间,平均0.51。宝巾花品种的遗传距离为0.00~0.65,平均0.33;聚类分析表明,同一种的品种大多数聚在一类,但同一个种仍有品种未聚在一类或亚类,也有多个种的品种聚在一类;有多对品种存在同物异名或同名异物的现象;基于11个位点可有效鉴别131个品种,建立了各品种的分子指纹图谱。【结论】对同物异名或同名异物的品种,需要进一步确认品种中文名或拉丁名;基于SSR标记的宝巾花品种的指纹图谱为宝巾花品种登记、注册和知识产权保护提供了可靠技术,也为品种鉴定提供了有效手段。

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