水牛LGALS3BP基因克隆及序列分析

作     者：朱鹏 庞春英 段安琴 邓廷贤 陆杏蓉 梁贤威 Zhu Peng;Pang Chunying;Duan Anqin;Deng Tingxian;Lu Xingrong;Liang Xianwei

作者机构：中国农业科学院广西水牛研究所广西水牛遗传繁育重点实验室南宁530001 

出 版 物：《基因组学与应用生物学》 (Genomics and Applied Biology)

年 卷 期：2016年第35卷第3期

页      面：535-541页

核心收录：

学科分类：0905[农学-畜牧学] 09[农学] 

基　　金：农业部转基因重点项目2014ZX0801012B 桂科合14123001-5 水牛基1504005共同资助 

主　　题：水牛 LGALS3BP 克隆分析 

摘      要：为了阐明水牛半乳糖凝集素3结合蛋白(lectin,galactoside-binding,soluble,3 binding protein,LGALS3BP)基因的结构及功能,本试验采用了3 RACE克隆获得LGALS3BP基因并对其进行了信息学分析。结果表明:水牛LGALS3BP基因编码区长1 668 bp,3 UTR区长590 bp,编码555个氨基酸。BLAST程序比对结果表明克隆获得的LGALS3BP序列与人、非洲象、猫、马、猪、绵羊和牛的同源性分别为82%、82%、84%、83%、94%、94%和97%,系统进化树分析结果表明,LGALS3BP基因在不同物种以及进化的过程中具有高度保守性。蛋白质分析结果表明LGALS3BP蛋白呈弱酸性,第18~19位氨基酸为其蛋白信号肽剪切区域,亚定位于细胞外,存在SR,BACK和BTB等结构域。micro RNA预测显示bta-mi R-2316,bta-mi R-484和btami R-2888等可能为LGALS3BP 3 非翻译区(untranslated region,UTR)潜在靶标。总之,本研究成功克隆获得了水牛LGALS3BP基因并对其进行了系统的信息学分析。