基于nrDNA ITS序列的不同产地白及遗传多样性研究

作     者：任风鸣 白娟 刘艳 曹厚强 王庆国 李生强 Ren Fengming;Bai Juan;Liu Yan;Cao Houqiang;Wang Qingguo;Li Shengqiang

作者机构：重庆市药物种植研究所重庆408435 重庆市中药良种选育与评价工程技术中心重庆408435 重庆市渝北区经济作物技术推广站重庆401120 重庆市渝北区洛碛镇农业服务中心重庆401137 重庆市渝北区兴隆镇农业服务中心重庆401137 

出 版 物：《世界科学技术-中医药现代化》 (Modernization of Traditional Chinese Medicine and Materia Medica-World Science and Technology)

年 卷 期：2019年第21卷第6期

页      面：1189-1195页

学科分类：1008[医学-中药学(可授医学、理学学位)] 1006[医学-中西医结合] 100602[医学-中西医结合临床] 10[医学] 

基　　金：重庆市科委青年科技人才培养计划项目(cstc2014kjrc-qnrc10003):濒危中药白及种子直播萌发剂的开发和快速成苗技术体系构建,负责人:任风鸣 重庆市卫计委中医药科技项目(2Y201402128):白及种质资源收集与分子鉴定,负责人:任风鸣 

主　　题：白及 遗传多样性 内源转录间隔区(ITS) 道地性 

摘      要：目的开展不同产地白及遗传多样性研究,为优良品种选育及其资源保护提供依据。方法采用nrDNA内源转录间隔区(ITS)序列分析35份不同产地白及(白及22份,黄花白及9份,小白及4份)遗传多样性。结果白及种内遗传距离为0.0163(0-0.0337),种间遗传距离为0.0371(0.0311-0.0441);产地内遗传距离为0.0033(0-0.0077),产地间遗传距离为0.0169(0.0016-0.0301)。聚类分析显示,22份不同产地白及样品聚为3个主要的分支,来自同一产地或相邻产地的样品倾向于聚为一支,地理分布越近,亲缘关系往往越近。变异位点分析显示,22份不同产地白及在613个碱基的比对长度内含有44个变异位点,来自安徽的样品分别在第321、350、410位碱基处具有稳定的单碱基变异,来自浙江的样品在129、154、188、451、454处有5个单碱基变异,在432、433、434处有3个碱基的连续突变。结论ITS序列可以用于白及的遗传多样性分析,不同产地白及亲缘关系与地理分布具有一定相关性,但采用ITS序列不能严格地将不同产地白及样品区分开。通过变异位点分析,能有效鉴定安徽产和浙江产白及。