大肠杆菌二氢硫辛酸转乙酰基酶的外周亚基结合结构域的溶液构象
Soluble Conformation of Peripheral Subunit-binding Domain of E. coli Dihydrolipoyl Transacetylase作者机构:西北农林科技大学理学院陕西杨凌712100 西北农林科技大学生命科学学院陕西杨凌712100
出 版 物:《中国生物化学与分子生物学报》 (Chinese Journal of Biochemistry and Molecular Biology)
年 卷 期:2015年第31卷第6期
页 面:624-629页
核心收录:
学科分类:0710[理学-生物学] 071010[理学-生物化学与分子生物学] 081704[工学-应用化学] 07[理学] 08[工学] 0817[工学-化学工程与技术] 09[农学] 071007[理学-遗传学] 0901[农学-作物学] 0836[工学-生物工程] 090102[农学-作物遗传育种]
基 金:西北农林科技大学引进人才专项(No.Z111021101) 国家自然科学基金(No.21403168)~~
主 题:二氢硫辛酸乙酰基转移酶 外周结合结构域 圆二色谱 构象 动态光散射
摘 要:丙酮酸脱氢酶复合体催化丙酮酸氧化脱羧,生成乙酰辅酶A.该复合体由丙酮酸脱羧酶(E1)、二氢硫辛酸乙酰转移酶(E2)和二氢硫辛酸脱氢酶(E3)三种酶组成.大肠杆菌E2的外周亚基结合结构域(peripheral subunit-binding domain,PSBD)结合E1和E3,对丙酮酸脱氢酶复合物的结构和功能有重要作用.本研究采用PCR技术扩增了E2的PSBD的48个氨基酸残基区域编码序列(c DNA),构建p ET-32a-pp-Psbd表达载体,测序正确后转入BL21(DE3)中表达,目的蛋白质用镍柱和Hi Trap SP柱纯化后达到电泳纯,质谱鉴定纯化后蛋白质分子量与理论值符合.pull-down结果表明,PSBD可分别与E1和E3结合.圆二色谱表征PSBD的二级结构主要为a-螺旋,当在0.5mol/L Na Cl的离子强度下,55.7%的PSBD分子折叠为正确的构象.动态光散射实验发现,PSBD分子有3种不同的构象存在形式,因此,PSBD非常容易从折叠态转化为不和E1、E3结合的无规卷曲态,这种构象的相互转化为其功能性与E1、E3结合及解离提供了结构基础.