建兰胶孢炭疽菌ITS序列分析及其PCR快速检测
Sequence analysis of ITS and PCR rapid-detection of Colletotrichum gloeosporioides from Cymbidium ensifolium作者机构:福建省农业科学院植物保护研究所福州350013
出 版 物:《植物保护学报》 (Journal of Plant Protection)
年 卷 期:2013年第40卷第3期
页 面:249-254页
核心收录:
学科分类:09[农学] 0904[农学-植物保护] 090401[农学-植物病理学] 090402[农学-农业昆虫与害虫防治]
基 金:福建省科技重大专项(2010NZ0003-2) 福建省属公益类科研院所基本科研专项计划项目(2010R1026-4 2011R1026-7)
摘 要:由胶孢炭疽菌Colletotrichum gloeosporioides引起的炭疽病是建兰的重要病害。为建立快速检测该病原菌的方法,以ITS1/ITS4为引物,对15个建兰胶孢炭疽菌的ITS进行PCR扩增及测序,将测定的序列与炭疽菌属其它种的ITS序列进行比对分析,设计特异性引物CF1/CR1,并通过常规和巢式PCR对建兰胶孢炭疽菌进行检测。结果显示,15个菌株中有13个菌株ITS序列与该菌的模式种序列相似性高达99%以上,而另外2个菌株相似性则为86%;供试菌株在系统发育树上聚为2个不同的分支;引物CF1/CR1通过常规PCR可从1 ng的建兰胶孢炭疽菌基因组DNA中扩增到目的条带,而利用引物ITS1/ITS4和CF1/CR1通过巢式PCR可从1 pg的基因组DNA中扩增到目的条带,即巢式PCR反应检测灵敏度较常规PCR至少高1000倍。研究表明建立的巢式PCR法可从自然感病的建兰叶片组织中检测到胶孢炭疽菌。