不同产地瓠瓜品种ITS序列的遗传多样性分析

作     者：赵芹 谢大森 彭庆务 罗少波 郭巨先 邓沙沙 ZHAO Qin;XIE Dasen;PENG Qingwu;LUO Shaobo;GUO Juxian;DENG Shasha

作者机构：广东省农业科学院蔬菜研究所广东广州510640 

出 版 物：《植物资源与环境学报》 (Journal of Plant Resources and Environment)

年 卷 期：2014年第23卷第3期

页      面：24-35页

核心收录：

学科分类：0710[理学-生物学] 071001[理学-植物学] 0830[工学-环境科学与工程（可授工学、理学、农学学位）] 1002[医学-临床医学] 1001[医学-基础医学(可授医学、理学学位)] 07[理学] 09[农学] 0901[农学-作物学] 0902[农学-园艺学] 0713[理学-生态学] 090202[农学-蔬菜学] 

基　　金：广东省自然科学基金博士科研启动基金资助项目(10451064001006063) 广东省农业科学院院长基金资助项目(201007) 

主　　题：瓠瓜 ITS序列 变异位点 同源性 遗传分化 系统发育 

摘      要：对国产29个瓠瓜也Lagenariasiceraria（Molina）Standl.页品种的ITS序列进行了扩增及测序,并结合引自GenBank的国产9个瓠瓜品种以及国外6个瓠瓜品种和3个同属种类的ITS序列,对它们的ITS序列长度和GC含量以及变异位点进行比较,在此基础上构建系统发育树并对47个样本间的遗传关系进行研究。结果显示：供试47个样本的ITS序列均由ITS1、5.8SrDNA及ITS2组成,各样本间的ITS序列长度、GC含量以及变异位点差异明显。国产38个瓠瓜品种的ITS序列（包括ITS1、5.8SrDNA及ITS2）长度为619-627bp、GC含量为58.00%-63.32%；国外9个样本的ITS序列长度为591-626bp,GC含量为54.17%-63.26%。序列比对结果显示：国产38个瓠瓜品种的ITS序列同源率为84.6%-100.0%,包含221个变异位点；其中,来源于山东的品种‘砧木2’（‘ZhenmuNo.2’）的ITS序列包含的变异位点最多,与其他品种间的同源率也最低。在系统发育树上,国产38个瓠瓜品种可分为3个分支,来源于山东的品种‘砧木2’和来源于河南的品种‘西瓜砧木1’（‘XiguazhenmuNo.1’）各自聚为第1和第2分支；其余36个品种聚为第3分支。而供试的47个样本则可分为2个分支和5个亚组,第1分支可分为2个亚组,包括国产品种‘砧木2’和产自日本的2个品种；第2分支包含的44个样本则进一步分为3个亚组,国产品种‘西瓜砧木1’和产自法国的品种‘白花瓠瓜’（‘White-floweredgourd’）各自聚为第1和第2亚组,其余的42个样本聚为第3亚组。研究结果表明：供试的不同产地瓠瓜品种间存在丰富的遗传变异和地理分化现象,其ITS序列差异与地理分布有一定关系。