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高毒力艰难梭菌的基因型和毒力相关基因检测

Detection of genotype and toxin associated gene of hypervirulent Clostridium difficile clinical isolates

作     者:肖克林 金萍 黄丽清 梁霞 周天祥 王中兴 王秦宁 孔繁荣 Xiao Kelin;Jin Ping;Huang Liqing;Liang Xia;Zhou Tianxiang;Wang Zhongxing;Wang Qinning;Kong Fanrong

作者机构:深圳市宝安区妇幼保健院中心实验室广东深圳518133 深圳市宝安区妇幼保健院儿科ICU广东深圳518133 深圳市宝安区妇幼保健院检验科广东深圳518133 深圳市宝安区妇幼保健院药剂科广东深圳518133 悉尼大学韦德特米德医院感染性疾病和微生物中心 

出 版 物:《国际检验医学杂志》 (International Journal of Laboratory Medicine)

年 卷 期:2015年第36卷第8期

页      面:1021-1025页

学科分类:100208[医学-临床检验诊断学] 1002[医学-临床医学] 10[医学] 

基  金:深圳市宝安区科技计划项目(2013071 2014083) 

主  题:艰难梭菌 基于荧光毛细管电泳的PCR-核糖体分型 毒素A、B 二元毒素 毒素调节基因 

摘      要:目的鉴定莫西沙星耐药的艰难梭菌临床菌株的基因型和毒素相关基因的携带情况。方法 22株莫西沙星耐药的艰难梭菌临床菌株收集自澳大利亚悉尼地区,利用基于荧光毛细管电泳的聚合酶链反应(PCR)-核糖体分型技术对其进行基因分型;利用PCR方法检测其毒素A、B编码基因tcdA、tcdB和二元毒素编码基因cdtA、cdtB;利用PCR-基因测序方法检测毒素调节基因tcdC的基因序列,通过与参考菌株VPI 10463(Genbank收录号:X92982)比对了解其基因突变情况,通过与Genbank中的序列比对确定其序列型。结果 21株菌株为高毒力核糖体型027(RT027),另1株为RT078;22株菌株毒力编码基因均为tcdA+tcdB+cdtA+cdtB+;21株RT027 tcdC序列型为sc1,另1株RT078序列型为WA39,与参考株VPI 10463比较,RT027菌株tcdC序列均出现连续18个核苷酸(nt330-347)的缺失和第117位单核苷酸的缺失,RT078菌株则出现连续39个核苷酸(nt341-379)的缺失和第184位(CT)的突变。结论高毒力RT027是最常见的莫西沙星耐药的艰难梭菌基因型;高毒力RT027和RT078均携带毒素A、B和二元毒素编码基因,且毒素调节基因tcdC均存在基因突变。

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